科研产出
西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性及系统进化分析
《家畜生态学报 》 2014 北大核心
摘要：为从分子水平上探究西藏牦牛的序列多态性、遗传多态性及其系统进化关系,对西藏15个牦牛类群150个个体的mtDNA ND6基因全序列进行了测定,确定了多态位点和单倍型数目,计算了单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi),并构建了分子聚类关系图和单倍型系统发育树。结果表明:西藏牦牛mtDNA ND6基因全序列长度均为528bp,T、C、A和G 4种碱基的平均比例分别为42.2%、7.6%、20.9%、29.3%,存在一定的碱基组成偏倚性。序列变异中存在转换、颠换2种核苷酸变异类型,其中转换37次,颠换2次,表现出较强的转换偏倚性。根据序列间核苷酸变异共确定7种单倍型,其中Hap_1为西藏牦牛类群的主流单倍型,其余6种单倍型为部分类群所特有。平均单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.2978、0.00191,揭示西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性较贫乏。根据遗传距离构建了分子聚类关系图,表明西藏15个牦牛类群可分为2大类;根据7种单倍型序列构建了单倍型系统发育树,表明西藏牦牛存在2个母系起源。
关键词： 西藏牦牛 mtDNA ND6基因 遗传多样性 系统进化
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菌肥对青稞根际土壤理化性质以及微生物群落的影响
《土壤学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：应用化学分析、聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术和DNA测序技术,研究了西藏棕色砂壤土中微生物肥料不同施用量和施用期对青稞根际土壤理化性质和细菌群落多样性的影响。结果表明,施用谷特菌肥能显著提高土壤全氮、全磷、全钾、有机质、碱解氮、有效磷和速效钾的水平,如播前施用菌肥浓度750 ml hm-2的处理较不施用菌肥的处理上述指标分别提高13.32%、28.42%、16.20%、9.81%、21.36%、39.35%和30.48%,拔节期施用菌肥浓度2 250 ml hm-2的处理较不施用菌肥的处理分别提高7.25%、29.35%、18.04%、12.86%、15.90%、43.27%和53.99%。DGGE分析表明,相同施用方式中不同施用量土样中微生物的DGGE图谱相似。非加权组平均法(UPGMA)聚类分析将DGGE图谱分为2大类群。Shannon-Wiener指数表明,施用菌肥的土壤细菌多样性先增加后逐渐降低,播前以喷施谷特菌浓度750 ml hm-2时的细菌多样性最高;拔节期则以喷施谷特菌浓度2 250 ml hm-2处理的细菌多样性最高,且两种施用方式土壤养分的释放与Shannon指数的变化规律均为播前﹥拔节期。测序结果表明,不同施肥浓度土样微生物种群分布较为广泛,其中Actinobacteria纲细菌种类略多,少数菌种为未经培养菌种(Uncultured bacterium)。典型对应分析(CCA)表明,DGGE图谱条带分布与土壤理化性质密切相关,碱解氮、全磷和全氮是影响微生物群落的主要环境因子。研究结果表明,施用谷特菌肥可明显改善青稞根际土壤理化性状,提高土壤细菌多样性。
关键词： 菌肥 根际土壤 理化指标 PCR-DGGE 微生物多样性
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青藏区主要青稞品种淀粉理化特性分析
《食品研究与开发 》 2014 北大核心
摘要：以青藏区主要青稞品种藏青25、冬青8号、藏青148、喜拉19、昆仑12号、藏青320、北青6号为材料,采用湿法提取淀粉,对青稞淀粉理化特性进行分析。结果表明,7种青稞淀粉颗粒多为圆饼状,表面光滑;其偏光十字形状及明显程度差异不大,十字交叉点都接近于淀粉颗粒的中心位置,呈"X"形;平均粒径为18.30μm~20.17μm,其中藏青148的淀粉颗粒粒径最小,冬青8号的最大;直链淀粉含量由高到低依次为:冬青8号>昆仑12号>藏青320>藏青148>喜拉19>北青6号>藏青25,具有显著性差异;淀粉糊的透明度和热糊稳定性均较好。
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GC-MS/MS法测定蔬菜中16种邻苯二甲酸酯
《中国卫生检验杂志 》 2014 北大核心
摘要：目的建立同时检测蔬菜中16种邻苯二甲酸酯(PAEs)的气相色谱-串联质谱(GC-MS/MS)分析方法。方法样品用乙腈提取并旋蒸后经玻璃Florisil柱净化,采用DB-5MS色谱柱程序升温分离,选择多反应监测模式(MRM)测定。结果在本试验条件下,16种PAEs分离较好,该法检出限为0.05μg/L~0.3μg/L,定量限为0.15μg/L~0.9μg/L,检测质量浓度线性范围为0.02μg/L~2.0μg/L,相关系数均>0.994,16种PAEs的加标回收率为92.1%~112.5%,相对标准偏差为1.8%~6.7%。结论该法操作简单、可靠,可用于蔬菜中多种PAEs的确证与定量检测。
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速康解毒口服液在试验大鼠体内药代动力学研究
《中国畜牧兽医 》 2014 北大核心
摘要：为比较速康解毒口服液以口服和肌肉注射2种方式给药后大鼠血浆内解毒水剂各组分的浓度,探明速康解毒口服液在体内的动力学特征,试验将28只试验大鼠随机分为7组,以口服、肌肉注射2种方式给药,用紫外可见分光光度法测定给药后不同时间各组分的血药浓度,计算解毒水剂各组分的药代动力学参数。结果表明解毒水剂各组分在大鼠体内的血药浓度—时间过程可用吸收的二室模型来描述,口服给药后各组分的最大血药浓度分别为正磷酸钠8039.455μg/mL,酵母甘露聚糖129.932μg/mL,硫酸镁3358.328μg/mL,L-鼠李糖2296.330μg/mL。正磷酸钠、硫酸镁、酵母甘露聚糖、L-鼠李糖口服后的Tp分别为1.2816、1.4201、1.1337、0.9469h;肌肉注射Tp分别为1.2856、1.4684、1.1079、1.1671h。试验结果表明速康解毒口服液各组分给药后很快进入血液,口服和肌肉注射给药差别不大,但口服给药作用时间相对较长,给药方式较肌肉注射方便。
西藏牦牛mtDNA 16S rRNA基因的克隆及其遗传多样性分析
《基因组学与应用生物学 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：本研究首次通过克隆、测序获得了11个西藏牦牛类群共111头个体的mtDNA 16S rRNA基因全序列,并分析了西藏牦牛的遗传多样性、分类关系、起源和分化,为进一步保护和合理利用西藏牦牛遗传资源以及探讨牦牛类群的划分提供分子依据。结果表明:西藏牦牛16S rRNA基因全序列长度为1 571 bp或1 570 bp(LWQ4);G+C平均含量37.8%,具有明显的碱基偏倚性;平均核苷酸多样性(Pi)为0.002 91,平均单倍型多样性(Hd)为0.8501±0.0009,111个样本共发现48种单倍型并聚为2簇,表明西藏牦牛具有较高的遗传多样性并存在2个母系起源;Kimura双参数遗传距离范围为0.000 98~0.006 94,11个西藏牦牛类群划分为2大类:嘉黎牦牛、巴青牦牛、丁青牦牛、工布江达牦牛、帕里牦牛、斯布牦牛、康布牦牛、桑桑牦牛、江达牦牛、桑日牦牛为一类,类乌齐牦牛单独为一类。本研究发现类乌齐牦牛具有较丰富的遗传多样性,并且发现了一个序列特异个体LWQ4,需要对其进行更深入的研究。牛种间的聚类结果显示,西藏牦牛与美洲野牛的亲缘关系最近,与普通牛、水牛的亲缘关系相对较远,本研究支持将牦牛从牛属(Bos taurus)中分离出来,作为一个独立的牦牛属(Poephagus)的观点。
关键词： 西藏牦牛 16S rRNA基因 遗传多样性
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青稞法尼基转移酶β亚基编码基因HbERA1的克隆及表达分析
《麦类作物学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：ERA1(Enhanced response to ABA)基因编码法尼基转移酶(Farnesyl transferase)β亚基,该酶在干旱胁迫下对ABA信号负向调控因子的修饰起着关键作用。本研究以青稞(Hordeum vulgare subsp.vulgare)抗旱品种喜马拉雅10号为材料,利用RT-PCR技术克隆获得了ERA1基因全长cDNA序列,命名为HbERA1(登录号:KJ699392)。生物信息学分析表明,该基因全长1 401bp,可编码466个氨基酸序列,蛋白分子量为51.14kD,等电点为5.00。Prosite Scan分析结果表明,HbERA1含有多个干旱胁迫响应蛋白的作用位点,如酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、N-糖基化位点、蛋白激酶C磷酸化位点及N-豆蔻酰化位点。利用实时定量PCR方法研究了HbERA1在干旱胁迫条件下及复水后不同时间点的表达情况,发现在水分过剩处理下(土壤绝对含水量>15.5%),HbERA1在土壤绝对含水量为33.4%时表达量最高,并随着土壤绝对含水量的下降而下调表达;进行干旱胁迫后(<15.5%)基因表达量也明显下调表达;复水后表达逐渐恢复,复水8h时超过正常表达水平,表明HbERA1基因可能参与调控水涝和干旱胁迫双重信号传导。
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KAP6.3基因与西藏绒山羊生产性状关系的研究
《家畜生态学报 》 2014 北大核心
摘要：研究采用PCR-SSCP及DNA测序技术,对西藏绒山羊KAP6.3基因编码区和3'-UTR区进行多态性检测;利用SPSS13.0软件对发现的多态位点与体尺和产绒性能进行了相关性分析。结果发现,西藏绒山羊KAP6.3基因扩增区存在7个SNPs,分别为C134T、G148A、G170A、T210C、A217G、A229C和T284G。分别导致了Cys30Tyr、Ser51Pro、Tyr53Cys和Tyr57Ser共4处错义突变。数据统计结果表明,母羊在体高、十字部高等体尺性状方面显著优于公羊(P<0.05),而公羊在产绒性能如毛长和产绒量方面显著高于母羊(P<0.05)。由此可见,KAP6.3基因可能是影响西藏绒山羊生产性能的主效基因或与之紧密连锁,可作为西藏绒山羊生产性状的辅助选择标记。
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西藏绒山羊本品种选育效果研究
《畜牧与兽医 》 2014 北大核心
摘要：针对西藏绒山羊种质下降、个体明显变小、产绒量相对较低等突出问题,选择产绒量高和体重大的西藏绒山羊公羊对第一核心群和第二核心群进行本品种选育,测量核心群的生长性状和绒品质指标来检验其选育效果。结果表明:选育后代在羊绒品质保持优质的情况下,对第一核心群选育后,周岁及2岁公母羊的产绒量极显著提高(P<0.01),增长率从11.88%~18.00%;对第二核心群选育后,体高、体长、胸围、体重等重要体尺指标均高于选育前,而日土县2岁公羊选育后体重增长尤其明显(P<0.05)。
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