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资源类型: 中文期刊
关键词:遗传多样性(模糊匹配)
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泛基因组视角下动物性状与遗传多样性研究进展与展望

中国畜牧杂志 2025 北大核心 CSCD

摘要:泛基因组学最初在微生物研究中提出,随着测序技术的发展,其应用逐渐扩展到动植物领域.泛基因组涵盖了物种内所有个体的基因组,包括核心基因组和可变基因组,为揭示遗传多样性和性状变异提供了关键线索.本文综述了泛基因组学的基本概念、发展历程、测序技术及在不同动物中的研究现状,重点探讨了动物泛基因组在揭示物种遗传多样性和适应性进化机制中的作用,旨在为动物基因组学及其相关应用研究提供参考.

关键词: 泛基因组 核心基因 可变基因 遗传多样性 适应性进化

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47份西藏马铃薯地方种质资源表型性状遗传多样性分析

江苏农业科学 2025 北大核心

摘要:为丰富及保护利用西藏地区马铃薯种质资源,对西藏47份马铃薯地方种质资源的20个质量性状和10个数量性状进行遗传多样性分析。结果表明,20个质量性状的遗传多样性指数差异较大,变幅为0.52~1.49,其中薯形和肉色的遗传多样性指数较大,分别达到1.49和1.30,其次为茎色、顶小叶形状、芽眼深浅、块茎整齐度和熟性;10个数量性状的变异系数是11.37%~73.13%,变异系数最高的是商品薯率,遗传多样性指数为1.82~2.09,遗传多样性指数最大的是株高。相关性分析表明,单株产量与顶小叶宽度、株高、茎粗、主茎数、单株薯数呈极显著正相关,商品薯率与株高、主茎数、单株薯数呈显著或极显著负相关;主成分分析得到11个主成分,累计贡献率达77.418%,能较好地反映30个表型性状的基本特征;聚类分析将47份马铃薯种质资源分为5类,第Ⅰ类群可作为中熟及薯肉色改良材料,第Ⅱ类群为植株矮小低产型材料,可作为茎翼形状、花冠颜色和薯皮颜色的改良材料;第Ⅲ类群为中产型材料,可用作花冠大小、茎色、薯皮光滑度等性状的改良;第Ⅳ类群为高产型材料,可用作高产育种的亲本;第Ⅴ类群为中晚熟型及商品薯率高材料,可用作高商品薯性的改良。

关键词: 马铃薯 马铃薯地方资源 表型性状 遗传多样性 数量性状 质量性状

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利用微卫星及线粒体分子遗传标记的西藏吉拉牦牛群体遗传多样性研究

甘肃农业大学学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:【目的】旨在探究西藏吉拉牦牛遗传多样性水平及对群体遗传结构进行评估与鉴定。【方法】利用12个微卫星分子标记和mtDNAD_Loop序列对全部111个吉拉牦牛开展基因分型和遗传评估。【结果】微卫星标记结果显示在12个位点中共检测出76个等位基因,其中TGLA53携带最多复等位基因数(10)。除AGLA293位点表现为低多态性(PIC<0.25)外,其他11个位点均表现为高多态性位点(PIC>0.5)。隆格尔乡的吉拉牦牛群体平均观测杂合度为(0.615 3±0.022 3)、等位基因型数量为(5.58±1.31),吉拉乡群体的平均观测杂合度为(0.588 4±0.016 9)、等位基因型数量为(5.67±1.44),另外近交系数(FIS)分析显示吉拉牦牛可能存在显著近交风险(FIS=0.098,P<0.000 4)。瓶颈效应分析结果显示,在SMM和TPM模型下吉拉牦牛未显著经历瓶颈效应。群体遗传分歧结果显示吉拉乡和隆格尔乡两地吉拉牦牛群体间遗传分歧不显著。通过mtDNAD_Loop序列研究结果显示在665 bp的D_Loop序列范围内共鉴定到53个多态位点(占总序列的7.97%),构建获得32个单倍型。吉拉牦牛群体平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.910 57和0.013 05,表明吉拉牦牛母系遗传多样性丰富。【结论】吉拉牦牛群体内虽具有较丰富的遗传多样性水平,但群体整体仍存在近交风险。

关键词: 吉拉牦牛 微卫星遗传标记 线粒体DNA 遗传多样性

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西藏83份油菜资源品质性状及遗传多样性分析

种子 2025 北大核心 CSCD

摘要:为探究油菜SSR分子标记与品质性状的相关性及遗传多样性,以83份西藏本地油菜种质资源为材料,分析油菜品质性状与SSR分子标记的关系,并进行油菜种质资源的遗传多样性分析。结果表明,83份油菜品质性状的遗传变异系数为11.48%~22.30%,表明性状间差异显著,且变异幅度较大。经过筛选后的15对引物对83份油菜种质资源进行扩增,共检测到169个位点,其中多态性位点165个,多态性条带比率为97.63%。在开发筛选出的15对多态性引物的标记下,最终有121个标记与7个品质性状呈极显著或显著相关。通过遗传一致度聚类分析,筛选出定日县和曲水县的油菜资源作为杂交亲本,预计这些亲本将在分离世代中产生广泛的变异性。

关键词: 油菜 遗传多样性 品质性状 相关性分析

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西藏特有种砂生槐的研究现状和展望

中国野生植物资源 2024 CSCD

摘要:砂生槐为西藏“一江两河”地区特有的小灌木,因其作为固沙、薪柴、药用、蜜源、饲用等植物,备受人们的关注。本文从植物形态学、遗传学和细胞学、生长发育、生态适应性、以及饲用和药用价值等综述了砂生槐的相关研究成果,并对其种群的复壮、资源的驯化选育、苦参碱开发、蛋白饲料应用等研究方向进行了展望,以期为砂生槐进一步开发和应用,提供重要参考。

关键词: 雅鲁藏布江流域 砂生槐 苦参碱 遗传多样性 生长发育 生态适应性

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青稞籽粒表型性状和品质性状遗传多样性分析

安徽农业科学 2024

摘要:以328份来源不同区域的青稞种质资源为材料,对5个籽粒表型性状(长均值、宽均值、长/宽、直径和千粒重)和4个品质性状(总淀粉、直链淀粉、蛋白质和β-葡聚糖)进行了测定和遗传多样性分析.结果显示,测定的9个性状在供试种质资源间均存在不同程度的差异.青稞籽粒表型性状的变异系数变幅为6.23%~17.22%,品质性状的变异系数变幅为10.60%~27.34%.9个性状遗传多样性指数均高于1.8,表明供试材料具有丰富的遗传多样性.从区域上看,平均遗传多样性指数从高到低依次为国外、西藏山南、国内其他地区、西藏昌都、西藏日喀则、西藏拉萨、西藏林芝、西藏阿里.

关键词: 青稞 籽粒 表型性状 品质性状 遗传多样性

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斯布牦牛线粒体D_Loop区域遗传多样性研究

中国饲料 2024 北大核心

摘要:作为我国西藏重要的牦牛国家遗传资源代表性品种,斯布牦牛对藏区畜牧业经济发展具有不可替代价值.本研究旨在利用线粒体D_Loop区域遗传变异评估不同被毛颜色的斯布牦牛类群遗传多样性.结果显示:在全部152个个体内的768 bp长度的D_Loop区域中,共发现57个多态位点,构建获得51个D_Loop单倍型,单倍型多样性(Hd)分布为0.893(黑色)~0.944(棕色),全部单倍型归属于两大系统发育分支,有12个D_Loop单倍型为两群体间共享单倍型.两群体Tajima'D和Fu's D参数均为不显著(P>0.05)且群体间遗传分歧不显著(FST=0.00409,P>0.05).总体而言,斯布牦牛群体母系遗传多样性丰富,种群近期历史上未出现群体扩张,不同被毛颜色斯布牦牛遗传背景无显著差异.该研究对进一步明确斯布牦牛种群关系及群体遗传多样性保护提供数据支撑.

关键词: 斯布牦牛 线粒体DNA 遗传多样性 系统发育

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西藏牦牛群体遗传多样性及遗传结构分析

中国草食动物科学 2024

摘要:采集西藏地区5个牦牛类群(西藏高山牦牛,类乌齐牦牛,帕里牦牛,斯布牦牛,娘亚牦牛)共49头牦牛的血样,利用全基因组重测序技术对其遗传多样性及遗传结构进行了分析,以期为西藏牦牛遗传资源的保护、开发和利用提供参考。SNP变异检测结果表明,经过滤后得到7 655 923个SNP位点;群体遗传多样性分析发现,西藏地区不同牦牛群体之间的基因杂合度差异并不显著,且均存在不同程度的杂合度下降现象,类乌齐牦牛的观测杂合度最高,为0.336 4;群体结构分析发现,5个牦牛类群之间存在基因交流现象。说明目前西藏牦牛各群体整体存在遗传多样性下降的潜在风险,需要进一步加强群体保种工作,以确保不同品种资源的多样性得到有效保护。

关键词: 西藏牦牛 遗传多样性 群体结构

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斯布牦牛线粒体D_Loop区域遗传多样性研究

中国饲料 2024 北大核心

摘要:作为我国西藏重要的牦牛国家遗传资源代表性品种,斯布牦牛对藏区畜牧业经济发展具有不可替代价值。本研究旨在利用线粒体D_Loop区域遗传变异评估不同被毛颜色的斯布牦牛类群遗传多样性。结果显示:在全部152个个体内的768 bp长度的D_Loop区域中,共发现57个多态位点,构建获得51个D_Loop单倍型,单倍型多样性(Hd)分布为0.893(黑色)~0.944(棕色),全部单倍型归属于两大系统发育分支,有12个D_Loop单倍型为两群体间共享单倍型。两群体Tajima'D和Fu's D参数均为不显著(P>0.05)且群体间遗传分歧不显著(F_(ST)=0.00409,P>0.05)。总体而言,斯布牦牛群体母系遗传多样性丰富,种群近期历史上未出现群体扩张,不同被毛颜色斯布牦牛遗传背景无显著差异。该研究对进一步明确斯布牦牛种群关系及群体遗传多样性保护提供数据支撑。

关键词: 斯布牦牛 线粒体DNA 遗传多样性 系统发育

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基于线粒体Cyt b基因和D-loop区序列的雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡遗传多样性分析

生物资源 2024

摘要:对西藏雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡(Glyptosternum maculatum)种群遗传多样性的解析可为黑斑原鮡的保护和人工选育提供理论依据,以雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡种群为研究对象,通过对其线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cyt b)和控制区(D-loop区)基因序列进行扩增和测序,分析了黑斑原鮡的线粒体序列特征与其种群遗传多样性的关联。结果显示:黑斑原鮡Cyt b基因序列长度为1 138 bp,(A+T)含量(59.5%)高于(C+G)含量(40.5%);检测到突变位点32个,其中单突变位点26个,简约信息位点6个;共检测到21个单倍型,其中单倍型Hap 1个体数最多,占总检测个体数的69.44%;种群单倍型多样性(Hd)为(0.509±0.050),核苷酸多样性(Pi)为(0.000 71±0.000 11),Tajima’s D中性检验值为-2.532 91,中性检验结果显示(P<0.001)极显著负值。结果还显示:D-loop区基因序列长度为893bp,(A+T)含量(64.31%)高于(C+G)含量(35.69%);共检测到突变位点35个,包括单突变位点21个,简约信息位点14个;检测到23个单倍型,Hd为(0.701±0.028),Pi为(0.001 67±0.000 28),单倍型Hap 1和Hap 3的个体数较多,分别占45.14%和30.56%;D-loop基因Tajima’s D中性检验值为-2.366 38,中性检验结果显示(P<0.01)极显著负值,表明该群体经历过种群扩张。黑斑原鮡种群的Cyt b和D-loop区基因适合进行黑斑原鮡的种内遗传分析,且D-loop区基因更具有进化优势,其种群的遗传多样性较低,对黑斑原鮡遗传育种与保护具有一定的参考价值。

关键词: 雅鲁藏布江 黑斑原鮡 遗传多样性 细胞色素b基因 D-loop区

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