科研产出
AFLP在植物种质资源鉴定与遗传多样性分析中的应用
《现代农业科技 》 2019
摘要：AFLP分子标记技术具有重复性好、稳定性强、灵敏度高、多态性好的特点,广泛用于遗传图谱构建、基因定位、辅助育种及种质资源鉴定和遗传多样性分析。本文阐述了AFLP在粮油作物、蔬菜、水果、花卉及濒危作物种质资源鉴定和遗传多样性分析中的应用,以期为育种及资源保护提供理论基础及技术支持。
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利用SSR标记分析青稞白粉病抗性遗传多样性
《西藏农业科技 》 2019
摘要：本研究对158份青稞材料进行白粉病的抗性鉴定,经卡方检验,F_2代的抗病与感病分离比符合孟德尔遗传定律。利用SSR标记评估了158份青稞的遗传多样性。选择的100个SSR标记中,20个标记扩增良好且具有多态性,平均每个位点有3. 8个等位变异,每个标记产生5. 8个基因型,杂合度在0～0. 529之间,20个标记的多态性信息量(poly-morphism information content,PIC)平均值为0. 39。PIC值超过0. 5的标记共9个,占所有初步筛选标记的9%,占所选20对标记的45%。这表明青稞具有丰富的遗传多样性。经SSR标记聚类分析将材料分为3类,并将其与白粉病抗性相结合分析,发现一类抗病性较强的材料。聚类图显示了不同材料间的遗传距离或遗传相似程度,可为材料选择提供参考。
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西藏春小麦SSR遗传多样性分析
《西藏农业科技 》 2019
摘要：小麦作为西藏主要的粮食作物,为了解西藏春小麦遗传背景,选用均衡分布于21条染色体的105对SSR引物,其中64对多态性较好,对73份大麦亲本材料进行遗传多样性和群体结构分析.结果表明:多态信息含量(PIC)的变幅为0. 375~0. 887,平均为0. 673.遗传相似系数(GS)变异范围为0. 635~0. 916,聚类分析表明73个冬小麦亲本材料在GS值为0. 752水平上聚为3个大类,各大类分别包括15、20和38份材料,通过来源分析发现,各大类材料来源基本相同,说明本地品系来源结构单一,有待进一步引进异质资源,为育种工作突破提供基础.
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西藏岗巴绵羊种质特异标记研究
《畜禽业 》 2019
摘要：为研究岗巴绵羊种质特异标记,采集岗巴羊耳组织样品和其他藏区绵羊品种120只,进行岗巴绵羊群体遗传多样性对比,共检测到384个样品DNA的分型,选取合格的样本,岗巴绵羊检测到604554个SNPs位点,大部分样本的位点检出率达到94%以上.为了对比其他藏系绵羊微卫星标记绵羊品种间的遗传关系[3],对岗巴绵羊全基因组扫描、群体进化关系进行分析结果显示,岗巴绵羊单独聚成一支,与其他群体无任何亲缘关系.为今后开展绵羊分子育种和品种保种、提高经济性状提供了分子遗传的理论依据.
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不同海拔拉萨裸裂尻线粒体16S rRNA基因序列变异及遗传多样性分析
《水产科技情报 》 2019 北大核心
摘要：为了研究拉萨裸裂尻鱼(Schizopygopsis younghusbandi)的种群遗传多样性,为该鱼的资源保护和养殖提供科学依据,对采自雅鲁藏布江4个海拔江段的33尾拉萨裸裂尻鱼样本的线粒体16S rRNA基因片段进行扩增测序,计算遗传距离、核苷酸位点变异、核苷酸多样性和单倍型多样性,构建单倍网络图和系统发育树.经检测,33个样本均获得有效16S rRNA基因扩增片段,片段大小为563 bp,从33个个体中共检出8种单倍型,其中海拔为4 565 m的拉萨裸裂尻9尾,4个变异位点,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0. 002 07和0. 833,平均核苷酸差异数最大,为1. 167;海拔为4 005 m的拉萨裸裂尻10尾,4个变异位点,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0. 001 89和0. 644,平均核苷酸差异数为1. 067;海拔为3 609 m的拉萨裸裂尻10尾,2个变异位点,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0. 000 71和0. 378,平均核苷酸差异数最小,为0. 400;海拔为2 909 m的拉萨裸裂尻4尾,1个变异位点,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0. 000 89和0. 500,平均核苷酸差异数为0. 500.分析结果表明,拉萨裸裂尻不同海拔种群的遗传多样性与其相应海拔的人类干预程度呈负相关.
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西藏冬青稞种质资源SNP标记的遗传多样性分析
《现代农业科技 》 2018
摘要：单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是等位基因间序列差异最为普遍的类型,可作为一种高通量的遗传标记。利用Illuminai Select 9k SNP芯片对96个西藏冬青稞种质资源进行了SNP检测。结果表明,在分布于7条染色体上的7 000个SNP位点中,5 026个检测到了多态性,多态性比率为71.8%;SNP聚类分析将96份西藏冬青稞种质资源聚成七大类群,种质资源间的遗传相似系数(GS),其变异范围为0.288~0.999,平均值为0.771。96份西藏冬青稞种质资源间亲缘关系较近,遗传基础比较单一。
关键词： 西藏冬青稞 种质资源 单核苷酸多态性(SNP) 遗传多样性
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西藏喜马拉雅山荆子生态地理分布及表型遗传多样性研究
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究西藏喜马拉雅山荆子生态地理分布及表型遗传多样性。【方法】实地调查及采样研究方法相结合。【结果】西藏喜马拉雅山荆子[Malus rockii Rehd.(M.baccata var.himalaica(Maxim.)Schneid.)]野生居群集中分布区位于北纬28°39'~30°35',东经92°09'~95°12,海拔2800~3300 m,呈带状分布于雅鲁藏布江、尼洋河及其支流的两岸冲积土形成的河床半湿地,或河岸的阔叶林缘或针阔叶混交林缘,处于原始野生状态。调查山荆子自然变异类型表明:树龄最大400年生以上,80~140年生的占35.73%;自然授粉坐果率高,花序坐果3~8个;西藏高海拔区的山荆子无论是果色、果柄长度、果形及果实大小都存在多样性。【结论】结合河流走向、地貌特征、树龄分布及国内外研究进展等分析推断:喜马拉雅山荆子经多年演化、筛选、淘汰形成独特的群体,可能为山荆子组的地理亚中心。
关键词： 喜马拉雅山荆子 西藏 地理分布 表型性状 遗传多样性
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青稞种质资源遗传多样性分析与核心种质群体的构建
《麦类作物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为有针对性地利用青稞种质资源,收集世界各地青稞种质资源共1 220份,利用95对SSR引物评估其遗传多样性与亲缘关系。结果表明,利用95对SSR引物总共检测到451个等位变异,平均每对引物4.74个,变化范围为1~19。1 220份青稞种质可被划分为A1和A2两个亚群,A1亚群有192份材料,主要为国外青稞种质;A2亚群有1 028份材料,主要为青藏高原地区种质;与A2亚群相比,A1亚群具有较高的遗传多样性和等位变异丰度。分子方差分析和遗传分化分析显示,A1和A2亚群间具有显著的群体分化,群体间遗传差异能解释17.29%群体方差。构建的青稞核心种质群体包括300个材料,代表了原始群体约98.4%的遗传变异和94.7%以上的表型变异。
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青藏高原青稞耐寒种质资源基于SSR标记的遗传多样性及群体结构分析
《麦类作物学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：为了解青藏高原青稞耐寒种质资源的遗传基础,利用SSR标记分析了来自青藏高原地区的71份青稞耐寒育种资源的遗传多样性和群体遗传结构。结果表明,利用从分布于大麦7个连锁群上的200对SSR引物中筛选的48对多态性引物,共检测到230个等位条带,变化范围为1~10个,平均每对SSR引物可检测到4.79个条带。多态性信息含量(PIC)变化范围为0.054 7~0.856 9,平均值为0.489 8。遗传相似系数(GS)的变化范围为0.469~0.924,平均值为0.745。经聚类分析,在GS约0.740处可将71份材料分为五大类,第51、43和14号品种分别聚为A、B和C类,第22、27、39和50号品种聚为D类,其余64个品种聚为E类,其中,第51号品种的穗长(3.8cm)、穗粒数(44.2粒)最低,第43号的单穗小穗数(90个)最高,但千粒重(35.6g)最低,第14号品种的生育期(86d)最短,但穗粒数(69.6粒)最多。此外,群体遗传结构分析表明,71份青稞资源材料可划分为2个亚群。
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