科研产出
马铃薯PAL基因家族的全基因组鉴定及其在非生物胁迫下和块茎花色素苷合成中的表达分析
《作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：苯丙氨酸解氨酶(phenylalanin ammonia-lyase,PAL)是苯丙烷代谢途径的限速酶和关键酶,在植物生长发育过程中发挥着重要作用.本研究在马铃薯(Solanum tuberosum L.)全基因组水平下,利用BlastP和HMM 3.1 鉴定到 8个PAL基因家族成员,利用ExPASy、CELLO、PlantCARE等在线工具,对PAL基因家族成员的进行生物信息学分析.利用PGSC数据库下载的RNA-seq数据,分析了StPALs在双单倍体(DM)马铃薯不同组织部位和非生物胁迫下的表达模式.对 3 个不同颜色马铃薯块茎组织(皮和肉)进行RNA-seq,以及利用 3 个不同颜色块茎杂交子代的薯肉进行qPCR分析.结果表明,8 个StPALs分布在 3、5、9 和 10 号染色体上,它们与烟草(Nicotiana tabacum)PAL的亲缘关系较近.StPAL基因成员的启动子区域内含有多个顺式元件,包括光响应、逆境胁迫响应、激素响应、生长发育相关和转录因子调控的多种顺式元件.StPAL2 在匍匐茎中特异表达,StPAL3/5/8 在块茎和匍匐茎中特异表达,StPAL3 在甘露醇处理下下调表达,StPAL3 和StPAL8 在热胁迫中上调表达.它们可能参与了马铃薯块茎的发育和非生物胁迫响应.5 个StPALs(StPAL3/4/5/6/8)基因在彩色薯肉中均上调表达,可能参与马铃薯薯肉中花色素苷的生物合成.这些结果为进一步了解StPAL基因家族特征,深入分析StPALs基因在马铃薯中的功能提供了理论依据.
关键词： 马铃薯 PAL基因家族 非生物胁迫 花色素苷生物合成 表达分析
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孤雌产雌松毛虫赤眼蜂种群间生殖表型的比较
《中国生物防治学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为明确温度、遗传背景和雌蜂日龄对孤雌产雌松毛虫赤眼蜂生殖表型和Wolbachia滴度的影响，在22℃和29℃下处理两种遗传背景（彰武、西丰）的孤雌生殖松毛虫赤眼蜂，逐日统计子代蜂生殖表型指标（雄性比，间体率）、适合度指标（日产卵量，羽化率）和Wolbachia滴度。结果发现，29℃下子代蜂雄性比和间体率显著高于22℃处理的子代蜂，但29℃下雌蜂体内Wolbachia滴度和日产卵量均显著低于22℃处理的雌蜂。彰武种群雄性比显著高于西丰种群，但其日产卵量显著低于西丰种群。随母代蜂日龄增加，子代蜂雄性比和间体率均上升，但日产卵量和羽化率均下降。结果表明温度、遗传背景和日龄均影响孤雌产雌松毛虫赤眼蜂生殖表型。研究结果将为改善孤雌产雌赤眼蜂规模化繁育和田间应用提供参考。
关键词： 沃尔巴克氏体 松毛虫赤眼蜂 孤雌产雌生殖 遗传背景
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牦牛血抗氧化肽发酵制备工艺优化及结构分析研究
《食品安全质量检测学报 》 2023 北大核心
摘要：目的 优化牦牛血抗氧化肽的发酵制备工艺并分析其结构。方法 在单因素实验的基础上,开展牦牛血抗氧化肽制备的响应面优化实验。采用液相色谱-串联质谱法（liquidchromatography-tandemmass spectrometry,LC-MS/MS）对经冷冻干燥处理后的牦牛血抗氧化肽的肽段组成及其序列进行检测。结果 牦牛血抗氧化肽制备的最佳工艺条件为:底物质量浓度65g/L、接种量2.0%、发酵时间71h。在此条件下,牦牛血抗氧化肽的羟基自由基清除率为88.21%。根据其氨基酸组成、肽段序列、分子量大小筛选出可能具有较好抗氧化活性的肽段20条,其所匹配的蛋白为A0A6B0QV06、A0A6B0QW84。经蛋白质数据库Uniprot鉴定分析,此两类蛋白质已形成由两条α链和两条β链组成的异四聚体结构,可促进动物肺脏器官中的氧气运输到其他脏器组织中,具有抗缺氧的作用。结论 采用枯草芽孢杆菌液态发酵法制备牦牛血抗氧化肽,可增大牦牛血的利用率,减少资源的浪费。
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色瓦绵羊RPL8基因的组织表达特征及生物信息学分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究色瓦绵羊核糖体蛋白L8基因（RPL8）在各组织部位的表达特征及其潜在功能作用，揭示RPL8基因调控色瓦绵羊产奶质量的分子作用机制，为推进色瓦绵羊的分子遗传育种提供理论依据。【方法】PCR扩增色瓦绵羊RPL8基因，通过ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0等在线软件分析RPL8基因结构特征及潜在功能，并以实时荧光定量PCR检测其在色瓦绵羊各组织中的表达分布情况。【结果】RPL8基因在色瓦绵羊乳腺、肌肉、心脏、肾脏、脾脏、肝脏、小肠、瘤胃和卵巢等9个组织中均有表达，在小肠、乳腺和卵巢中的相对表达量极显著高于其他组织中的相对表达量（P＜0.01）。色瓦绵羊RPL8基因编码区（CDS）序列长774 bp，共编码257个氨基酸残基；基于RPL8基因核苷酸序列相似性构建的系统发育进化树显示，色瓦绵羊与山羊、牦牛、牛等反刍物种的亲缘关系较近。色瓦绵羊RPL8蛋白相对分子量为28024.66Da，理论等电点（pI）为11.04，是一种稳定的碱性亲水性蛋白，不具有跨膜结构，主要定位于细胞质（占78.3%）；色瓦绵羊RPL8蛋白存在15个磷酸化位点[7个丝氨酸（S）位点，8个苏氨酸（T）位点]，其二、三级结构中均以无规则卷曲为主。色瓦绵羊RPL8蛋白的互作蛋白均为核糖体蛋白，其同源性高达99.90%，其中，RPS5、RPS16、RPL11、RPS3、RPS18和RPS11属于通用核糖体蛋白家族，RPL13属于真核核糖体蛋白家族。【结论】色瓦绵羊RPL8是一种胞内稳定的碱性亲水性蛋白，具有核糖体蛋白的基本结构特征。RPL8基因在色瓦绵羊各组织中的表达具有普遍性，尤其在乳腺和卵巢中呈高表达，说明RPL8基因除了发挥其家族基本功能作用外，在色瓦绵羊乳腺和卵巢组织中可能还影响乳脂含量与卵泡的周期性发育。
关键词： 色瓦绵羊 核糖体蛋白 RPL8基因 乳腺 卵巢 组织表达特征
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西藏自治区首次发现螟黄赤眼蜂
《中国生物防治学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为发掘西藏地区本土的赤眼蜂资源，本研究利用灭活米蛾卵卡在西藏林芝嘎玛地区的梨园采集到一个赤眼蜂种群。采用ITS2序列比对鉴定所采集的赤眼蜂种类，并测定该蜂的生物学指标。结果表明：西藏林芝嘎玛地区所诱集的赤眼蜂鉴定为螟黄赤眼蜂Trichogramma chilonis Ishii，羽化率为80%，雌性比为57.14%，耐饥饿时间为1.08 d，后足径节长度为157.6μm。本研究将为发掘西藏地区赤眼蜂资源提供参考，并为利用赤眼蜂在西藏自治区开展生物防治实践奠定基础。
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藏北一年生人工草地弃耕不同年限的土壤微生物群落特征研究
《中国草地学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：探讨人工草地弃耕对高寒草甸土壤微生物群落的影响,可为藏北高寒草地生态保护提供理论参考.分别采集弃耕2年、弃耕10年的人工草地和天然草地表层(0~10 cm)土壤样品,采用高通量测序技术分析土壤微生物群落组成和多样性变化.结果表明:土壤细菌群落独有OTUs表现为天然草地(5416)>弃耕2年(5057)>弃耕10年(3933),真菌群落独有OTUs表现为弃耕10年(1638)>弃耕2年(1564)>天然草地(1266).不同弃耕年限土壤微生物群落多样性无显著差异.细菌群落(门和属水平)组成的主要影响因子为土壤pH值、有机质含量和速效氮含量,真菌群落门水平主要影响因子为土壤速效氮含量、pH值、速效磷含量和有机质含量,属水平主要影响因子除上述因子外还包括速效钾含量.总之,微生物群落组成与土壤因子密切相关.
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不同精粗比饲粮对牦牛瘤胃内环境的影响
《畜牧与兽医 》 2022 北大核心
摘要：旨在研究不同精粗比饲粮对西藏牦牛瘤胃内环境的影响.选取3周岁、平均体重(154.8±13.6)kg、健康无病的牦牛20头随机分为低精料组和高精料组,每组10头,公母各半,分别饲喂低精料(精粗比40∶60)和高精料(精粗比60 ∶ 40)饲粮,预试期10d,正试期90d(8、9和10月).结果:饲粮精料水平的提高显著降低了瘤胃pH值、异丁酸和异戊酸占总挥发性脂肪酸(TVFA)的百分比(P<0.05),显著增加了瘤胃TVFA含量(P<0.05),但乙酸、丙酸、丁酸、戊酸占TVFA的百分比及乙酸/丙酸值不受饲粮精粗比的影响(P>0.05);饲粮精料水平的提高显著提高了瘤胃氨态氮(NH3-N)和总氮(TN)含量(P<0.05),显著降低了微生物蛋白(MCP)含量(P<0.05).研究表明,饲喂低精料饲粮有利于促进牦牛氨态氮的利用与微生物蛋白的合成,改善瘤胃氮平衡.
关键词： 牦牛;精粗比;瘤胃发酵;氮平衡
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西藏13个甘蓝型油菜自交品系的配合力及主要性状的遗传力
《贵州农业科学 》 2022 北大核心
摘要：[目的]分析西藏当地油菜资源的配合力和主要农艺性状的遗传力,为西藏油菜杂交育种优势亲本的选择提供理论依据.[方法]以西藏13份甘蓝型油菜自交品系(编号Z1~Z13)作亲本,采用完全双列杂交设计,分析亲本和169个杂交组合的配合力,并对株高、一次分枝数、分枝部位、主序长度、主序角果数、角果密度、单株角果数、角果长度、每果粒数和千粒重10个主要农艺性状的遗传力进行估算.[结果]13个亲本在10个农艺性状上一般配合力综合表现为Z12=Z10>Z7=Z3>Z1>Z9>Z4>Z6>Z5>Z2>Z11>Z13>Z8,在产量性状上(单株角果数、每果粒数、千粒重)亲本Z12、Z10、Z7、Z3、Z1、Z9的一般配合力综合排名前6位;产量性状上组合特殊配合力较好的有Z11×Z4、Z3×Z9、Z9×Z5、Z1×Z8、Z9×Z8.主要农艺性状的广义遗传力以角果长度最高,达50.23%;单株角果数最低,仅7.04%.[结论]亲本Z12、Z10、Z7、Z3、Z1、Z9在油菜杂交组合的选配上可重点利用;选育过程中角果长度可进行早期选择,其余性状不宜早期选择.
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基于转录组分析温度诱导黑斑原（Glyptosternummaculatum）选择性剪接的变化
《水产学杂志 》 2022 北大核心
摘要：将采自多雄藏布支流（N29°27'58.72",E 86°54'36.06"）的90尾雌性黑斑原（Glyptosternum maculatum）分为3组，每组30尾：A组为对照组，水温为12℃；B组以2℃/h从12℃下降到4℃；C组以2℃/h上升，达到24℃时，黑斑原濒死时开始实验，利用转录组数据分析黑斑原在温度诱导后的选择性剪接的变化。结果表明：高温组（24℃）、对照组（12℃）和低温组（4℃）处理后，黑斑原肝脏中选择性剪接事件存在互斥外显子（MXE）和外显子跳跃（SE）两种类型；高温和低温处理后选择性剪接事件和基因均明显减少，高温组和低温组分别比对照组减少了16.39%、16.35%和5.17%、6.21%；与对照相比, 24℃和4℃分别有75和32个特有基因高表达。GO分析显示，在24℃时分别有190、88和318个基因富集到生物学过程、细胞定位和分子功能，而4℃分别有101、50和210个基因富集到这3个GO分类中。KEGG分析显示，83和9通路分别显著富集在24℃和4℃，其中通路内质网蛋白质加工和嘌呤代谢在高温组和低温组共有，2个通路中显著差异基因为xdh、papss2、impdh1、polr3h、dnajc1、derl2和dnajc10，其中dnajc1基因在高温组和低温组均差异显著。dnajc1基因属hsp40亚家族成员，生物信息学分析发现dnajc1基因在4℃和12℃中均为1个剪接体，高温处理后产生了2个剪接体，说明dnajc1基因在黑斑原遭遇温度诱导后肝脏通过产生选择性剪接体来保护细胞内的稳态。本研究首次研究了黑斑原应对温度反应的选择性剪接，为了解鱼类应对非生物应激的分子机制提供理论基础。
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