科研产出
基于分子动力学模拟的青稞直链淀粉-肉桂醛复合物形成机制研究
《粮食与油脂 》 2023 北大核心
摘要：采用分子动力学模拟技术对青稞直链淀粉-肉桂醛复合物复合前后的构象进行模拟，并对青稞直链淀粉及其复合物的均方根偏差、旋转半径、氢键数、相互作用势能、溶剂可及表面积变化差异进行比较分析；采用主成分分析法（PCA）绘制青稞直链淀粉-肉桂醛体系不同构象的自由能曲面图，并得出该复合物的结构。结果表明：在复合物形成过程中，青稞直链淀粉与肉桂醛间氢键个数在60 ns时最多，复合物旋转半径在30 ns时达到最大；与青稞直链淀粉相比，青稞直链淀粉-肉桂醛复合物中的范德华势能明显高于自身的氢键势能，均方根偏差更大，且溶剂可及表面积下降幅度大；青稞直链淀粉-肉桂醛复合物的自由能最低区域显示青稞直链淀粉分子和肉桂醛分子分别由各自独立状态复合为整体球状包合物；青稞直链淀粉与肉桂醛复合物结构是由2条淀粉链将肉桂醛分子紧密包裹形成的1个稳定球状结构。
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拉萨长期不同施肥青稞田土壤固氮菌分离鉴定
《麦类作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为寻找拉萨青稞田自生固氮菌，丰富当地固氮菌资源，以减少化肥使用量，降低环境负效应，本研究从6种长期不同施肥模式定位试验的青稞田土壤中进行固氮菌的分离、纯化，观察其菌落形态特征并测定各菌株的固氮酶活性，通过16S rDNA基因测序和构建系统发育树分析了各菌株的分类学地位。结果显示，通过分离和纯化，共得到自生固氮菌50株，其中13株菌具有高效固氮酶活性，分别属于假食酸菌属（Pseudacidovorax）、芽孢杆菌属（Bacillus）、红球菌属（Rhodococcus）、农杆菌属（Agrobacterium）。施用化肥会减少土壤中高效固氮菌种类，不施化肥或施用有机肥能丰富土壤中高效固氮菌种类。
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顺9，反11-共轭亚油酸对奶牛乳腺上皮细胞氧化应激损伤的影响研究
《中国畜牧杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：试验旨在研究顺9，反11-共轭亚油酸（c9,t11-CLA）对H_2O_2诱导的奶牛乳腺上皮细胞（BMECs）氧化损伤的保护作用。将分离纯化后的BMECs用不同的H_2O_2浓度和作用时间培养，以建立细胞氧化损伤模型；再在培养基中添加不同浓度（0、200、400、600、800μmol/L）的c9,t11-CLA培养BMECs 24 h，以确定c9,t11-CLA适宜的添加浓度；通过前期结果选用浓度为600μmol/L的H_2O_2和100μmol/L的c9,t11-CLA进行后续试验。试验设置3个组，分别为对照组、H_2O_2组、c9,t11-CLA+H_2O_2组，每组6个重复。对照组只用DMEM/F12基础培养基；H_2O_2组在基础培养基处理24 h后，再用600μmol/L H_2O_2培养细胞8 h;c9,t11-CLA+H_2O_2组在基础培养基中添加100μmol/L c9,t11-CLA处理24 h后，再用600μmol/L H_2O_2培养细胞8 h。试验对细胞内的丙二醛（MDA）活性、总抗氧化活性（T-AOC）、谷胱甘肽过氧化物酶（GSHPx）活力、超氧化物歧化酶（SOD）活性、过氧化氢酶（CAT）活性等指标进行检测，并用RT-PCR法测定细胞的SOD、CAT和GSH-Px的mRNA表达量。结果表明：与对照组相比，H_2O_2组的T-AOC活力（P<0.05）及SOD、CAT、GSH-Px活性（P<0.01）均下降，MDA含量上升（P<0.05），抗氧化酶SOD、CAT和GSHPx的mRNA表达量下降（P<0.05）。与H_2O_2组相比，c9,t11-CLA+H_2O_2组BMECs的SOD、CAT和GSHPx活性（P<0.05）及其基因的mRNA表达量（P<0.05）均有提高，MDA含量降低（P<0.05）。由此可见，c9,t11-CLA可以提高H_2O_2诱导的奶牛乳腺上皮细胞的抗氧化能力，为奶牛乳腺抗氧化剂的选择提供数据支撑。
关键词： 顺9,反11-共轭亚油酸 奶牛乳腺上皮细胞 氧化损伤
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西藏特色牦牛mtDNA ND1遗传多样性及系统进化分析
《华北农学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：旨在通过mtDNA ND1 探究6 个西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系,为西藏牦牛的遗传多样性、历史演化以及遗传资源保护与利用等提供理论依据.利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、江达牦牛、类乌齐牦牛 6 个群体共 95 头个体ND1 基因蛋白质编码区(CDS)序列,利用DNAMAN、DNASP 5.1、Mega 7.0、Arlequin 3.5.2 等软件分析其序列多态性、单倍型多样性、遗传距离等,并构建单倍型网络图及系统发育树.结果表明,西藏牦牛群体ND1 基因CDS区序列长度均为956 bp,共检测获得78 个变异位点和16种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)及核苷酸多样性(Pi)分别为0.670 和0.004 21,Tajima's D均为负值;根据群体遗传差异的分子方差分析可知,西藏牦牛群体内的变异程度大于群体间变异;斯布牦牛与嘉黎牦牛之间的分化程度较大,其余大部分群体间的分化程度为中等或较弱.此外,通过聚类分析发现,类乌齐牦牛单独聚为一类,而嘉黎牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、江达牦牛先聚为一类,然后再与帕里牦牛聚为一大类;16 种单倍型可分为2 个聚类簇,说明西藏牦牛可能存在2 个母系起源;与其他牛种进行聚类分析,发现家牦牛、爪哇野牛和普通牛可能是西藏牦牛的混合母系起源.西藏牦牛遗传多样性十分丰富,其中类乌齐牦牛遗传多样性最丰富,6 个牦牛群体存在2 个母系起源.
关键词： 西藏牦牛 ND1基因 遗传多样性 系统进化 遗传分化
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西藏羊卓雍错高原裸鲤肠道寄生蠕虫的群落生态
《水生生物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为研究西藏羊卓雍错Yamdrok Lake高原裸鲤肠道寄生蠕虫的群落生态,探索寄生虫与西藏高原环境和独特的鱼类宿主三者之间的相互关系,以肠道寄生蠕虫为对象,于2020年7月对180尾高原裸鲤Gymnocypris waddellii [雌性120尾,雄性60尾,全长22.20—49.20 cm,平均全长（36.76±4.18） cm,体重77.3—896.7 g,平均体重（425.92±148.27） g]进行了剖检,对群落结构和种间关系等群落生态进行了分析。羊卓雍错高原裸鲤肠道寄生蠕虫群落由5个物种构成,分别为聂氏似短节绦虫Parabreviscolex niepini、对盲囊线虫Contracaecum eudyptulae、束首线虫未定种Streptocara sp.、新棘吻虫未定种Neoechinorhynchus sp.和异肉吸虫未定种Allocreadium sp.。感染率从高到低依次为新棘吻虫未定种、聂氏似短节绦虫、异肉吸虫未定种、对盲囊线虫和束首线虫未定种。平均丰度从高到低依次为聂氏似短节绦虫、新棘吻虫未定种、束首线虫未定种、异肉吸虫未定种和对盲囊线虫。群落的Margalef物种丰富度指数为0.59, Shannon-Wiener多样性指数为1.26, Pielou均匀度指数为0.83, Berger-Parker优势度指数为0.50,优势物种为聂氏似短节绦虫。有4组物种间存在正关联,关联性从高到代依次为:新棘吻虫未定种与异肉吸虫未定种、对盲囊线虫与新棘吻虫未定种、对盲囊线虫与异肉吸虫未定种、对盲囊线虫与束首线虫未定种。其他寄生蠕虫物种两两不存在种间关联。从感染与否看,被感染的宿主数量超过采样群体宿主数量的一半,其中,以感染1种寄生虫的宿主出现频次最高,感染2种寄生虫的宿主出现频次也较高, 3种和4种寄生虫共同感染的宿主出现频次明显降低,未发现5种寄生虫同时感染的宿主。与同位于西藏南部,并曾经相连的哲古措Chugutso Lake相比,两个湖泊尽管地理位置相近,宿主鱼类种类相同,寄生蠕虫物种组成一致,但羊卓雍错高原裸鲤肠道寄生蠕虫群落具有自身特点,即更高的平均丰度,绝大部分寄生蠕虫种群也具有更高的感染率,群落中的优势物种也与哲古措不同。种间关联被用来判断肠道寄生蠕虫群落中各种群两两间是否存在共存或排斥关系,即种间亲和性。在羊卓雍错高原裸鲤肠道寄生蠕虫群落中,新棘吻虫未定种与异肉吸虫未定种种间亲和性最高。但这种关系并不稳定,会随着水生态环境和群落中物种组成等的变化而变化。共感染的宿主出现频次变化提示,随着一个亚群落中物种数的增加,种间的相互作用越大,保持共存也越难。
关键词： 群落生态 寄生蠕虫 群落结构 种间关系 羊卓雍错 高原裸鲤 西藏
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牦牛骨骼肌中特异基质金属蛋白酶及其功能相关基因的表达分析
《中国畜牧兽医 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】筛选并鉴定在牦牛骨骼肌中特异表达的基质金属蛋白酶（matrix metalloproteinases, MMPs）家族成员及其功能相关基因，以期为研究牦牛骨骼肌结构形成机制提供依据。【方法】采集成年公牦牛臀肌和胸肌，利用组织化学染色法（HE和Masson）分析肌纤维特征和胶原纤维数量；通过实时荧光定量PCR鉴定MMPs和基质金属蛋白酶抑制因子（TIMPs）的mRNA表达量；采用Western blotting技术和免疫组织化学法分析MMPs、Ⅰ和Ⅲ型胶原蛋白的表达量和组织分布；通过STRING网站分析MMPs及其功能相关基因之间的蛋白质互作网络；采用EnzChekTM明胶酶/胶原酶试剂盒检测牦牛臀肌和胸肌中明胶酶/胶原酶的酶活性差异。【结果】Masson染色和实时荧光定量PCR分析结果显示，牦牛臀肌中胶原纤维面积、MMP-2和MMP-14基因表达量显著低于胸肌（P＜0.05）,TIMP-3基因在牦牛臀肌中表达量显著高于胸肌（P＜0.05）。Western blotting鉴定发现，MMP-3、MMP-14、Ⅰ和Ⅲ型胶原蛋白在牦牛臀肌中的表达量极显著或显著低于胸肌（P＜0.01;P＜0.05）。免疫组织化学法分析显示，MMP-2、MMP-9、MMP-14和Ⅰ型胶原蛋白在牦牛臀肌中的表达量显著或极显著低于胸肌（P＜0.05;P＜0.01）,而MMP-16在牦牛臀肌中的表达量显著高于胸肌（P＜0.05）。蛋白质功能相关性聚类分析表明，MMP-2、MMP-14、MMP-16、TIMP-2、TIMP-3、COL1A2和COL3A1可聚为一簇，MMP-3、MMP-9和TIMP-1可聚为一簇；臀肌和胸肌中明胶酶/胶原酶的酶活性变化趋势一致，且差异不显著（P＞0.05）。【结论】MMPs家族成员及其功能相关基因在牦牛骨骼肌中广泛表达，且在臀肌和胸肌中的表达量存在差异，为进一步研究MMPs调控牦牛骨骼肌结构形成的作用机制提供了参考依据。
关键词： 牦牛 骨骼肌 基质金属蛋白酶（MMPs） 胶原蛋白
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鲊辣椒生香酵母的分离筛选鉴定及其应用研究
《食品与发酵工业 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：从自然发酵鲊辣椒中以嗅闻法结合总酯含量作为生香酵母的筛选依据分离筛选到1株生香酵母，经鉴定并分类命名为库德里阿兹威氏毕赤酵母菌(Pichia kudriavzevii)Y50,为探究该菌株混菌发酵生产鲊辣椒的品质提升作用，将Y50与植物乳杆菌混合发酵鲊辣椒(C),以自然发酵的鲊辣椒(A)以及接种植物乳杆菌发酵的鲊辣椒(B)为对比研究对象，对3种鲊辣椒的基本理化指标、辣椒碱、有机酸和挥发性成分进行比较分析。结果表明，3种鲊辣椒pH值、总酸、亚硝酸盐、胡萝卜素含量较为接近，但鲊辣椒C中有机酸含量达(25.46±0.32) g/kg,比鲊辣椒A和鲊辣椒B分别高出57.8%和32.2%。鲊辣椒A、B、C中分别检出挥发性风味物质90种、67种和72种，其中鲊辣椒C的挥发性物质含量最高，为(10 101.11±99.04)μg/kg,酯类、醇类、醛类、酸类挥发性物质含量均有提高，相比A、B分别提升了75%、358%、106%、23%和102%、59%、68%、51%,赋予鲊辣椒更浓郁的酯香、花香和果香，说明添加生香酵母Y50能提升鲊辣椒整体的风味品质，通过气味活度值(odor activity value, OAV)的计算，共检出22种OAV>1的香气化合物，这些关键香味物质赋予了鲊辣椒特有的香气特征，其中β-紫罗兰酮、2-甲基丁酸乙酯、己酸己酯、正庚醇、(+)-柠檬烯、庚醛、愈创木酚是构成鲊辣椒C风味的关键物质。试验表明Y50具有进一步应用于鲊辣椒生产的潜力。
关键词： 鲊辣椒 生香酵母 分离鉴定 混菌发酵 有机酸 挥发性成分 香气活度值
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基于mtDNA COX3基因对西藏特色牦牛群体遗传结构的分析
《草业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为探究西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系，本研究利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、类乌齐牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、桑日牦牛、江达牦牛7个群体共140头个体的mtDNA COX3基因蛋白质编码区（CDS）序列，利用DNAMAN、DNASP 5.1、MEGA 7.0软件分析了其序列多态性、单倍体多样性，并构建了系统发育树。结果表明，西藏牦牛群体的COX3基因CDS序列长度均为781 bp，共检测获得55个变异位点。在140头个体中共检测出11种单倍型，平均单倍型多样性（Hd）及核苷酸多样性（Pi）分别为0.665和0.00480，说明西藏牦牛具有丰富的遗传多样性。西藏7个牦牛群体可分为2大类，类乌齐牦牛单独聚为一类，其余牦牛群体为一类。此外，11种单倍型可分为2个聚类簇，说明西藏牦牛可能存在两个母系起源。西藏7个牦牛群体可划分到家牦牛、原牛和普通牛三大单倍型群体中，其中Hap＿2、Hap＿3、Hap＿4、Hap＿6、Hap＿7、Hap＿8、Hap＿10、Hap＿11这8个单倍型属于家牦牛支系，Hap＿5和Hap＿9属于原牛和普通牛支系，Hap＿1属于野牦牛支系，说明家牦牛、原牛和普通牛是西藏牦牛的混合母系起源，但受家牦牛影响较大。研究结果旨在为西藏牦牛的演化、遗传多样性以及遗传资源保护和利用提供理论依据。
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产双羔象雄半细毛羊血浆代谢特异表达模式分析
《中国畜牧杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本研究采用非靶标代谢组学研究方法分别对乏情期和发情期产双羔和产单羔象雄半细毛羊血浆中代谢物的表达模式进行了研究.结果显示,在正离子模式下乏情期有 72 种代谢物在产双羔绵羊中出现了差异表达,发情期则有 41 种代谢物出现了差异表达,负离子模式下,则分别发现了 44 种和 28 种含量差异代谢物.偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)和聚类分析显示,无论是在乏情期还是发情期,产双羔母羊的血浆中代谢物的含量呈现出有别于产单羔羊的模式.KEGG富集分析显示,产双羔母羊特异表达的代谢物主要与氨基酸及脂类代谢途径相关.同时,研究还发现单磷酸尿苷、二氢叶酸、β-雌二醇、前列腺素、雌马酚等代谢物的含量在产双羔羊血浆中出现了明显的特异表达,其可作为产双羔羊候选标志物进一步研究.本研究结果表明产双羔象雄半细毛羊血浆中存在着特异的代谢物表达模式,相关数据能够促进藏绵羊的产双羔性状研究和利用工作.
关键词： 象雄半细毛羊 产羔数性状 血浆 代谢组学 差异代谢物
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4种钙制剂对苹果果实生长、品质及钙代谢的影响
《中国果树 》 2023 北大核心
摘要：以10年生的寒富苹果为试材,设置喷施糖醇钙、氨基酸钙、氯化钙、硝酸钙和清水5个处理,研究4种钙制剂对果实生长、品质以及钙代谢影响.结果表明,4种钙制剂喷施均可提高寒富果实单果重和纵横径,显著增强硬度,减缓软化,增加可溶性糖含量、维生素C含量和可溶性固形物含量,降低可滴定酸含量.相较于氯化钙和硝酸钙,糖醇钙处理更能提高寒富果实的单果重和硬度;而氨基酸钙在改善内在品质、提高风味方面更具有优势.随着寒富果实生长,果实总钙和水溶性钙含量呈下降趋势,草酸钙含量呈上升趋势,磷酸钙含量变化较小,果胶钙含量则处于较高水平.喷钙处理能显著增加果实的总钙、果胶钙的含量,降低草酸钙的积累.
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