科研产出
西藏特色牦牛mtDNA ND1遗传多样性及系统进化分析
《华北农学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：旨在通过mtDNA ND1 探究6 个西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系,为西藏牦牛的遗传多样性、历史演化以及遗传资源保护与利用等提供理论依据.利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、江达牦牛、类乌齐牦牛 6 个群体共 95 头个体ND1 基因蛋白质编码区(CDS)序列,利用DNAMAN、DNASP 5.1、Mega 7.0、Arlequin 3.5.2 等软件分析其序列多态性、单倍型多样性、遗传距离等,并构建单倍型网络图及系统发育树.结果表明,西藏牦牛群体ND1 基因CDS区序列长度均为956 bp,共检测获得78 个变异位点和16种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)及核苷酸多样性(Pi)分别为0.670 和0.004 21,Tajima's D均为负值;根据群体遗传差异的分子方差分析可知,西藏牦牛群体内的变异程度大于群体间变异;斯布牦牛与嘉黎牦牛之间的分化程度较大,其余大部分群体间的分化程度为中等或较弱.此外,通过聚类分析发现,类乌齐牦牛单独聚为一类,而嘉黎牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、江达牦牛先聚为一类,然后再与帕里牦牛聚为一大类;16 种单倍型可分为2 个聚类簇,说明西藏牦牛可能存在2 个母系起源;与其他牛种进行聚类分析,发现家牦牛、爪哇野牛和普通牛可能是西藏牦牛的混合母系起源.西藏牦牛遗传多样性十分丰富,其中类乌齐牦牛遗传多样性最丰富,6 个牦牛群体存在2 个母系起源.
关键词： 西藏牦牛 ND1基因 遗传多样性 系统进化 遗传分化
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化肥减施配合有机肥与混播比例对高寒地区燕麦+箭筈豌豆牧草生产性能的影响
《中国农学通报 》 2023 CSCD
摘要：针对高寒地区燕麦传统种植模式存在的问题，本研究设计了6个混播比例4种施肥模式，对燕麦+箭筈豌豆混播草地的鲜草产量、干草产量、株高、粗蛋白、粗脂肪、粗灰分、中性洗涤纤维、酸性洗涤纤维8个指标进行测定，并应用灰色关联度方法综合评价混播草地的生产性能。结果表明：燕麦与箭筈豌豆混播的最佳比例为6:4，此比例与燕麦单播相比，粗蛋白提高了60%，粗脂肪提高了36.4%，而产量并没有显著降低；化肥减施50%+50%有机肥时，能使混播草地高产稳产，提高牧草营养品质，与不施肥相比，干草产量提高61.13%，粗蛋白提高23.9%；生物有机肥可以起到替代化肥的作用；施肥与混播比例存在交互作用，化肥减施50%+50%有机肥、燕麦与箭筈豌豆6:4混播时综合评价最好，适宜在日喀则地区种植推广。
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西藏羊卓雍错高原裸鲤肠道寄生蠕虫的群落生态
《水生生物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为研究西藏羊卓雍错Yamdrok Lake高原裸鲤肠道寄生蠕虫的群落生态,探索寄生虫与西藏高原环境和独特的鱼类宿主三者之间的相互关系,以肠道寄生蠕虫为对象,于2020年7月对180尾高原裸鲤Gymnocypris waddellii [雌性120尾,雄性60尾,全长22.20—49.20 cm,平均全长（36.76±4.18） cm,体重77.3—896.7 g,平均体重（425.92±148.27） g]进行了剖检,对群落结构和种间关系等群落生态进行了分析。羊卓雍错高原裸鲤肠道寄生蠕虫群落由5个物种构成,分别为聂氏似短节绦虫Parabreviscolex niepini、对盲囊线虫Contracaecum eudyptulae、束首线虫未定种Streptocara sp.、新棘吻虫未定种Neoechinorhynchus sp.和异肉吸虫未定种Allocreadium sp.。感染率从高到低依次为新棘吻虫未定种、聂氏似短节绦虫、异肉吸虫未定种、对盲囊线虫和束首线虫未定种。平均丰度从高到低依次为聂氏似短节绦虫、新棘吻虫未定种、束首线虫未定种、异肉吸虫未定种和对盲囊线虫。群落的Margalef物种丰富度指数为0.59, Shannon-Wiener多样性指数为1.26, Pielou均匀度指数为0.83, Berger-Parker优势度指数为0.50,优势物种为聂氏似短节绦虫。有4组物种间存在正关联,关联性从高到代依次为:新棘吻虫未定种与异肉吸虫未定种、对盲囊线虫与新棘吻虫未定种、对盲囊线虫与异肉吸虫未定种、对盲囊线虫与束首线虫未定种。其他寄生蠕虫物种两两不存在种间关联。从感染与否看,被感染的宿主数量超过采样群体宿主数量的一半,其中,以感染1种寄生虫的宿主出现频次最高,感染2种寄生虫的宿主出现频次也较高, 3种和4种寄生虫共同感染的宿主出现频次明显降低,未发现5种寄生虫同时感染的宿主。与同位于西藏南部,并曾经相连的哲古措Chugutso Lake相比,两个湖泊尽管地理位置相近,宿主鱼类种类相同,寄生蠕虫物种组成一致,但羊卓雍错高原裸鲤肠道寄生蠕虫群落具有自身特点,即更高的平均丰度,绝大部分寄生蠕虫种群也具有更高的感染率,群落中的优势物种也与哲古措不同。种间关联被用来判断肠道寄生蠕虫群落中各种群两两间是否存在共存或排斥关系,即种间亲和性。在羊卓雍错高原裸鲤肠道寄生蠕虫群落中,新棘吻虫未定种与异肉吸虫未定种种间亲和性最高。但这种关系并不稳定,会随着水生态环境和群落中物种组成等的变化而变化。共感染的宿主出现频次变化提示,随着一个亚群落中物种数的增加,种间的相互作用越大,保持共存也越难。
关键词： 群落生态 寄生蠕虫 群落结构 种间关系 羊卓雍错 高原裸鲤 西藏
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牦牛骨骼肌中特异基质金属蛋白酶及其功能相关基因的表达分析
《中国畜牧兽医 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】筛选并鉴定在牦牛骨骼肌中特异表达的基质金属蛋白酶（matrix metalloproteinases, MMPs）家族成员及其功能相关基因，以期为研究牦牛骨骼肌结构形成机制提供依据。【方法】采集成年公牦牛臀肌和胸肌，利用组织化学染色法（HE和Masson）分析肌纤维特征和胶原纤维数量；通过实时荧光定量PCR鉴定MMPs和基质金属蛋白酶抑制因子（TIMPs）的mRNA表达量；采用Western blotting技术和免疫组织化学法分析MMPs、Ⅰ和Ⅲ型胶原蛋白的表达量和组织分布；通过STRING网站分析MMPs及其功能相关基因之间的蛋白质互作网络；采用EnzChekTM明胶酶/胶原酶试剂盒检测牦牛臀肌和胸肌中明胶酶/胶原酶的酶活性差异。【结果】Masson染色和实时荧光定量PCR分析结果显示，牦牛臀肌中胶原纤维面积、MMP-2和MMP-14基因表达量显著低于胸肌（P＜0.05）,TIMP-3基因在牦牛臀肌中表达量显著高于胸肌（P＜0.05）。Western blotting鉴定发现，MMP-3、MMP-14、Ⅰ和Ⅲ型胶原蛋白在牦牛臀肌中的表达量极显著或显著低于胸肌（P＜0.01;P＜0.05）。免疫组织化学法分析显示，MMP-2、MMP-9、MMP-14和Ⅰ型胶原蛋白在牦牛臀肌中的表达量显著或极显著低于胸肌（P＜0.05;P＜0.01）,而MMP-16在牦牛臀肌中的表达量显著高于胸肌（P＜0.05）。蛋白质功能相关性聚类分析表明，MMP-2、MMP-14、MMP-16、TIMP-2、TIMP-3、COL1A2和COL3A1可聚为一簇，MMP-3、MMP-9和TIMP-1可聚为一簇；臀肌和胸肌中明胶酶/胶原酶的酶活性变化趋势一致，且差异不显著（P＞0.05）。【结论】MMPs家族成员及其功能相关基因在牦牛骨骼肌中广泛表达，且在臀肌和胸肌中的表达量存在差异，为进一步研究MMPs调控牦牛骨骼肌结构形成的作用机制提供了参考依据。
关键词： 牦牛 骨骼肌 基质金属蛋白酶（MMPs） 胶原蛋白
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鲊辣椒生香酵母的分离筛选鉴定及其应用研究
《食品与发酵工业 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：从自然发酵鲊辣椒中以嗅闻法结合总酯含量作为生香酵母的筛选依据分离筛选到1株生香酵母，经鉴定并分类命名为库德里阿兹威氏毕赤酵母菌(Pichia kudriavzevii)Y50,为探究该菌株混菌发酵生产鲊辣椒的品质提升作用，将Y50与植物乳杆菌混合发酵鲊辣椒(C),以自然发酵的鲊辣椒(A)以及接种植物乳杆菌发酵的鲊辣椒(B)为对比研究对象，对3种鲊辣椒的基本理化指标、辣椒碱、有机酸和挥发性成分进行比较分析。结果表明，3种鲊辣椒pH值、总酸、亚硝酸盐、胡萝卜素含量较为接近，但鲊辣椒C中有机酸含量达(25.46±0.32) g/kg,比鲊辣椒A和鲊辣椒B分别高出57.8%和32.2%。鲊辣椒A、B、C中分别检出挥发性风味物质90种、67种和72种，其中鲊辣椒C的挥发性物质含量最高，为(10 101.11±99.04)μg/kg,酯类、醇类、醛类、酸类挥发性物质含量均有提高，相比A、B分别提升了75%、358%、106%、23%和102%、59%、68%、51%,赋予鲊辣椒更浓郁的酯香、花香和果香，说明添加生香酵母Y50能提升鲊辣椒整体的风味品质，通过气味活度值(odor activity value, OAV)的计算，共检出22种OAV>1的香气化合物，这些关键香味物质赋予了鲊辣椒特有的香气特征，其中β-紫罗兰酮、2-甲基丁酸乙酯、己酸己酯、正庚醇、(+)-柠檬烯、庚醛、愈创木酚是构成鲊辣椒C风味的关键物质。试验表明Y50具有进一步应用于鲊辣椒生产的潜力。
关键词： 鲊辣椒 生香酵母 分离鉴定 混菌发酵 有机酸 挥发性成分 香气活度值
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基于mtDNA COX3基因对西藏特色牦牛群体遗传结构的分析
《草业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为探究西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系，本研究利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、类乌齐牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、桑日牦牛、江达牦牛7个群体共140头个体的mtDNA COX3基因蛋白质编码区（CDS）序列，利用DNAMAN、DNASP 5.1、MEGA 7.0软件分析了其序列多态性、单倍体多样性，并构建了系统发育树。结果表明，西藏牦牛群体的COX3基因CDS序列长度均为781 bp，共检测获得55个变异位点。在140头个体中共检测出11种单倍型，平均单倍型多样性（Hd）及核苷酸多样性（Pi）分别为0.665和0.00480，说明西藏牦牛具有丰富的遗传多样性。西藏7个牦牛群体可分为2大类，类乌齐牦牛单独聚为一类，其余牦牛群体为一类。此外，11种单倍型可分为2个聚类簇，说明西藏牦牛可能存在两个母系起源。西藏7个牦牛群体可划分到家牦牛、原牛和普通牛三大单倍型群体中，其中Hap＿2、Hap＿3、Hap＿4、Hap＿6、Hap＿7、Hap＿8、Hap＿10、Hap＿11这8个单倍型属于家牦牛支系，Hap＿5和Hap＿9属于原牛和普通牛支系，Hap＿1属于野牦牛支系，说明家牦牛、原牛和普通牛是西藏牦牛的混合母系起源，但受家牦牛影响较大。研究结果旨在为西藏牦牛的演化、遗传多样性以及遗传资源保护和利用提供理论依据。
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产双羔象雄半细毛羊血浆代谢特异表达模式分析
《中国畜牧杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本研究采用非靶标代谢组学研究方法分别对乏情期和发情期产双羔和产单羔象雄半细毛羊血浆中代谢物的表达模式进行了研究.结果显示,在正离子模式下乏情期有 72 种代谢物在产双羔绵羊中出现了差异表达,发情期则有 41 种代谢物出现了差异表达,负离子模式下,则分别发现了 44 种和 28 种含量差异代谢物.偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)和聚类分析显示,无论是在乏情期还是发情期,产双羔母羊的血浆中代谢物的含量呈现出有别于产单羔羊的模式.KEGG富集分析显示,产双羔母羊特异表达的代谢物主要与氨基酸及脂类代谢途径相关.同时,研究还发现单磷酸尿苷、二氢叶酸、β-雌二醇、前列腺素、雌马酚等代谢物的含量在产双羔羊血浆中出现了明显的特异表达,其可作为产双羔羊候选标志物进一步研究.本研究结果表明产双羔象雄半细毛羊血浆中存在着特异的代谢物表达模式,相关数据能够促进藏绵羊的产双羔性状研究和利用工作.
关键词： 象雄半细毛羊 产羔数性状 血浆 代谢组学 差异代谢物
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牦牛源链球菌的分离鉴定及耐药性分析
《中国畜牧兽医 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】了解西藏拉萨地区牦牛链球菌的感染情况、致病性及其耐药性，为牦牛源链球菌的研究提供新的数据。【方法】对55份牦牛鼻拭子进行细菌分离培养、菌落形态观察、革兰氏染色镜检、生化鉴定、16S rRNA序列PCR扩增以鉴定分离菌的种属特性。通过人工感染试验小鼠评价分离菌的致病性，采用药敏纸片扩散法检测分离菌的耐药性。【结果】分离菌在血平板上长出灰白色、表面光滑的α溶血圆形菌落，革兰氏染色镜检呈链状排列的阳性球菌。分离菌可发酵葡萄糖、乳糖、海藻糖和山梨醇，不发酵麦芽糖和甘油，硝酸盐还原试验、靛基质试验、V-P试验和MR试验均呈阴性。经16S rRNA基因序列比对分析，确定有25株链球菌（Tibet-1～Tibet-25）,检出率为45.46%（25/55）,其中17株多动物链球菌，8株马链球菌。分离菌16S rRNA基因序列与NCBI上已发布的链球菌相似性在97.04%～99.77%之间，其中Tibet-1、Tibet-2、Tibet-3、Tibet-5、Tibet-9、Tibet-10、Tibet-11、Tibet-14、Tibet-15、Tibet-16、Tibet-17共11株牦牛源多动物链球菌与KM981770.1的相似性均在99%以上。分离的牦牛源链球菌可引起小鼠腹泻，对发病小鼠脏器进行增菌培养，均可分离到链球菌。药敏试验结果显示，分离菌株对多西环素、红霉素、青霉素共11种抗菌药敏感，对复方新诺明耐药。【结论】本研究分离了牦牛源多动物链球菌和牦牛源马链球菌，并对其致病性和耐药性进行相关分析，为该病的防控和治疗提供了参考依据。
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羊促性腺激素释放激素主动免疫去势的研究进展
《中国畜牧杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：促性腺激素释放激素(GnRH)是由下丘脑神经内分泌小细胞产生的十肽激素,主要通过下丘脑-垂体-性腺轴(HPG)参与调控动物的生殖活动,也可直接作用于性腺或其他器官发挥重要功能.GnRH免疫去势作为当前一种动物友好的去势方法在生产中应用和推广.本文综述了GnRH的分子结构和生物学功能、GnRH主动免疫的应用、GnRH免疫在改善公羊生产性能和繁殖性能上的研究进展,为进一步研究GnRH主动免疫在公羊繁殖中的作用提供一定理论支撑,以提高羊养殖业的经济效益和社会效益.
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青稞主效休眠基因单倍型分布及利用
《麦类作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：穗发芽严重降低谷物的产量和品质,种子休眠与穗发芽高度相关.为了解中国青稞品种休眠特性及其主效休眠基因AlaAT和MKK3的单倍型分布,以143份地方品种和42份育成品种(系)为材料,分别种植在四川雅安、什邡和西藏拉萨,进行大田种子休眠性鉴定;选择休眠性极端材料,分别利用2对引物对含有目标休眠基因功能性SNP的片段进行扩增、测序,并用于Ala AT和MKK3基因特异性KASP标记开发与供试材料的单倍型分析.结果表明,3个种植点,地方品种的发芽指数(GI)均高于育成品种(系),但差异不显著;四川2个种植点间GI值差异不显著,但显著高于西藏种植点,说明青稞品种(系)普遍休眠性弱,高原气候条件显著促进种子休眠.KASP标记检测发现,AlaAT和MKK3的强优势单倍型均为弱休眠单倍型(频率>80%),供试材料中有 4 种单倍型组合,分别为 AlaAT-ND+MKK3-ND、AlaAT-ND+MKK3-D、AlaAT-D+MKK3-ND和AlaAT-D+MKK3-D,频率分别为80.0%、12.4%、6.0%和1.6%,其GI值随强休眠单倍型数量增加而降低;3个环境下,含有组合AlaAT-D+MKK3-D的GI值最低,说明休眠基因具有加性效应,聚合优良单倍型的品种(系)具有稳定的休眠特性.青稞生产和育种应根据种植区域和用途选择与利用上述主效休眠基因单倍型.
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