科研产出
基于TMT蛋白组学及生物信息学分析牦牛抗冻差异蛋白
《南方农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]从蛋白水平阐明牦牛抗寒性能机理,并进一步从营养学角度提高其代谢性能,为牦牛有效抵御外界恶劣气候条件提供科学依据.[方法]应用TMT蛋白组学技术对寒冷季节(1月)和温暖季节(8月)的牦牛抗冻蛋白进行挖掘,并对鉴定到的牦牛抗冻蛋白进行亚细胞定位、结构域、GO功能富集、KEGG信号通路注释、蛋白相互作用等生物信息学分析.[结果]从牦牛耳组织中共鉴定获得21856个肽段(Peptide),其中特有肽段(Unique peptide)序列为18452个,定量获得4519个蛋白,最终筛选出144个差异蛋白,其中上调蛋白89个、下调蛋白55个.144个牦牛抗冻差异蛋白亚细胞定位到7个条目上,分别是细胞核蛋白56个、细胞质蛋白51个、质膜蛋白24个、细胞外蛋白23个、线粒体蛋白18个、细胞骨架蛋白1个和溶酶体蛋白1个;共鉴定到194个结构域.GO功能富集分析结果显示,生物过程主要富集到细胞过程蛋白79个、代谢过程蛋白70个和生物调控蛋白42个等,分子功能主要富集到结合功能蛋白75个和催化活性蛋白64个等,细胞组分主要富集到细胞部分蛋白89个和细胞蛋白89个等.144个牦牛抗冻差异蛋白在KEGG数据库中注释到205条KEGG信号通路,主要涉及核糖体、氮代谢、胞质DNA感受、动物体内生热作用、氧化磷酸化、白细胞介素-17及钙离子信号等通路.牦牛抗冻差异蛋白相互作用网络分析发现L8IHE5的关联度最高,且冷诱导RNA结合蛋白(CIRP)和HSP70结合蛋白在蛋白相互作用网络中具有更多的相互作用关系.[结论]基于TMT蛋白组学对牦牛抗冻差异蛋白进行挖掘,结果鉴定获得144个抗冻差异蛋白(上调蛋白89个,下调蛋白55个),其中CIRP和HSP70在冷应激条件下呈上调趋势,能促使牦牛肌体适应低温环境,可作为牦牛抗冻性育种的候选分子标记.
关键词： 牦牛;TMT蛋白组学;生物信息学;抗冻性;差异蛋白
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复方藏兽药翼草景香颗粒主成分代谢机理研究
《中兽医医药杂志 》 2022
摘要：运用PCA模型和代谢组学等方法,研究单次给药后复方藏兽药翼草景香颗粒主要成分在健康靶动物体内的变化规律及时量关系;运用主成分分析模式识别技术,寻找表征特定状态的生物标志物和潜在生物标志物的候选变量,从而揭示翼草景香颗粒在动物体内的生物学本质及代谢作用机制。选取健康西藏牦牛、绵羊,分成高、中、低剂量组,口服投喂复方藏药一次,另设不给药对照组,于给药前和给药后不同时段采集血样与粪样。利用GC-MS/MS对样本进行检测,检测数据分别通过GC-MS Postrun Analysis软件进行处理、NISI MS Search 2.0质谱库检索分析和Origin2018统计软件进行统计分析。由PCA得分可知,复方藏药中剂量组牦牛给药5.5 h、6.5 h和7.5 h时血样中藏药活性成分排名靠前,活性较高;复方藏药中剂量组绵羊给药0.5 h、7.5 h时和给药24.0 h时血样中藏药活性成分可以明显区分、得分最高。给药后牦牛、绵羊血液中检测出安息香醛、3-(2,6,6-三甲基-1-环己烯基)-2-丙烯醛、β-谷甾醇、2-己基-1-癸醇、三花生酸甘油酯、(±)-1,2-二棕榈精、2-乙基己酸乙烯酯、十二烯基丁二酸酐、二氢青蒿素等多种共有活性成分。该复方藏药发挥药效的主要成分包括安息香醛、3-(2,6,6-三甲基-1-环己烯基)-2-丙烯醛、β-谷甾醇等,这些共有成分可能与消炎、解热及抗肿瘤功效有关。
关键词： 牦牛 绵羊 复方藏兽药 翼草景香颗粒 血液药代动力学 GC-MS/MS
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雪域白鸡群体中PMEL17基因多态性分析
《黑龙江畜牧兽医(上半月) 》 2022 北大核心
摘要：为了研究前黑色素小体蛋白17(pre-melanosomal protein 17,PMEL17)基因第10外显子上有关显性白羽突变的基因频率和基因型频率在雪域白鸡群体中的分布情况,试验采用PCR-RFLP方法分析基因型,利用POPGENE 1.32软件计算基因型和基因频率,用SPSS 20.0软件进行哈代-温伯格平衡适合性检验.结果表明:雪域白鸡群体中PMEL17基因有Ⅱ、Ii和ii 3种基因型,基因型频率分别为91.58%、7.37%、1.05%,I和i等位基因频率分别为95.27%和4.73%.雪域白鸡群体内PMEL17基因BsrB酶切基因型分布不符合哈代-温伯格平衡状态(P<0.05),这可能与经历人工选择有关.说明雪域白鸡群体中Ⅱ基因型个体已占主导,但仍存在其他羽色个体,可通过分子标记辅助选择育种技术剔除ii及Ii基因型个体来提高群体羽色均一性,还可组建有色羽纯合群体以增加收益.
关键词： 雪域白鸡;显性白羽;多态性;PCR-RFLP;PMEL17
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西藏油菜种质资源品质性状鉴定分析
《西藏农业科技 》 2022
摘要：为分析甘蓝型油菜和白菜型油菜种质资源的品质特性,并对其遗传多样性进行评价.本研究对100份甘蓝型油菜和100份白菜型油菜的含油量、蛋白质、硫苷、芥酸、硬脂酸、油酸、亚油酸、亚麻酸、花生酸、棕榈酸等10个品质性状的分布特征、相关性、聚类结果进行分析.结果表明,白菜型油菜资源和甘蓝型油菜资源均具有较好的遗传多样性,10个性状变异系数分别为4.33%~51.46%、7.05%~214.08%,花生酸与芥酸的相关性系数均大于0.800.在欧式距离为10处白菜型油菜资源聚为4类,甘蓝型油菜资源聚为5类.本研究探明了白菜型油菜和甘蓝型油菜品质的特征特性,为下一步油菜杂交育种的亲本选配提供依据.
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措勤紫绒山羊线粒体基因组全序列测定及分析
《内蒙古农业大学学报(自然科学版) 》 2022
摘要：措勤紫绒山羊是中国优良的绒用地方山羊品种，从线粒体水平分析其与其他中国地方山羊品种之间的系统发育关系，对措勤紫绒山羊的种群分类和遗传资源保护具有重要意义。本研究利用全基因组随机测序技术和生物信息学软件对措勤紫绒山羊线粒体基因组进行获取、拼接与注释。结果发现措勤紫绒山羊线粒体基因组全长16 641 bp，主要由22个tRNA基因、2个rRNA基因、13个蛋白编码基因和1个非编码控制区（D-loop区）4部分构成；基于线粒体基因组D-loop区序列构建8个地方山羊品种的系统进化树，发现措勤紫绒山羊与柴达木绒山羊的遗传距离最近，推测是由地理位置相近所导致的。本研究为措勤紫绒山羊的品种鉴定和系统发育关系提供了一定的数据支撑。
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天然放牧条件下河谷型藏绵羊及其与萨福克羊杂交后代肉品质的比较
《动物营养学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：本试验旨在通过比较天然放牧条件下河谷型藏绵羊及其与萨福克羊杂交后代(萨藏杂交羊)的屠宰性能和肉品质,评估萨藏杂交商品羊生产模式是否适用于高寒高海拔牧区.选用体况、体型基本一致的3月龄断奶萨藏杂交羊、河谷型藏绵羊公羔各50只,做好标记放牧于隆子县热荣乡沃塘村天然牧场,放牧时间为15个月,正试期结束后分别选择接近组内体重平均值的萨藏杂交羊、河谷型藏绵羊各10只进行屠宰,采集背最长肌测定肉品质指标和营养物质含量.结果显示:1)7、18月龄萨藏杂交羊的体重极显著高于河谷型藏绵羊(P<0.01).2)萨藏杂交羊的胴体重、左半净肉重极显著高于河谷型藏绵羊(P<0.01),眼肌面积、左半骨重、骨肉比、屠宰率与河谷型藏绵羊无显著差异(P>0.05).3)萨藏杂交羊背最长肌的红度值极显著高于河谷型藏绵羊(P<0.01),滴水损失显著高于河谷型藏绵羊(P<0.05),亮度值、黄度值、熟肉率、pH以及水分、粗蛋白质、肌内脂肪、粗灰分含量与河谷型藏绵羊无显著差异(P>0.05).4)萨藏杂交羊背最长肌中矿物元素(钙、铁、锌、硒)、胆固醇、维生素(维生素A、维生素E、维生素B1、维生素B2)含量与河谷型藏绵羊无显著差异(P>0.05).5)萨藏杂交羊背最长肌中氨基酸种类及含量以及脂肪酸种类与河谷型藏绵羊无显著差异(P>0.05).萨藏杂交羊背最长肌中辛酸(C8:0)、花生四烯酸(C20:4n6)含量显著高于河谷型藏绵羊(P<0.05),十四烯酰基肉碱(C14:1)、t10c12-共轭亚油酸(t10c12?CLA)、二十二碳六烯酸(C22:6n3,DHA)含量显著低于河谷型藏绵羊(P<0.05),其余脂肪酸含量二者间无显著差异(P>0.05).由此可见,天然放牧条件下,萨藏杂交羊的产肉性能高于河谷型藏绵羊,肉的营养品质与河谷型藏羊差异不大,且肉色及口感略优于河谷型藏绵羊.
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高效双羔疫苗对全舍饲同期发情经产多玛绵羊产羔率和羔羊成活率的影响
《西藏农业科技 》 2022
摘要：为研究高效双羔疫苗对全舍饲同期发情多玛绵羊产羔率和羔羊成活率的影响,在同一种羊场,将420只经产母羊随机均分为对照Ⅰ组、对照Ⅱ组、试验AⅠ组、试验AⅡ组、试验BⅠ组和试验BⅡ组,70只/组.对照Ⅰ组、试验AⅠ组和试验BⅠ组饲养方式为燕麦青干草自由采食+每天补饲怀孕母羊补饲颗粒料0.6 kg;对照Ⅱ组、试验AⅡ组和试验BⅡ组饲养方式为燕麦青干草自由采食+每天补饲怀孕母羊补饲颗粒料0.8 kg.分别于第1日和第21日对试验AⅠ组、试验AⅡ组、试验BⅠ组和试验BⅡ组的母羊进行颈部皮下注射双羔疫苗1 mL,于第2次免疫后再间隔2周后,于每日上午8:30—9:00公羊拴系试情布进入母羊群进行诱导发情,寻找发情母羊,对接受试情公羊爬跨的母羊进行人工输精.其中试验AⅡ组和BⅡ组所有母羊于第2次免疫的第2日,阴道内放置海绵栓,放栓后第12天上午注射PMSG和PG,放栓后第13天下午撤拴,撤栓后第2天早上,将试情公羊放入母羊群中,寻找发情母羊.5个月后记录产羔情况和羔羊成活情况.结果表明,在相同的饲养管理下,对照Ⅰ组和对照Ⅱ组未做高效双羔疫苗免疫,AⅡ组和BⅡ组在同期发情的基础上经高效双羔疫苗免疫,几组经产母羊的产羔数量具有统计学意义(p<0.01),且母羊繁殖率也具有统计学意义(p<0.01);同样,试验AⅠ组和试验BⅠ组经高效双羔疫苗免疫,并且试验AⅡ组和BⅡ组在同期发情的基础上经高效双羔疫苗免疫,几组经产母羊的产羔数量具有统计学意义(p<0.01),且母羊繁殖率也具有统计学意义(p<0.01).燕麦青干草自由采食、每天补饲怀孕母羊补饲颗粒料0.6 kg和0.8 kg差异的基础上,对照Ⅰ组和对照Ⅱ组、试验AⅠ组和试验AⅡ组、试验BⅠ组和试验BⅡ组母羊的产羔数量具有统计学意义(p<0.01),且母羊繁殖率也具有统计学意义(p<0.01).不论是在相同的饲养管理下,还是燕麦青干草自由采食、每天补饲怀孕母羊补饲颗粒料0.6 kg和0.8 kg差异的基础上,各组经产母羊所产羔羊成活率差异不具有统计学意义.结合补饲和同期发情技术,高效双羔疫苗可有效提高藏绵羊经产母羊的繁殖率,且不影响羔羊的成活率.
关键词： 羊高效双羔疫苗 多玛绵羊 经产母羊 羔羊 繁殖率 成活率
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基于知识图谱的长江流域内地表蒸散研究进展
《水资源保护 》 2022 EI 北大核心 CSCD
摘要：以CNKI和Web of Science数据库为数据源，将长江流域范围内地表蒸散研究与国内外地表蒸散研究利用CiteSpace信息可视化软件进行了计量比较分析。结果表明：1992—2020年，国内外共发表地表蒸散为主题的文章5 216篇，其中长江流域范围内179篇，2016年前中英文文章数量皆呈增加趋势；长江流域内地表蒸散研究中，南京信息工程大学、河海大学和中国科学院南京地理与湖泊研究所论文数量在研究机构中名列前三，这些研究机构主要依靠所属试验站提供实测蒸散数据和气象数据进行蒸散模拟与验证研究；研究内容以蒸散获取和数值模拟为重点，其次为地表蒸散变化机制与时空演变过程分析，而关于地表蒸散变化的生态环境效应研究相对较少；从高引用趋势可以发现，在地表蒸散估算精度不断提高的情况下，学者们也逐渐关注蒸散组分、变化机制的研究，环境因子对长江流域内地表蒸散的影响研究较多，而土地利用、地表覆被、植被类型等下垫面性质及变化对蒸散的影响研究较少；蒸散变化效应分析则主要集中在地表蒸散对水平衡、湿地处理以及作物产量的影响。
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复种技术在西藏的应用与思考
《安徽农业科学 》 2022
摘要：复种是粮食增产最简单直接且行之有效的一种方式.将种地、养地相结合,防治水土流失从而提高土地的可持续发展能力,合理发展复种,充分利用光、热、水、耕地等自然资源.提高资源的利用效率对农业的可持续发展有非常重要的意义.介绍了复种制度对饲草生产的意义,分析了西藏复种制度的潜力条件、复种的经济效益和生态意义、西藏复种发展趋势,最后对西藏复种制度发展模式进行了思考.
关键词： 复种技术;西藏;应用与思考
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