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关键词:cluster analysis(模糊匹配)
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牦牛规模化养殖技术

草学 2018

摘要:牦牛产业是藏区的特色产业和支柱产业,提高牦牛生产效率成为牦牛规模化养殖技术发展的核心动力。结合藏区地形气候,规划牧场与放牧时间,改善圈舍环境,分群饲养管理和繁殖技术,提高牦牛产犊率和出栏率,扩大牦牛养殖经济效益,促进藏区牦牛规模化养殖的发展。

关键词: 藏区 牦牛 牧场 放牧时间 分群 繁殖技术

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青藏高原青稞耐寒种质资源基于SSR标记的遗传多样性及群体结构分析

麦类作物学报 2017 北大核心 CSCD

摘要:为了解青藏高原青稞耐寒种质资源的遗传基础,利用SSR标记分析了来自青藏高原地区的71份青稞耐寒育种资源的遗传多样性和群体遗传结构。结果表明,利用从分布于大麦7个连锁上的200对SSR引物中筛选的48对多态性引物,共检测到230个等位条带,变化范围为1~10个,平均每对SSR引物可检测到4.79个条带。多态性信息含量(PIC)变化范围为0.054 7~0.856 9,平均值为0.489 8。遗传相似系数(GS)的变化范围为0.469~0.924,平均值为0.745。经聚类分析,在GS约0.740处可将71份材料分为五大类,第51、43和14号品种分别聚为A、B和C类,第22、27、39和50号品种聚为D类,其余64个品种聚为E类,其中,第51号品种的穗长(3.8cm)、穗粒数(44.2粒)最低,第43号的单穗小穗数(90个)最高,但千粒重(35.6g)最低,第14号品种的生育期(86d)最短,但穗粒数(69.6粒)最多。此外,群体遗传结构分析表明,71份青稞资源材料可划分为2个亚群。

关键词: 青稞 遗传多样性 SSR 群体结构 聚类分析

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中国大麦育成品种(系)的遗传多样性

应用与环境生物学报 2013 北大核心 CSCD

摘要:为了解我国大麦育成品种(系)的遗传基础现状,利用位于大麦7个连锁上不同位置的25对SSR引物对来自国内不同区域的大麦推广和新育成品种(系)的遗传多样性及其亲缘关系进行分析.结果表明,25对SSR引物在73个大麦品种间均有多态性扩增,每一对引物检测到的等位基因数目在2-6之间,平均为3.92个.SSR引物的多态性信息含量(PIC)变幅为0.252-0.780,平均为0.569.遗传多样性分析发现,我国不同大麦产区的皮大麦品种(系)间遗传相似性系数(GS)变化范围为0.661-0.767(平均值0.714),青藏高原地区青稞品种(系)间遗传相似性系数变化范围为0.533-0.925(平均值0.699),表明目前国内皮大麦和青稞的遗传多样性均较差、品种遗传背景单一.通过聚类分析,在遗传相似系数0.671水平处,42份皮大麦材料聚为2大类;在遗传相似系数0.618水平处,31份青稞材料聚为5大类,来源地相同的材料通常聚在同一大类或亚类,材料聚类结果与其地理来源有一定相关性.本研究表明SSR标记具有较好的遗传变异检测能力,对大麦品种(系)间的遗传多样性评价可为我国大麦育种过程中亲本材料的选择和利用提供重要依据.

关键词: 大麦 育成品种(系) SSR标记 遗传多样性 聚类分析

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六个半细毛羊品种遗传关系的研究

中国草食动物科学 2013

摘要:应用微卫星技术对云南半细毛羊、凉山半细毛羊、贵州半细毛羊、彭波半细毛羊、罗姆尼羊和考力代羊基因组DNA进行了17个微卫星位点多态性分析,以期为半细毛羊品种的遗传关系做出评价,同时为这些品种的合理开发利用提供理论依据。研究结果表明:6个研究群体PIC值均大于0.5,表明遗传多样性都极为丰富;遗传分化关系的研究表明,6个群体Nm值均在1以上,Fst值均在0.6以下,说明群体间可能存在一定的基因迁移或者有较近的亲缘关系,其中贵州半细毛羊和考力代羊间存在最大的基因流(Nm=12.065)、最小的变异系数(Fst=0.020 3)、最高的遗传一致度(0.862)及最小的遗传距离(0.148),显示出两个群体较近的亲缘关系;UPGMA聚类图显示6个群体聚为两个大支,贵州半细毛羊、考力代羊、彭波半细毛羊聚为一支,云南半细毛羊、罗姆尼羊及凉山半细毛羊聚为另一支。

关键词: 半细毛羊 微卫星 遗传多样性 遗传分化 聚类分析

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西藏苦养资源鉴定与评价初报

西藏农业科技 2013

摘要:本文采用系统聚类分析方法,对60份西藏荞麦资源进行鉴定与分析,将供试材料分成四类:第1类株高中等一中产类;第2类株高中等偏上一高产类;第3类高杆一中产类;第4类株高中等偏下一中产类,并对各类荞麦资源各性状进行了论述与评价.

关键词: 西藏 苦荞资源 聚类分析 评价

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西藏苦荞资源鉴定与评价初报

西藏农业科技 2013

摘要:本文采用系统聚类分析方法,对60份西藏荞麦资源进行鉴定与分析,将供试材料分成四类:第1类株高中等-中产类;第2类株高中等偏上-高产类;第3类高杆-中产类;第4类株高中等偏下-中产类,并对各类荞麦资源各性状进行了论述与评价。

关键词: 西藏 苦荞资源 聚类分析 评价

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西藏苦荞种质资源主要农艺性状分析

河北农业大学学报 2008 北大核心 CSCD

摘要:为了揭示西藏苦荞种质资源多样性和发掘苦荞资源中的有益基因,利用相关分析、主成分分析聚类分析等方法对西藏80份苦荞资源的7个主要农艺性状进行了分析。结果表明:西藏苦荞资源存在丰富的遗传多样性,其中主茎粗的遗传变异系数达到36.7%。千粒重与单株粒重呈极显著正相关和极显著偏相关,生育期与千粒重呈极显著负相关和显著负偏相关。应用主成分分析将西藏苦荞7个主要农艺性状简化为4个主成分,其累积贡献率为86.04%,以主茎因子贡献率最高,为41.11%。采用系统聚类分析,将供试材料在遗传距离11.61水平上可聚为4个大类,可区分为株高较矮大粒型、株高中等小粒型、植株矮小大粒型和植株高大茎秆粗壮型。综合聚类分析和主成分分析,苦荞资源中植株较矮、大粒是较为理想的育种材料。

关键词: 西藏苦荞 农艺性状 相关分析 主成分分析 聚类分析

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西藏主要农区青稞品种的遗传多样性分析

作物学报 2007 北大核心 CSCD

摘要:采用内含子切接点引物(intron-splice junction primer)和长随机引物的PCR分子标记方法,对来自西藏主要农区的29个青稞育成品种和3个农家种的遗传多样性进行了分析。结果表明,选用的5个引物共扩增出稳定清晰的条带39条,其中26条(66.7%)为多态性条带。根据PCR扩增的条带建立[1,0]型数据矩阵,应用NTSYSpc2.1数据分析软件计算各品种间的遗传相似系数,并据此进行聚类分析,结果表明,西藏主要农区青稞品种间有一定的遗传差异,但总体遗传差异较小,遗传基础相对狭窄;聚类结果与各品种的实际生产利用情况较为接近,可以反映出这些青稞品种较为明显的区域特征。

关键词: 青稞 种质资源 遗传多样性 聚类分析

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