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资源类型: 中文期刊
关键词:SSR(模糊匹配)
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青藏高原青稞抗白粉病SSR标记分析

安徽农业科学 2021

摘要:[目的]研究青藏高原青稞抗白粉病机制。[方法]以青稞基因组数据为基础www.ncbi.nlm.nih.gov/sra(accession no.SRA201388)设计200对SSR引物,标记关于抗白粉病基因位点并定位染色体。[结果]QK019和QK072两个SSR引物与抗白粉病基因HvNEWENTRY标记遗传距离较近,分别为58.2,81.4 cM,该基因位于6H染色体上。[结论]该研究可为青稞抗白粉病机制研究提供科学依据。

关键词: 青稞 青藏高原 白粉病 SSR 遗传距离 染色体

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西藏春小麦SSR遗传多样性分析

西藏农业科技 2019

摘要:小麦作为西藏主要的粮食作物,为了解西藏春小麦遗传背景,选用均衡分布于21条染色体的105对SSR引物,其中64对多态性较好,对73份大麦亲本材料进行遗传多样性和群体结构分析.结果表明:多态信息含量(PIC)的变幅为0. 375~0. 887,平均为0. 673.遗传相似系数(GS)变异范围为0. 635~0. 916,聚类分析表明73个冬小麦亲本材料在GS值为0. 752水平上聚为3个大类,各大类分别包括15、20和38份材料,通过来源分析发现,各大类材料来源基本相同,说明本地品系来源结构单一,有待进一步引进异质资源,为育种工作突破提供基础.

关键词: 西藏 小麦 SSR 遗传多样性

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青稞种质资源遗传多样性分析与核心种质群体的构建

麦类作物学报 2018 北大核心 CSCD

摘要:为有针对性地利用青稞种质资源,收集世界各地青稞种质资源共1 220份,利用95对SSR引物评估其遗传多样性与亲缘关系。结果表明,利用95对SSR引物总共检测到451个等位变异,平均每对引物4.74个,变化范围为1~19。1 220份青稞种质可被划分为A1和A2两个亚群,A1亚群有192份材料,主要为国外青稞种质;A2亚群有1 028份材料,主要为青藏高原地区种质;与A2亚群相比,A1亚群具有较高的遗传多样性和等位变异丰度。分子方差分析和遗传分化分析显示,A1和A2亚群间具有显著的群体分化,群体间遗传差异能解释17.29%群体方差。构建的青稞核心种质群体包括300个材料,代表了原始群体约98.4%的遗传变异和94.7%以上的表型变异。

关键词: 青稞 遗传多样性 群体结构 核心种质 SSR

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青藏高原青稞耐寒种质资源基于SSR标记的遗传多样性及群体结构分析

麦类作物学报 2017 北大核心 CSCD

摘要:为了解青藏高原青稞耐寒种质资源的遗传基础,利用SSR标记分析了来自青藏高原地区的71份青稞耐寒育种资源的遗传多样性和群体遗传结构。结果表明,利用从分布于大麦7个连锁群上的200对SSR引物中筛选的48对多态性引物,共检测到230个等位条带,变化范围为1~10个,平均每对SSR引物可检测到4.79个条带。多态性信息含量(PIC)变化范围为0.054 7~0.856 9,平均值为0.489 8。遗传相似系数(GS)的变化范围为0.469~0.924,平均值为0.745。经聚类分析,在GS约0.740处可将71份材料分为五大类,第51、43和14号品种分别聚为A、B和C类,第22、27、39和50号品种聚为D类,其余64个品种聚为E类,其中,第51号品种的穗长(3.8cm)、穗粒数(44.2粒)最低,第43号的单穗小穗数(90个)最高,但千粒重(35.6g)最低,第14号品种的生育期(86d)最短,但穗粒数(69.6粒)最多。此外,群体遗传结构分析表明,71份青稞资源材料可划分为2个亚群。

关键词: 青稞 遗传多样性 SSR 群体结构 聚类分析

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西藏白菜型油菜遗传多样性分析

西藏农业科技 2012

摘要:本研究利用SSR分子标记技术分析了169份来自西藏不同地区的白菜型油菜材料的遗传多样性。从本实验室已有SSR引物中筛选出23对扩增效果较好的引物用于聚类分析。结果表明:23对引物共扩增出80条条带,平均每对引物扩增出3.5条带,条带大小在50-400bp之间;在相似系数为0.50、0.53、0.56、0.59、0.62和0.70,供试材料可被划分为2类、4类、6类、9类、14类和29类。根据分子标记的聚类结果,可以初步判定这些油菜的亲缘关系,但是需要进一步结合这些材料的形态和地理分布特点,才能知道材料的起源和分化状态。

关键词: 西藏 白菜型油菜 遗传多样性 分子标记 SSR

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