文献类型: 中文期刊
作者: 海汀 1 ; 柴志欣 1 ; 张成福 2 ; 信金伟 2 ; 姬秋梅 2 ; 曾贤彬 1 ; 钟金城 1 ;
作者机构: 1.西南民族大学动物遗传育种学国家民委/教育部重点实验室
2.西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所
关键词: 西藏牦牛;mtDNA ND6基因;遗传多样性;系统进化
期刊名称: 家畜生态学报
ISSN: 1673-1182
年卷期: 2014 年 35 卷 11 期
页码: 11-17
收录情况: 北大核心
摘要: 为从分子水平上探究西藏牦牛的序列多态性、遗传多态性及其系统进化关系,对西藏15个牦牛类群150个个体的mtDNA ND6基因全序列进行了测定,确定了多态位点和单倍型数目,计算了单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi),并构建了分子聚类关系图和单倍型系统发育树。结果表明:西藏牦牛mtDNA ND6基因全序列长度均为528bp,T、C、A和G 4种碱基的平均比例分别为42.2%、7.6%、20.9%、29.3%,存在一定的碱基组成偏倚性。序列变异中存在转换、颠换2种核苷酸变异类型,其中转换37次,颠换2次,表现出较强的转换偏倚性。根据序列间核苷酸变异共确定7种单倍型,其中Hap_1为西藏牦牛类群的主流单倍型,其余6种单倍型为部分类群所特有。平均单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.2978、0.00191,揭示西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性较贫乏。根据遗传距离构建了分子聚类关系图,表明西藏15个牦牛类群可分为2大类;根据7种单倍型序列构建了单倍型系统发育树,表明西藏牦牛存在2个母系起源。
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