科研产出
盐碱胁迫下青稞全转录组分析
《西南农业学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】长链非编码RNA（lncRNAs）在动植物的各种生物过程中起着重要作用。青稞是青藏高原的主要粮食作物,对其胁迫诱导基因的研究不仅有助于了解胁迫耐受的分子机制,而且有助于利用基因工程培育胁迫耐受性品种。【方法】本文对2个青稞品种（0119盐碱高抗,0226盐碱敏感）幼苗分别进行盐碱胁迫和对照处理2、8、24、48和72 h后,提取植株叶片RNA进行全转录组测序（设置3个生物学重复）,共获得60组RNA-seq数据。【结果】青稞基因组中含有大量的lncRNAs;总共鉴定出6704个lncRNAs,包括2741个基因间长链非编码RNA和1378个反义长链非编码转录本。比较盐碱处理组和对照组的基因表达水平,获得5个时间点的mRNAs和lncRNAs的差异表达基因集,但5个差异表达基因集合之间重叠较少,说明在盐碱胁迫的不同阶段,不同的mRNAs和lncRNAs参与了盐碱响应。研究发现,在24 h时0119和0226中差异表达基因的数目均降低,这可能与作物对刺激反应的两个阶段相关。根据基因的相对位置和表达相关性,预测了lncRNAs的顺式和反式靶基因;功能富集分析发现在0119品种中特异性差异表达的3118个（1303个上调和1815个下调）mRNAs和798个（346个上调和452个下调）lncRNAs可能与耐盐碱性有关,它们直接或间接参与"胁迫应答/刺激反应"、"离子运输"、"膜"和"植物激素信号转导"。为了验证利用RNA-Seq数据计算基因表达量的可靠性,挑选部分mRNA和lncRNA在8, 24和48 h盐碱胁迫的0119品种中进行RT-qPCR验证,结果表明RT-qPCR与RNA-seq的基因表达水平一致。【结论】本研究有助于进一步了解青稞盐碱耐受性的机制,提高青稞对盐碱胁迫的耐受性。
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虫草素抗三阴性乳腺癌的转录组学分析
《生物技术通报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：前期研究表明,蛹虫草活性成分虫草素能有效抑制乳腺癌移植瘤的生长和转移,但其作用机制未清楚。本研究取三阴性乳腺癌移植瘤样品,通过转录组测序技术分析虫草素抗乳腺癌移植瘤的分子作用机制。结果表明,以P<0.05、log2|FC|>1为标准,筛选获得584个差异表达基因,其中上调基因69个,下调基因515个;KEGG分析表明,虫草素对乳腺癌移植瘤的分子调控涉及Hippo signaling pathway、Hedgehog signaling pathway、ECM-receptor interction、TGF-beta signaling pathway等多条癌症相关信号通路;GO分析表明,这些差异基因富集在biological adhesion、growth、metabolic process、locomotion和biological process等16个生物学过程中,提示虫草素对乳腺癌移植瘤生长与转移有极显著的调节作用;进一步对生长和转移过程的基因进行PPI互作分析,提示Hedgehog signaling pathway、Hippo signaling pathway是虫草素抗三阴性乳腺癌的重要潜在作用通路。研究结果提示Hippo-Yap/TAZ信号通路和Hedgehog-Gli信号通路为潜在作用通路,为进一步理解虫草素治疗三阴性乳腺癌的分子机制奠定了基础。
关键词： 虫草素 转录组 三阴性乳腺癌 Hedgehog Hippo
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ARTP与紫外线复合诱变选育高性能绿僵菌菌株
《食品工业科技 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为获得高性能的金龟子绿僵菌菌株,本研究采用常压室温等离子体(Atmospheric and room temperature plasma,ARTP)和紫外线复合诱变处理金龟子绿僵菌,通过比较产孢快慢和生长直径大小进行初筛,用抗紫外能力和毒力作为复筛指标选育菌株,并对育种获得的突变株进行耐热性和遗传稳定性试验,最终在ARTP 40 s和紫外120 s时筛选出一株产孢量高、耐紫外线、毒力强、遗传稳定的优良菌株AU34.该菌株产孢时间比原始菌株快,产孢量为1.63 ±0.22(108 cell/cm2),较原始菌株提高了63.81%.经紫外照射5 min后,AU34存活率为3.18%,比原始菌株更耐紫外照射.并且AU34对小菜蛾的毒力强,校正死亡率为85.71%,半数致死时间(Half-lethal time,LT50)为6.12 d.与原始菌株相比,AU34的耐热性也有较大提高.传代培养6代后,菌株AU34的产孢量无明显变化,具有良好的遗传稳定性.
关键词： 金龟子绿僵菌 常压室温等离子体(ARTP) 紫外诱变 复合诱变 筛选 遗传稳定性
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代乳粉添加女贞子对羔羊生长性能、免疫和抗氧化功能的影响
《中国畜牧杂志 》 2020 北大核心
摘要：试验旨在研究羔羊奶粉中添加女贞子对羔羊生长性能、免疫和抗氧化功能的影响。选取90只3日龄湖羊羔羊,分为3组,每组5个重复,每个重复6只羔羊,公、母各半。对照组饲喂羔羊奶粉,土霉素组饲喂羔羊奶粉+1 g/kg土霉素,女贞子组饲喂羔羊奶粉+30 g/kg女贞子粉。试验期46 d。结果表明:土霉素组和女贞子组羔羊腹泻率和腹泻天数低于对照组(P<0.05);土霉素组和女贞子组羔羊的肩甲高度、尻高度、体长、胸围和体增重均优于对照组(P<0.05);土霉素组和女贞子组羔羊在17日龄和24日龄的血液IgG浓度高于对照组(P<0.05),而土霉素组与女贞子组间无显著差异;土霉素组和女贞子组羔羊的血液可的松水平在24日龄和31日龄低于对照组(P<0.05),前列腺素水平在31日龄低于对照组(P<0.05),土霉素组和女贞子组间羔羊无显著差异;土霉素组和女贞子组羔羊血液超氧化物歧化酶水平在24日龄和31日龄高于对照组(P<0.05),血液丙二醛水平在17日龄和31日龄低于对照组(P<0.05)。结果提示,在人工饲喂羔羊的饲草料采食量、生长性能、抗氧化功能、应激激素水平和免疫状态方面,女贞子和土霉素的使用效果相当。
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环境变异对青稞热稳定蛋白质含量及蛋白质Z的影响
《植物遗传资源学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：热稳定蛋白是衡量麦芽品质的重要指标,为探明青稞籽粒和麦芽热稳定蛋白的含量、蛋白质Z的组成特征以及影响条件。本研究以3份青稞和1份对照大麦品种Gairdner为试验材料,对青稞籽粒及其麦芽的热稳定蛋白进行分析与鉴定,研究了不同生态环境下青稞热稳定蛋白质含量和蛋白质Z的组成特征,同时筛选出了优异啤用品质青稞品种(品系)。结果表明,青稞发芽温度为20℃,发芽时间为72 h,培养溶液PH为5时,发芽及焙焦条件下最有利于青稞热稳定蛋白总含量及蛋白质Z的累积。利用该发芽条件筛选种植于西宁、湟源和海晏的青稞资源,发现种植于西宁的青稞种子和发芽后热稳定蛋白质总含量最低,但是焙焦后热稳定蛋白质和蛋白质Z含量最高;同时从150份青稞资源中筛选出热稳定蛋白质含量及蛋白质Z条带清晰、含量高的优异资源15份。本研究结果为酿造青稞品种选育、啤用青稞和麦芽质量评价指标提供理论依据。
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牦牛RETN基因遗传多态性与生长性状相关性分析
《基因组学与应用生物学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在研究牦牛RETN基因的遗传多样性,选取麦洼粉嘴牦牛（30头）、麦洼黑嘴牦牛（48头）、斯布牦牛（36头）、类乌齐牦牛（47头）4个牦牛群体共161个个体。对RETN基因3个外显子区域及相邻区域进行扩增;利用DNA池测序与直接测序相结合的方法检测牦牛RETN基因的SNP位点;对SNP位点进行分析,并进一步分析其与生长性状的相关性。结果表明,在RETN基因第1外显子区域发现5个突变位点,即A1966G、G1967A、G1976T、G2021T、G2079C,5个位点间具有强连锁不平衡性;5个突变位点在麦洼牦牛、斯布牦牛中处于Hardy-Weinberg平衡状态（p>0.05）,在类乌齐牦牛群体中不符合平衡状态;5个多态位点均为低度多态性（PIC<0.25）。5个位点与生长性状相关性分析发现,AA型个体各生长性状数值均高于AG型个体其中5个突变位点与麦洼牦牛体斜长存在显著相关性（p<0.05）。说明RETN基因有丰富的遗传多态性,初步认定A1966G、G1967A、G1976T、G2021T、G2079C位点可以作为一种遗传标记,为选育优良牦牛品种提供依据。
关键词： 牦牛（Bos grunniens） RETN基因 生长性状 相关性分析
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麦洼牦牛CYP4A 11基因多态性与体尺性状的关联分析
《基因组学与应用生物学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了探讨细胞色素P450 4A 11基因外显子多态性与麦洼牦牛体尺性状的相关性,挖掘与体尺性状显著关联的SNP位点,本研究选取麦洼牦牛为研究对象,通过PCR扩增和DNA测序技术,共发现G4806A、G10008A、G10185A、T13164C、A13199G和C13207T 6个SNPs,优势基因型分别为GG、GA、GA、TT、AA和TC型;位点G4806A和A13199G处于Hardy-Weinberg平衡状态,其余4个多态位点均未能达到哈代温伯格平衡.关联分析发现,G4806A位点与麦洼牦牛胸围和体重极显著相关(p<0.01),与管围显著相关(p<0.05),其中GA型个体均值显著高于GG型个体(p<0.05),表现为优势基因型;其他位点与麦洼牦牛体尺性状均不相关.CYP4A 11基因G4806A位点与牦牛胸围、体重及管围等体尺性状显著相关,可作为分子辅助标记用于牦牛优良性状的选育.
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青稞原料与青稞酒风味物质相关性分析
《食品与发酵工业 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了解不同品种青稞原料对青稞酒主体风味物质的影响,以7个不同品种的青稞及其酿造出的青稞酒为研究对象。采用气相色谱-质谱联用法,利用谱库进行检索和保留指数验证。结果表明,青稞原料和青稞酒中均鉴别出了50多种风味物质,主要包括醇类、醛类、酸类、酯类、烷烃类、烯烃类、其他类(酮类、苯类、萘类、酚类)。青稞原料中含量最高的风味物质是醛类,其相对含量在35%～65%,其次是醇类化合物,相对含量在15%～26%;而青稞酒中含量最高的是醇类物质,相对含量在76%～88%,其次为酯类化合物,相对含量在6%～13%。不同品种青稞及酿造出的传统青稞酒在主体风味化合物种类上差异不显著,风味化合物的种类具有较强的稳定性和一致性,但在风味化合物的含量上存在明显差异。
关键词： 青稞 青稞酒 气相色谱-质谱联用法 风味化合物 相关性
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西藏青稞产区土壤和籽粒硒含量调查研究
《麦类作物学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为明确西藏青稞产区土壤和籽粒硒含量及两者之间的关系,对西藏青稞主产区80个地点的青稞籽粒和土壤进行取样调查,研究不同青稞产区土壤全硒含量、有效硒含量和青稞籽粒硒含量及其成因.结果 发现,西藏青稞产区土壤全硒含量范围在0.026~0.432 mg· kg-1,平均值为0.180 mg·kg-1;根据土壤全硒含量分类标准,缺硒土壤占49%,硒适量土壤占33%,富硒土壤占18%,富硒土壤主要分布在雅鲁藏布江以南地区.土壤有效硒含量范围在0.001~0.059 mg· kg-1,平均值为0.013 mg·kg-1.青稞籽粒硒含量范围在0~0.098 mg·kg-1,平均值为0.011 mg·kg-1;根据籽粒硒含量分类标准,其中90%属于硒缺乏.青稞主产区土壤全硒含量与土壤有效硒含量之间及二者与青稞籽粒硒含量之间均呈显著正相关关系,说明土壤全硒和有效硒含量可作为衡量青稞富硒潜力的有效指标.土壤有效硒每增加0.01 mg· kg-1,籽粒硒含量增加0.014 4 mg·kg-1.本结果有助于西藏富硒土壤资源的合理开发、富硒青稞等农作物生产.
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