科研产出
基于不同靶基因的3种住肉孢子虫PCR检测方法比较
《动物医学进展 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为筛选敏感、特异的住肉孢子虫(Sarcocystis spp.)PCR检测方法,对以住肉孢子虫18S rRNA、28S rRNA和线粒体细胞色素C氧化酶I基因(cox 1)的部分片段为靶基因设计的3套引物建立的PCR方法进行敏感性和特异性试验,并对田间采集的100份牛源和猪源肌肉样品进行检测.结果显示,以18S rRNA和28S rRNA为靶基因的PCR检测方法的敏感性相似,DNA最小检出量均为1×10-2 ng/μL;而以cox 1为靶基因的PCR检测方法敏感性相对较低,DNA的最低检出量为1 ng/μL.对7种不同寄生虫DNA进行特异性试验,结果以cox 1基因为靶基因的PCR方法特异性较好,仅能够扩增出枯氏住肉孢子虫(Sarcocystis cruzi)DNA;以18S rRNA为靶基因的PCR法,除枯氏住肉孢子虫外,刚地弓形虫和微小隐孢子虫也有相似扩增条带;以28S rRNA为靶基因的PCR法,除枯氏住肉孢子虫外,刚地弓形虫、微小隐孢子虫和欧猥迭宫绦虫DNA也能扩增出杂带,但大小不符.利用3种方法对100份牦牛和猪肉样品进行扩增,发现以18S rRNA、28S rRNA和cox 1为靶基因的PCR法的阳性率分别为36.00%(36/100)、43.00%(43/100)和38.00%(38/100).结果表明,以cox 1为靶基因的PCR法有良好的特异性,适合用于田间动物肌肉样品中住肉孢子虫的检测,为开展动物住肉孢子虫病分子流行病学及防控研究提供了依据.
关键词： 18S rRNA基因 28S rRNA基因 cox1基因 PCR方法 住肉孢子虫
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基于线粒体ATP6及Cytb基因多态性研究藏山羊高原适应性
《畜牧兽医学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了探究藏山羊ATP6和Cytb是否具有潜在的高海拔适应性突变,本研究利用藏山羊(n=157,来自西藏地区的8个群体,海拔高度>3500 m)与低海拔山羊(n=104,来自欧亚大陆50个群体,海拔高度<1000 m)两组261条A T P6和C y tb序列,对核苷酸组成、遗传多样性、单倍型网络以及基因突变对蛋白结构域功能影响进行比较分析.结果,在A TP6和Cytb中分别鉴定出33和67个单核苷酸多态性位点(SNPs),其中错义突变均为6个.值得注意的是,A TP6 m.8102A>G(Ile→Met;P=0.0006)和Cytb m.14794A>G(Thr→Ala;P=0.0077)是低海拔山羊群体特有的错义突变,由此形成的单倍体H27和Ha36与高原适应性呈显著负相关(H27,P=0.0070;Ha36,P=0.0123).进一步分析推测,这两个突变阻碍了质子跨膜的正常功能,并影响了质子或电子在OXPHOS中的转移,从而导致了低海拔山羊和藏山羊之间呼吸作用效率的差异.本研究通过对线粒体ATP6和Cytb基因编码区多态性到功能的相关分析,初步推测了藏山羊高海拔低氧适应性机制,为高原适应性相关研究提供了一定的见解.
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西藏绒山羊KAP7.1和KAP8.2基因多态性及其对部分生产性状的影响
《畜牧与兽医 》 2020 北大核心
摘要：为分析西藏绒山羊角蛋白关联蛋白(KAP)7.1基因和8.2基因与生产性状的关系,采用PCR-SSCP和DNA测序技术对340只西藏绒山羊KAP7.1基因和KAP8.2基因编码区序列进行多态性分析,并与体长、体高、胸围、产绒量、羊绒长度、羊毛长度等生产性状进行关联分析。结果显示:PCR-SSCP检测发现KAP7.1基因只有1种带型,KAP8.2基因有6种带型;KAP7.1基因扩增产物序列中未发现碱基变化;KAP8.2基因扩增产物序列中存在5个SNPs位点,分别为C115T、A207G、A214G、G216A和A278T,除了A278T外都位于编码区;对KAP8.2基因的基因型1、基因型2和基因型3与生产性能进行关联分析发现,基因型1个体的胸深和产绒量显著高于基因型3个体(P<0.05)。结果表明:KAP8.2基因可作为影响西藏绒山羊胸深和产绒量的分子辅助选择标记。
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仲巴牦牛产肉性能及肉营养指标分析
《中国畜牧杂志 》 2020 北大核心
摘要：本实验旨在探究仲巴牦牛的产肉性能及肉营养功能成分,随机选取10头健康的成年仲巴牦牛(3.5~5周岁,体重为183.59~347.63 kg),雌雄各半,进行屠宰试验及主要肉营养功能成分指标分析.结果 显示:雄性仲巴牦牛的体重及各项体尺指标均显著优于雌性个体.从屠宰性能来看,公牦牛屠宰率为53.55%、净肉率为45.08%、胴体率为84.17%、肉骨比为(4.10±0.81)%、眼肌面积为52.20 cm2,母牦牛屠宰率为47.21%、净肉率为39.11%、胴体率为82.85%、肉骨比为(4.30±1.00)%、眼肌面积为35.80 cm2.鲜肉营养组成物质功能成分分析显示,仲巴牦牛肉富含维生素E以及钙、铁、硒等多种微量元素,且性别间无显著差异.另外,该品种鲜肉中氨基酸比例以及多种不饱和脂肪酸比例适当,是一种优质的高蛋白质肉类食品.因此,本研究结果不仅暗示仲巴牦牛具有良好的屠宰性能且具备优质牛肉的生产潜力,同时为今后该品种资源开发与利用提供了科学支撑.
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西藏双须叶须鱼八种年龄鉴定材料的比较研究
《水生生物学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：用微耳石、星耳石、脊椎骨、鳃盖骨、臀鳞、胸鳞、侧线鳞和背鳞等8种年龄鉴定材料识别和鉴定西藏双须叶须鱼的年龄特征并进行比较分析,以确定适宜的年龄鉴定材料.结果显示:臀鳞形态特化严重,胸鳞、侧线鳞、背鳞的年轮特征不明显,与微耳石比较的平均百分比误差(IAPE)分别为41.63%、51.26%、50.50%和51.26%,其他4种年龄材料与微耳石比较的IAPE相差不大,依次为:星耳石(12.28%)、脊椎骨(15.67%)、鳃盖骨(17.81%);低于23龄时,微耳石鉴定的平均年龄与耳石和脊椎骨鉴定的平均年龄较为接近(P>0.05),分别为14.39龄、13.13龄和13.20龄,显著高于鳃盖骨和4种鳞片(P<0.05);高于23龄时, 7种年龄鉴定材料都显著低于微耳石所鉴定的平均年龄(P<0.05).用微耳石鉴定所得的最大年龄为49龄,星耳石鉴定所得的最大年龄为35龄,脊椎骨鉴定所得最大年龄为34龄,鳃盖骨为34龄,臀鳞为22龄,胸鳞为19龄,侧线鳞为16龄,背鳞为17龄.微耳石年龄鉴定的年龄读数与体长呈极显著的对数函数关系(P<0.01).综合分析认为,微耳石最适宜作为双须叶须鱼的年龄鉴定材料.
关键词： 双须叶须鱼 微耳石 星耳石 脊椎骨 鳃盖骨 鳞片 年龄鉴定
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西藏牦牛MyoD1基因多态性及与生长性状的关联性分析
《西南农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】本研究旨在对西藏牦牛MyoD1基因多态性与体高、体重、体斜长、胸围和管围等生长性状进行关联性分析,以期获得对牦牛重要经济性状具有显著效应的遗传标记。【方法】本研究利用DNA池直接测序、PCR-RFLP与生物信息学技术,对西藏帕里(PL)、斯布(SB)、申扎(SZ)和类乌齐(LWQ)4个牦牛类群(品种)共148头个体的MyoD1基因内含子2及外显子3部分序列进行遗传多态性分析,统计基因和基因型频率,进行Hardy-Weinberg平衡性检测,计算纯合度、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数等遗传多态指标,分析不同基因型与体高、体重、体斜长、胸围和管围等生长性状的关联性。【结果】①西藏牦牛MyoD1基因外显子3上存在(C1710T)XmaI酶切位点,多态性检测均存在CC、CT和TT 3种基因型,T/C频率分别为:0.308/0.692、0.400/0.600、0.605/0.395和0.527/0.473,处于中度多态。②适合性检验表明,西藏4个牦牛类群MyoD1基因多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。③利用最小二乘拟合线性模型,对各标记基因型生长发育指标(体高、体斜长、胸围、管围和体重)进行差异显著性检验,申扎牦牛该位点TT和CT基因型在生长性状上差异显著(P<0.05),CT基因型胸围均高于CC和TT基因型。【结论】可以将MyoD1上的C1710T基因座作为牦牛经济性状选育的一个重要遗传标记,用于育种改良。
关键词： 西藏牦牛 MyoD1基因 PCR-RFLP 生长性状 关联分析
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牦牛MDHI基因的克隆及组织表达分析
《生物技术通报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：苹果酸脱氢酶具有氧化还原活性,主要控制动物机体的能量代谢。旨在克隆牦牛MDHI基因,结合生物信息学和组织表达分析,为研究牦牛MDHI基因的理化性质及功能奠定基础。结果显示,该基因的cDNA序列长1 169 bp,CDS区全长1 005 bp,编码334个氨基酸,编码的蛋白为亲水性稳定蛋白;属于保守结构域家族;有两个跨膜区,分别是6-22位和34-54位;存在26个磷酸化位点,其中有11个Ser磷酸化位点、11个Thr磷酸化位点、4个Tyr磷酸化位点;二级结构主要由α-螺旋(152个,占45.51%),无规卷曲(110个,占32.93%)组成;三级结构与猪细胞质苹果酸脱氢酶、α-酮丙二酸和四氢NAD的三元复合物的晶体结构具有98.50%的相似性;亚细胞定位分析得到在内质网中分布最多,在高尔基体和细胞核中分布最少;同源性及系统进化树分析表明牦牛该基因与普通牛的同源性最高,推测牦牛MDHI基因在进化水平上较为保守;组织表达分析表明该基因在臀脂中表达量最高,在臀肌中表达量较低,说明该基因参与机体脂肪沉积的调控。成功克隆了MDHI基因CDS区、并进行了生物信息学及组织表达分析。
关键词： 牦牛 MDHI基因 克隆 生物信息学分析 组织表达
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西藏部分山羊群体线粒体DNA D-loop区遗传多样性及系统进化分析
《畜牧与兽医 》 2019 北大核心
摘要：为了探究西藏不同山羊群体的遗传多样性和亲缘关系,提取4个山羊群体DNA,扩增其mtDNA D-loop区,并测序。结果显示:西藏山羊群体mtDNA D-loop区长度在1 200～1 212 bp,各群体山羊D-loop区富含A、T碱基,共发现106个多态位点,分离出21个单倍型。西藏山羊群体单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.085 7～1.000 0,0.007 04～0.019 14,4个群体山羊碱基突变率高,表明西藏山羊的遗传多样性非常丰富。核苷酸歧义度、NJ系统进化树表明西藏山羊群体间有共同母系血源,部分支系母系起源于镰刀型角野山羊(Capra aegagrus)和捻角山羊(Capra falconeri),同时存在其他的母系起源,支持山羊品种内的多起源说。
关键词： 藏山羊 mtDNA D-loop 遗传多样性 系统进化树
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