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基于MHC遗传标记的改则县本地牦牛与半野血牦牛群体遗传多样性评估

文献类型: 中文期刊

作者: 朱彦宾 1 ; 平措占堆 1 ; 洛桑顿珠 1 ; 孙广明 1 ; 洛桑 1 ; 达娃央拉 1 ; 次仁央吉 1 ; 俄广鑫 1 ; 巴桑旺堆 1 ;

作者机构: 1.西藏自治区农牧科学院省部共建青稞与牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室;西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所;西南大学动物科技学院

关键词: 牦牛;MHC;遗传多样性;西藏改则

期刊名称: 现代农业科技

ISSN: 1007-5739

年卷期: 2019 年 21 期

页码: 209-211

摘要: 本研究利用MHC基因区域2个遗传标记(BF1和BM1258)对改则县的本地牦牛(GZD,16头)和半野血牦牛(GZY,18头)进行遗传多样性评估。结果表明,BF1位点的期望杂合度(HE=0.719 96)和多态信息含量(PIC=0.660 63)以及等位基因数(NA=11)都要高于BM1258位点(HE=0.567 73、PIC=0.455 53、NA=6),但BF1位点的观测杂合度(HO=0.303 31)小于BM1258位点(HO=0.664 71)。就群体而言,GZD的期望杂合度为0.672 7±0.093 4(HE±SD)、观测杂合度为0.556 3±0.089 2(HO±SD)以及PIC为0.585 34,均高于GZY。GZD的近交系数(FIS=0.178)小于GZY(FIS=0.337)。通过2个微卫星位点基因型共构建了17种单倍型,GZD中含有12种单倍型,GZY中存在11种单倍型。在单倍型水平上,GZD的期望杂合度(HE)为0.875 9,观测杂合度为0.800 0±0.103 3,多态信息含量为0.832 3,也略高于GZY相关参数。2个群体之间的遗传分化指数在2个水平差异不显著,FST=-0.013 70(位点水平),FST=-0.003 00(单倍型水平)。总体而言,2个牦牛群体的MHC免疫区域遗传多样性丰富,暗示其抗病性和适应性遗传基础优秀,2个群体遗传差异不明显,加之半野血牦牛种群近交系数偏高,故建议对2个群体采取混群合并保种,提高种畜利用率,防止近交系数持续增高。

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