科研产出
西藏4个绵羊品种SNP基因分型及群体结构分析
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：藏系绵羊分布范围广泛，品种资源丰富，目前主要分为三大类群，但藏系绵羊群体结构不清。为分析藏系绵羊SNP位点及群体结构，实验利用Illumina Ovine SNP 600K商业化芯片对西藏阿旺绵羊、岗巴绵羊、多玛绵羊和霍尔巴绵羊等150只藏系绵羊进行了SNP基因分型，并通过PCA和NJ-tree等方法分析了藏系绵羊群体结构。SNP质控结果表明，共有147个个体符合质控条件，共获得456 418个SNP位点。群体结构分析表明，西藏地区的岗巴绵羊、多玛绵羊和霍尔巴绵羊分别聚为一类，而其他地区的藏系绵羊混乱聚集在一起。本实验研究结果为今后西藏当地绵羊遗传资源的鉴定和保护开发利用提供了理论基础和参考依据。
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不同海拔藏绵羊肉质脂肪酸特征分析
《中国农业科技导报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为明确自然放牧条件下不同海拔藏绵羊肉质脂肪酸含量及组成特征，选择高（4 500 m）、中（3 500 m）、低（2 500 m）海拔藏绵羊各6只（3岁母羊），测定其背最长肌、前腿肌和后腿肌中的脂肪酸组成及含量。结果表明，不同海拔藏绵羊脂肪酸组成及含量存在显著差异，其中，肉豆蔻酸（C14∶0）在低海拔藏绵羊不同肌肉组织中含量最低；油酸（C18∶1n9c）在低海拔藏绵羊不同肌肉组织中含量最高，并显著高于中、高海拔。不同肌肉组织中的多不饱和脂肪酸（polyunsaturated fatty acid, PUFA）与饱和脂肪酸（saturated fatty acid, SFA）的比值（P/S）在0.168～0.504之间，其中高海拔藏绵羊背最长肌的P/S值显著高于中、低海拔。由此表明，藏绵羊不同肌肉组织中脂肪酸的组成除高海拔区背最长肌外，低海拔更具优势，即生长在低海拔的藏绵羊具有更好的食用价值及生产高档羊肉的潜力。
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燕麦sHSP基因家族的鉴定及其响应高温及老化的表达分析
《草业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：小热激蛋白（sHSPs）是植物体中普遍存在的由核基因编码的一类蛋白，具有保守的ACD结构域，能够在高温、干旱以及老化等胁迫刺激中发挥重要作用。本研究利用生物信息学方法在燕麦基因组中鉴定得到24个HSP20(AsHSP20.1～AsHSP20.24)基因，并对AsHSP20家族成员的理化性质、蛋白结构、亚细胞定位、系统进化、保守基序和保守结构域、基因染色体位置以及响应高温及老化基因的表达等进行系统分析。研究发现AsHSP20基因分布在17条染色体上。编码氨基酸数目136～529 aa，分子量大小14.9～58.1 kDa，理论等电点5.30～8.79。HSP20成员多定位在核、胞质和叶绿体上，部分定位在质膜、线粒体、过氧化物酶体以及胞外。蛋白质二级结构和三级结构分析表明AsHSP20成员确定有β-折叠结构。根据保守基序组成与系统发育关系分析，AsHSP20基因家族被分为11个亚组，同一亚组成员之间具有相似或相同的保守基序，表明这些蛋白之间具有功能的相似性。进一步分析自然老化和人工老化处理下AsHSP20基因的表达情况，结果表明AsHSP20.20、AsHSP20.24基因在自然老化处理与人工老化处理下共同下调表达，推测AsHSP20.20和AsHSP20.24在两种老化方法下共同参与调控燕麦种子活力降低的过程，可作为燕麦种子寿命及抗老化种质育种研究的候选基因。研究为AsHSP20基因家族在燕麦种质老化过程中的调控机制提供了有价值的信息，也为进一步探究燕麦HSP20基因的功能及种子抗衰老分子机制提供了理论支撑。
关键词： 燕麦 种子老化 HSP20基因家族 系统进化 表达分析
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牦牛源A型产气荚膜梭菌的分离鉴定及生物学特性研究
《中国畜牧兽医 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]2023年4月至2023年5月,西藏拉萨市多地出现牦牛严重腹泻、便血甚至死亡的现象.试验旨在确定牦牛腹泻的病原菌并研究其生物学特性,以期为该地区牦牛腹泻病的防治提供参考.[方法]采集新鲜牦牛腹泻粪便样品进行厌氧培养,通过培养特性及染色镜检进行初步鉴定;对可疑阳性菌株进行生化特性、多重PCR毒素基因分型及cpe、netB、cpb2毒素鉴定,并进行cpa、cpb2、16S rRNA基因的遗传进化分析、部分分离株生长曲线测定及动物致病性试验;采用K-B法测定分离株的体外药物敏感性,统计不同分离株的多重耐药结果.[结果]从样品中分离纯化得到8株分离菌,在厌氧培养基中生长旺盛,在TSC培养基、5%脱纤维绵羊血平板、卵黄琼脂培养基上均呈现与产气荚膜梭菌相似的典型菌落,革兰染色为紫色大杆菌,初步判定为产气荚膜梭菌,命名为XZ-1~XZ-8.分离株生化检测结果与产气荚膜梭菌相符;分离株均携带cpa和cpb2基因,为A型产气荚膜梭菌;16S rRNA基因分析结果显示,8株分离株与产气荚膜梭菌参考株的相似性为97.3%~100%,在系统进化树中处于同一分支,而与屎肠球菌、大肠杆菌参考株处于不同分支;分离株cpa和cpb2基因存在一定的变异性.生长曲线显示,3株分离株(XZ-1、XZ-4、XZ-7)生长规律基本一致,其中0~4 h为迟缓期,4~8 h为对数期,8~22 h为稳定期,22 h后开始进入衰亡期.动物致病性试验结果显示,分离株对昆明小鼠具有较强的致病性.分离株对苯唑西林、红霉素、氯霉素、氧氟沙星、米诺环素、头孢哌酮、利福平及罗红霉素敏感,对青霉素、哌拉西林、羧苄西林、麦迪霉素、头孢曲松等22种药物均存在不同程度的耐药性,存在多重耐药性,其中XZ-7株耐药数量多达11种,6重以上耐药的菌株占75.0%.[结论]本研究成功从拉萨严重腹泻、血便牦牛粪样中分离出8株A型产气荚膜梭菌,分离株对小鼠具有较强的致病性,对青霉素、哌拉西林、羧苄西林等药物存在不同程度的耐药性.研究结果为该地区牦牛腹泻病防控提供了参考依据.
关键词： 牦牛 产气荚膜梭菌 分离鉴定 生长曲线 动物致病性 耐药性
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肝片吸虫检测方法概述
《动物医学进展 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：肝片吸虫是一种人兽共患寄生虫,是目前全世界分布最广泛的吸虫之一,能感染包括人在内的多种哺乳动物,引起肝片吸虫病,不仅严重危害人类健康,还影响畜牧养殖业的发展,造成巨大的经济损失.肝片吸虫因其复杂的生活史和种类广泛的中间宿主和终末宿主,导致其致病机制尚不明确,且肝片吸虫感染引起的动物临床症状与其他肝胆疾病类似,主要表现为急性或慢性肝炎和胆管炎,没有特征性症状,极易被误诊.因此,及时、准确的检测对防治肝片吸虫病尤为重要.目前,肝片吸虫的检测主要依赖病原学、免疫学、分子生物学等手段,论文就肝片吸虫检测方法的研究进展进行综述,分析各项技术的优点与局限性,以期为肝片吸虫病检测方法的研究和发展提供参考.
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不同菌种对芫根发酵液风味物质及抗氧化性能的影响
《食品与发酵工业 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：芫根具有显著的抗氧化、抗缺氧、降糖降脂等功效，市场前景广阔，但其发酵产品研究较少。基于电子鼻、电子舌及顶空-固相微萃取-气质联用(headspace-solid-phase microextraction-gas chromatography-mass spectrometry, HS-SPME-GC-MS)比较了4种不同菌种(LL-6-1:植物乳杆菌，CD5:副干酪乳杆菌，J1M5:发酵乳杆菌，J4-1:马克斯克鲁维酵母菌)发酵对芫根发酵液风味物质的影响，采用酶比色法测定DPPH自由基、羟自由基、超氧阴离子自由基清除率及总抗氧化能力。电子鼻、电子舌和HS-SPME-GC-MS结果均表明4种不同菌种芫根发酵液风味物质之间存在差异。HS-SPME-GC-MS在4种芫根发酵液中共检测出92种挥发性物质，包括醇类、酚类、醚类、醛类、酸类、酮类、酯类及其他类。通过电子鼻与HS-SPME-GC-MS结果的Pearson相关分析筛选出11种差异挥发性物质，其中3-甲基-1-丁醇、乙醇、乙酸戊酯、1-丁烯-4-异硫氰酸酯、苯乙醇、4-乙基-苯酚等为发酵液形成不同风味的主要物质基础。抗氧化结果表明J4-1菌种芫根发酵液具有较好的DPPH自由基、羟自由基清除能力，且总抗氧化能力较强。
关键词： 芫根 发酵液 顶空-气相色谱-质谱 风味物质 抗氧化
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物理协同酶法处理对青稞淀粉结构的影响
《食品工业科技 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为研究物理协同酶法处理对青稞淀粉结构特性的影响,采用超声、压热协同普鲁兰酶对青稞淀粉进行处理,测定了处理后样品的颗粒形貌、晶体结构、官能团结构、粒径大小.试验结果表明,处理可以提高抗性淀粉和直链淀粉含量,降低支链淀粉的含量.改性处理使青稞淀粉颗粒的原始结构遭到了严重破坏,呈现出团状结构,表面粗糙,布满褶皱、裂纹和孔洞;淀粉的偏光十字消失.改性后的青稞淀粉表面积平均粒径增大,大颗粒数目增加.物理协同酶法处理增加了青稞淀粉的结晶度,晶型由A型晶体向B型转变.改性处理没有产生新的化学基团和化学键,只是改变了青稞淀粉内部结构的重新排列.此外与青稞原淀粉相比,改性青稞淀粉的有序度(DO)值增大,其中普鲁兰酶处理后的青稞淀粉的DO比值最大.改性处理使青稞原淀粉颗粒中的淀粉分子分解成小分子又重新结晶,形成的改性青稞淀粉含有更加致密的大淀粉晶体.
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基于子图选择的土种识别-以重庆市璧山区紫色土为例
《重庆师范大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：针对机器视觉野外自然条件下采集土壤图像包含阴影、空洞、缝隙等可能对土种识别产生影响的因素，和土壤图像采集、标记成本高，样本量小的问题，提出一种基于土壤子图选择的土种识别方法。该方法以局部阴影最小化及空间距离最大化为准则，构造最优化模型；并基于最大最小距离算法思想，迭代更新距离矩阵求解优化模型，获得选择子图中心点，构建土壤子图数据集。实验结果显示：土壤子图选择算法构建的数据集在3个不同深度ResNet模型下训练、识别测试，均有较好的训练、识别精度；在土壤子图选择α参数为1、子图尺寸为224时，在浅层网络ResNet-18下能达到最佳测试结果，训练的网络模型在验证集识别准确率为92.48%,测试集识别准确率为92.95%,相较于土壤原图数据集的最佳土种识别结果提升46.65%;利用最小外接矩阵能加速相较于不使用加速，子图选择算法提升运算速度38.88%。基于子图选择的土种识别大幅度提升了土种识别准确率，证明算法是有效的。
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西藏高寒地区冷季圈舍环境参数及其与舍饲牦牛增重的关系
《中国草地学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为深入了解西藏高寒地区冷季圈舍环境参数及其与舍饲牦牛增重的关系，本研究在拉萨市的林周县、当雄县和尼木县典型牦牛养殖场，分别随机挑选20头牦牛于1～3月进行为期79 d的全舍饲饲养，并监测牛舍内温度、湿度及CO2、PM2.5和PM10浓度等环境参数和牦牛日增重。结果表明：试验期内，3县牛舍内温度、湿度差异显著，尼木县牛舍内平均温度和湿度最高，分别为3.96℃和38.19%，林周县分别为1.50℃和25.33%，当雄县分别为-3.83℃和36.21%；尼木县牛舍内CO2浓度最高（961.19 mg/m~3），当雄县次之（879.35 mg/m~3），林周县最低（837.65 mg/m~3）;PM2.5和PM10浓度为林周县最高，尼木县次之，当雄县最低。各县牛舍内1～3月温度呈上升趋势，其他环境参数变化趋势不一致。各县牦牛日增重存在显著差异，其中尼木县最高（587.91 g/d），当雄县次之（321.53 g/d），林周县最低（262.14 g/d）。回归分析表明，牦牛日增重与牛舍内温度、CO2浓度存在正相关关系，与湿度、PM2.5和PM10浓度无直接关系。由以上结果可见，在冷季漫长的西藏高寒地区改善牛舍环境有益于提高牦牛生产性能。
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