科研产出
西藏牦牛群体遗传多样性及遗传结构分析
《中国草食动物科学 》 2024
摘要：采集西藏地区5个牦牛类群（西藏高山牦牛，类乌齐牦牛，帕里牦牛，斯布牦牛，娘亚牦牛）共49头牦牛的血样，利用全基因组重测序技术对其遗传多样性及遗传结构进行了分析，以期为西藏牦牛遗传资源的保护、开发和利用提供参考。SNP变异检测结果表明，经过滤后得到7 655 923个SNP位点；群体遗传多样性分析发现，西藏地区不同牦牛群体之间的基因杂合度差异并不显著，且均存在不同程度的杂合度下降现象，类乌齐牦牛的观测杂合度最高，为0.336 4；群体结构分析发现，5个牦牛类群之间存在基因交流现象。说明目前西藏牦牛各群体整体存在遗传多样性下降的潜在风险，需要进一步加强群体保种工作，以确保不同品种资源的多样性得到有效保护。
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西藏牦牛乳制品产品开发存在的问题及对策
《食品安全导刊 》 2024
摘要：西藏牦牛不仅是关键的畜牧资源,更是当地居民生产生活的重要依托.开发西藏牦牛乳制品对于推动特色产业发展、丰富市场供应和促进农牧民增收具有重要意义.本文深入探讨了西藏牦牛乳制品产品开发存在的生产技术有限、品牌建设滞后、产品缺乏创新性、产业链不完善以及政策支持不足等问题.并针对这些问题,提出了相应的优化对策,旨在为西藏牦牛乳制品产业的持续健康发展提供理论支撑.
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西藏特色牦牛mtDNA ND1遗传多样性及系统进化分析
《华北农学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：旨在通过mtDNA ND1 探究6 个西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系,为西藏牦牛的遗传多样性、历史演化以及遗传资源保护与利用等提供理论依据.利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、江达牦牛、类乌齐牦牛 6 个群体共 95 头个体ND1 基因蛋白质编码区(CDS)序列,利用DNAMAN、DNASP 5.1、Mega 7.0、Arlequin 3.5.2 等软件分析其序列多态性、单倍型多样性、遗传距离等,并构建单倍型网络图及系统发育树.结果表明,西藏牦牛群体ND1 基因CDS区序列长度均为956 bp,共检测获得78 个变异位点和16种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)及核苷酸多样性(Pi)分别为0.670 和0.004 21,Tajima's D均为负值;根据群体遗传差异的分子方差分析可知,西藏牦牛群体内的变异程度大于群体间变异;斯布牦牛与嘉黎牦牛之间的分化程度较大,其余大部分群体间的分化程度为中等或较弱.此外,通过聚类分析发现,类乌齐牦牛单独聚为一类,而嘉黎牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、江达牦牛先聚为一类,然后再与帕里牦牛聚为一大类;16 种单倍型可分为2 个聚类簇,说明西藏牦牛可能存在2 个母系起源;与其他牛种进行聚类分析,发现家牦牛、爪哇野牛和普通牛可能是西藏牦牛的混合母系起源.西藏牦牛遗传多样性十分丰富,其中类乌齐牦牛遗传多样性最丰富,6 个牦牛群体存在2 个母系起源.
关键词： 西藏牦牛 ND1基因 遗传多样性 系统进化 遗传分化
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基于mtDNA COX3基因对西藏特色牦牛群体遗传结构的分析
《草业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为探究西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系，本研究利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、类乌齐牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、桑日牦牛、江达牦牛7个群体共140头个体的mtDNA COX3基因蛋白质编码区（CDS）序列，利用DNAMAN、DNASP 5.1、MEGA 7.0软件分析了其序列多态性、单倍体多样性，并构建了系统发育树。结果表明，西藏牦牛群体的COX3基因CDS序列长度均为781 bp，共检测获得55个变异位点。在140头个体中共检测出11种单倍型，平均单倍型多样性（Hd）及核苷酸多样性（Pi）分别为0.665和0.00480，说明西藏牦牛具有丰富的遗传多样性。西藏7个牦牛群体可分为2大类，类乌齐牦牛单独聚为一类，其余牦牛群体为一类。此外，11种单倍型可分为2个聚类簇，说明西藏牦牛可能存在两个母系起源。西藏7个牦牛群体可划分到家牦牛、原牛和普通牛三大单倍型群体中，其中Hap＿2、Hap＿3、Hap＿4、Hap＿6、Hap＿7、Hap＿8、Hap＿10、Hap＿11这8个单倍型属于家牦牛支系，Hap＿5和Hap＿9属于原牛和普通牛支系，Hap＿1属于野牦牛支系，说明家牦牛、原牛和普通牛是西藏牦牛的混合母系起源，但受家牦牛影响较大。研究结果旨在为西藏牦牛的演化、遗传多样性以及遗传资源保护和利用提供理论依据。
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西藏牦牛牛支原体的分离鉴定及其生长特性、耐药性分析
《中国农业大学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为确定引起西藏牦牛常发多发肺炎的细菌病原体,采集145份西藏牦牛鼻腔粘液,通过病原分离培养、菌落形态观察、生化试验和PCR鉴定等方法进行细菌检测;通过OD630和pH变化对分离株进行生长曲线测定;采用K-B纸片法进行药物敏感性试验.结果显示:从145份牦牛鼻腔粘液中分离得到10株牛支原体;分离株菌落形态和生化试验结果均符合牛支原体的生物学特性;通过PCR分别扩增得到238bp的uvrC特异性基因与1 500bp16SrRNA基因.10株分离株间的uvrC特异性基因和16SrRNA基因序列同源性较高,均与国际标准株PG45有高度同源性,uvrC特异性基因序列和16SrRNA基因序列与国际标准株PG45的同源性分别为98.4%~100%和99.1%~99.9%.生长曲线测定表明,分离株在PPLO培养基中培养24h内为迟缓期,培养42h后开始进入稳定期,78h后开始进入衰亡期;3个分离株培养物的平均pH随着培养时间延长不断降低,其中24~42h期间pH下降最快,随后下降速度减慢,至78h后几乎不再变化.药物敏感性试验表明,分离株对大环内酯类、氨基糖苷类和林可胺类等药物均存在不同程度的耐药,但对强力霉素和卡那霉素敏感或中度敏感.
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西藏牦牛MyoD1基因多态性及与生长性状的关联性分析
《西南农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】本研究旨在对西藏牦牛MyoD1基因多态性与体高、体重、体斜长、胸围和管围等生长性状进行关联性分析,以期获得对牦牛重要经济性状具有显著效应的遗传标记。【方法】本研究利用DNA池直接测序、PCR-RFLP与生物信息学技术,对西藏帕里(PL)、斯布(SB)、申扎(SZ)和类乌齐(LWQ)4个牦牛类群(品种)共148头个体的MyoD1基因内含子2及外显子3部分序列进行遗传多态性分析,统计基因和基因型频率,进行Hardy-Weinberg平衡性检测,计算纯合度、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数等遗传多态指标,分析不同基因型与体高、体重、体斜长、胸围和管围等生长性状的关联性。【结果】①西藏牦牛MyoD1基因外显子3上存在(C1710T)XmaI酶切位点,多态性检测均存在CC、CT和TT 3种基因型,T/C频率分别为:0.308/0.692、0.400/0.600、0.605/0.395和0.527/0.473,处于中度多态。②适合性检验表明,西藏4个牦牛类群MyoD1基因多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。③利用最小二乘拟合线性模型,对各标记基因型生长发育指标(体高、体斜长、胸围、管围和体重)进行差异显著性检验,申扎牦牛该位点TT和CT基因型在生长性状上差异显著(P<0.05),CT基因型胸围均高于CC和TT基因型。【结论】可以将MyoD1上的C1710T基因座作为牦牛经济性状选育的一个重要遗传标记,用于育种改良。
关键词： 西藏牦牛 MyoD1基因 PCR-RFLP 生长性状 关联分析
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西藏牦牛mtDNA-Cytb及ZFY基因遗传多样性与系统进化分析
《家畜生态学报 》 2019 北大核心
摘要：为进一步了解西藏牦牛的遗传多样性及系统进化关系,通过对申扎、斯布、类乌齐和帕里4个西藏牦牛类群的mtDNA-Cytb基因及ZFY基因部分序列进行克隆及序列分析。结果表明:(1)西藏牦牛Cytb基因全长1 140 bp,共发现SNP位点13个,核苷酸多样性(Pi)为0.00315, Tajima's D值为0.41410(P>0.10),共检出7种单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.709;(2)ZFY基因第11外显子长596 bp,筛查出SNP位点22个,Tajima's D值为0.78287(P>0.10),发现3种单倍型,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0.001066和0.2976;(3)聚类分析及核苷酸同源性分析显示,西藏牦牛与家牦牛的核苷酸同源性最高,与美洲野牛及欧洲野牛的核苷酸同源性次之,与水牛及非洲水牛的核苷酸同源性最低。研究结果表明,西藏牦牛遗传多样性较丰富,进一步支持将西藏牦牛及家牦牛划为牛亚科中独立牦牛属的观点,及牦牛的原始祖先来自于亚欧大陆东北部的观点。
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从帕里牦牛调查数据探讨西藏牦牛产业发展的现状
《草学 》 2017
摘要：本报告通过对帕里牦牛的主产区帕里镇的实地调查发现,帕里牦牛主产区帕里镇主要采用"牧主"式经营模式。调查的40户牧主,每户平均5.6口人,平均代牧6.55户,饲养牦牛125.1头。年出售牦牛3.04头(除自食部分),商品牛出栏率15.93%,户均净收入为2.74万元(人均年收入为0.5944元),是外出季节性打工收入(3 680元)的7.4倍和采挖虫草的(8 000元)的3.42倍,可以看出,牦牛养殖是当地牧民的主要经济收入来源。但是目前牛群的生产力低下,在公母比例为1∶2.16情况下,年平均繁殖率仅为28.52%,8岁以上牦牛头数占总养殖头数的41.51%,年死亡率达8.4%左右。在出栏的937头中,母牛出栏239头,占出栏总数的25.07%。综合分析,加快转变生产方式、培育新型牧民、适度控制养殖规模、建立适合产业化经营与发展的牦牛产业链环节,是牦牛产业真正发展的突破口。
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西藏牦牛遗传多样性的ISSR分析
《生态学杂志 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：选用10对ISSR引物对西藏地区17个牦牛类群(或品种)共850头牦牛进行了PCR扩增,利用Popgen 32软件对数据进行统计分析。结果表明:10对ISSR引物共扩增出134条条带,其中多态性条带132条,多态性比率为95%,扩增片段的大小范围在200~2000bp。17个牦牛类群的平均有效等位基因数为1.498,Nei遗传多样性指数平均值为0.294,平均Shannon多样性指数为0.449,各位点遗传多样性存在一定差别,说明17个西藏牦牛类群具有丰富的遗传多样性。聚类结果表明,西藏牦牛大致分为3类:错那牦牛、江达牦牛、工布江达牦牛、康布牦牛、巴青牦牛、类乌齐牦牛、桑桑牦牛、嘉离牦牛、斯布牦牛和隆子牦牛聚为1类;丁青牦牛、聂荣牦牛、帕里牦牛、日多牦牛、桑日牦牛和申扎牦牛聚为1类;仲巴牦牛单独聚为1类。聚类分析结果与牦牛的地理分布大体一致。
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