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西藏冬青稞种质资源SNP标记的遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 孟霞 1 ; 曾兴权 1 ; 其美旺姆 1 ; 尼玛扎西 1 ;

作者机构: 1.西藏农牧学院;西藏农牧科学院

关键词: 西藏冬青稞;种质资源;单核苷酸多态性(SNP);遗传多样性

期刊名称: 现代农业科技

ISSN: 1007-5739

年卷期: 2018 年 01 期

页码: 40-41+43

摘要: 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是等位基因间序列差异最为普遍的类型,可作为一种高通量的遗传标记。利用Illuminai Select 9k SNP芯片对96个西藏冬青稞种质资源进行了SNP检测。结果表明,在分布于7条染色体上的7 000个SNP位点中,5 026个检测到了多态性,多态性比率为71.8%;SNP聚类分析将96份西藏冬青稞种质资源聚成七大类群,种质资源间的遗传相似系数(GS),其变异范围为0.288~0.999,平均值为0.771。96份西藏冬青稞种质资源间亲缘关系较近,遗传基础比较单一。

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