科研产出
基于mtDNA COX3基因对西藏特色牦牛群体遗传结构的分析
《草业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为探究西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系，本研究利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、类乌齐牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、桑日牦牛、江达牦牛7个群体共140头个体的mtDNA COX3基因蛋白质编码区（CDS）序列，利用DNAMAN、DNASP 5.1、MEGA 7.0软件分析了其序列多态性、单倍体多样性，并构建了系统发育树。结果表明，西藏牦牛群体的COX3基因CDS序列长度均为781 bp，共检测获得55个变异位点。在140头个体中共检测出11种单倍型，平均单倍型多样性（Hd）及核苷酸多样性（Pi）分别为0.665和0.00480，说明西藏牦牛具有丰富的遗传多样性。西藏7个牦牛群体可分为2大类，类乌齐牦牛单独聚为一类，其余牦牛群体为一类。此外，11种单倍型可分为2个聚类簇，说明西藏牦牛可能存在两个母系起源。西藏7个牦牛群体可划分到家牦牛、原牛和普通牛三大单倍型群体中，其中Hap＿2、Hap＿3、Hap＿4、Hap＿6、Hap＿7、Hap＿8、Hap＿10、Hap＿11这8个单倍型属于家牦牛支系，Hap＿5和Hap＿9属于原牛和普通牛支系，Hap＿1属于野牦牛支系，说明家牦牛、原牛和普通牛是西藏牦牛的混合母系起源，但受家牦牛影响较大。研究结果旨在为西藏牦牛的演化、遗传多样性以及遗传资源保护和利用提供理论依据。
全文链接
请求原文
西藏自治区马铃薯地方品种遗传多样性分析
《中国马铃薯 》 2020
摘要：为了探讨西藏自治区马铃薯地方品种的遗传多样性水平和遗传差异,利用基因测序分型(Genotyping-by-sequencing,GBS)技术对24个马铃薯地方品种和1个主栽品种进行遗传多样性分析.25个马铃薯品种观测杂合度(Ho)为0.24,期望杂合度(He)为0.19,有效等位基因数(Ne)为1.29,多态性信息含量(PIC)为0.16,核苷酸多态性(PI)为0.19,显示马铃薯的遗传多样性水平较低.遗传分化系数、遗传距离、群体进化树和主成分分析显示所有参试品种分为3个类群,遗传分化水平整体较高,但部分品种间的遗传分化系数较低.
全文链接
请求原文
西藏牛亚科部分群体线粒体DNA遗传多样性研究
《西南民族大学学报(自然科学版) 》 2019
摘要：为了在从母系遗传上研究西藏牛亚科部分群体的遗传多样性和亲缘进化关系,通过PCR扩增西藏巴美牛、当地土种牛、驼峰牛以及引进娟珊牛4个群体18个个体的mtDNA D-loop控制区全序列,并测序.结果显示,D-loop区大小分布在892 bp～912 bp之间,不同群体间存在长度差异,同时西藏各群体牛D-loop区富含A、T碱基,共检测到颠换、转换、插入、缺失以及颠换和转换共存同一位点等5种突变类型.4个群体发现17种单倍型,多态位点达到125个,平均单倍型多样性约为0.992,平均核苷酸多样性约为0.039,表明西藏黄牛群体遗传多样性丰富.系统进化分析显示17种单倍型大致可以分为三大类,在其进化过程中出现相互交流的情况,巴美牛和驼峰牛亲缘关系最近,当地土种牛仍为较纯的黄牛,西藏黄牛群体不包含瘤牛单倍型,均为普通牛单倍型.
关键词： 藏黄牛 线粒体DNA D-loop 遗传多样性 系统进化
全文链接
请求原文
西藏春小麦SSR遗传多样性分析
《西藏农业科技 》 2019
摘要：小麦作为西藏主要的粮食作物,为了解西藏春小麦遗传背景,选用均衡分布于21条染色体的105对SSR引物,其中64对多态性较好,对73份大麦亲本材料进行遗传多样性和群体结构分析.结果表明:多态信息含量(PIC)的变幅为0. 375~0. 887,平均为0. 673.遗传相似系数(GS)变异范围为0. 635~0. 916,聚类分析表明73个冬小麦亲本材料在GS值为0. 752水平上聚为3个大类,各大类分别包括15、20和38份材料,通过来源分析发现,各大类材料来源基本相同,说明本地品系来源结构单一,有待进一步引进异质资源,为育种工作突破提供基础.
全文链接
请求原文
西藏部分山羊群体线粒体DNA D-loop区遗传多样性及系统进化分析
《畜牧与兽医 》 2019 北大核心
摘要：为了探究西藏不同山羊群体的遗传多样性和亲缘关系,提取4个山羊群体DNA,扩增其mtDNA D-loop区,并测序。结果显示:西藏山羊群体mtDNA D-loop区长度在1 200～1 212 bp,各群体山羊D-loop区富含A、T碱基,共发现106个多态位点,分离出21个单倍型。西藏山羊群体单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.085 7～1.000 0,0.007 04～0.019 14,4个群体山羊碱基突变率高,表明西藏山羊的遗传多样性非常丰富。核苷酸歧义度、NJ系统进化树表明西藏山羊群体间有共同母系血源,部分支系母系起源于镰刀型角野山羊(Capra aegagrus)和捻角山羊(Capra falconeri),同时存在其他的母系起源,支持山羊品种内的多起源说。
关键词： 藏山羊 mtDNA D-loop 遗传多样性 系统进化树
全文链接
请求原文
西藏牦牛mtDNA-Cytb及ZFY基因遗传多样性与系统进化分析
《家畜生态学报 》 2019 北大核心
摘要：为进一步了解西藏牦牛的遗传多样性及系统进化关系,通过对申扎、斯布、类乌齐和帕里4个西藏牦牛类群的mtDNA-Cytb基因及ZFY基因部分序列进行克隆及序列分析。结果表明:(1)西藏牦牛Cytb基因全长1 140 bp,共发现SNP位点13个,核苷酸多样性(Pi)为0.00315, Tajima's D值为0.41410(P>0.10),共检出7种单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.709;(2)ZFY基因第11外显子长596 bp,筛查出SNP位点22个,Tajima's D值为0.78287(P>0.10),发现3种单倍型,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0.001066和0.2976;(3)聚类分析及核苷酸同源性分析显示,西藏牦牛与家牦牛的核苷酸同源性最高,与美洲野牛及欧洲野牛的核苷酸同源性次之,与水牛及非洲水牛的核苷酸同源性最低。研究结果表明,西藏牦牛遗传多样性较丰富,进一步支持将西藏牦牛及家牦牛划为牛亚科中独立牦牛属的观点,及牦牛的原始祖先来自于亚欧大陆东北部的观点。
全文链接
请求原文
西藏岗巴绵羊种质特异标记研究
《畜禽业 》 2019
摘要：为研究岗巴绵羊种质特异标记,采集岗巴羊耳组织样品和其他藏区绵羊品种120只,进行岗巴绵羊群体遗传多样性对比,共检测到384个样品DNA的分型,选取合格的样本,岗巴绵羊检测到604554个SNPs位点,大部分样本的位点检出率达到94%以上.为了对比其他藏系绵羊微卫星标记绵羊品种间的遗传关系[3],对岗巴绵羊全基因组扫描、群体进化关系进行分析结果显示,岗巴绵羊单独聚成一支,与其他群体无任何亲缘关系.为今后开展绵羊分子育种和品种保种、提高经济性状提供了分子遗传的理论依据.
全文链接
请求原文
基于MHC遗传标记的改则县本地牦牛与半野血牦牛群体遗传多样性评估
《现代农业科技 》 2019
摘要：本研究利用MHC基因区域2个遗传标记(BF1和BM1258)对改则县的本地牦牛(GZD,16头)和半野血牦牛(GZY,18头)进行遗传多样性评估。结果表明,BF1位点的期望杂合度(HE=0.719 96)和多态信息含量(PIC=0.660 63)以及等位基因数(NA=11)都要高于BM1258位点(HE=0.567 73、PIC=0.455 53、NA=6),但BF1位点的观测杂合度(HO=0.303 31)小于BM1258位点(HO=0.664 71)。就群体而言,GZD的期望杂合度为0.672 7±0.093 4(HE±SD)、观测杂合度为0.556 3±0.089 2(HO±SD)以及PIC为0.585 34,均高于GZY。GZD的近交系数(FIS=0.178)小于GZY(FIS=0.337)。通过2个微卫星位点基因型共构建了17种单倍型,GZD中含有12种单倍型,GZY中存在11种单倍型。在单倍型水平上,GZD的期望杂合度(HE)为0.875 9,观测杂合度为0.800 0±0.103 3,多态信息含量为0.832 3,也略高于GZY相关参数。2个群体之间的遗传分化指数在2个水平差异不显著,FST=-0.013 70(位点水平),FST=-0.003 00(单倍型水平)。总体而言,2个牦牛群体的MHC免疫区域遗传多样性丰富,暗示其抗病性和适应性遗传基础优秀,2个群体遗传差异不明显,加之半野血牦牛种群近交系数偏高,故建议对2个群体采取混群合并保种,提高种畜利用率,防止近交系数持续增高。
全文链接
请求原文
利用SSR标记分析青稞白粉病抗性遗传多样性
《西藏农业科技 》 2019
摘要：本研究对158份青稞材料进行白粉病的抗性鉴定,经卡方检验,F_2代的抗病与感病分离比符合孟德尔遗传定律。利用SSR标记评估了158份青稞的遗传多样性。选择的100个SSR标记中,20个标记扩增良好且具有多态性,平均每个位点有3. 8个等位变异,每个标记产生5. 8个基因型,杂合度在0～0. 529之间,20个标记的多态性信息量(poly-morphism information content,PIC)平均值为0. 39。PIC值超过0. 5的标记共9个,占所有初步筛选标记的9%,占所选20对标记的45%。这表明青稞具有丰富的遗传多样性。经SSR标记聚类分析将材料分为3类,并将其与白粉病抗性相结合分析,发现一类抗病性较强的材料。聚类图显示了不同材料间的遗传距离或遗传相似程度,可为材料选择提供参考。
全文链接
请求原文
AFLP在植物种质资源鉴定与遗传多样性分析中的应用
《现代农业科技 》 2019
摘要：AFLP分子标记技术具有重复性好、稳定性强、灵敏度高、多态性好的特点,广泛用于遗传图谱构建、基因定位、辅助育种及种质资源鉴定和遗传多样性分析。本文阐述了AFLP在粮油作物、蔬菜、水果、花卉及濒危作物种质资源鉴定和遗传多样性分析中的应用,以期为育种及资源保护提供理论基础及技术支持。
全文链接
请求原文
