科研产出
西藏绒山羊羊绒细度候选基因筛选及其chi-miR-105a靶基因的验证
《中国农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为研究西藏绒山羊羊绒细度，以及了解相关候选基因对绒山羊产绒性能的影响，本研究对筛选chi-miR-105a靶基因进行验证，以西藏绒山羊为研究对象，联合RNA测序数据和蛋白质组学数据，筛选与羊绒细度相关的关键候选基因，并通过实时荧光定量和双荧光素酶报告基因试验对候选基因进行调控作用验证。结果表明：1)通过转录组和蛋白组数据整理得到384个DE mRNAs, 12个DE miRNAs和29个DEPs。通过多组学联合分析发现CXCL10、SRC、CXCL9、FOS、ETV6、GMPS和PIP5K1B基因与羊毛细度相关。2)通过DEG-DE miRNA互作网络图发现chi-miR-105a与靶基因ETV6和PIP5K1B均在网络当中出现。因此对该调控因子进行验证和分析，根据靶基因表达水平试验发现转染chi-miR-105a mimics后引起毛乳头细胞中ETV6基因的mRNA表达显著降低(P<0.001),而PIP5K1B基因的表达量均无显著变化。3)通过双荧光素酶报告基因试验表明，过表达chi-miR-105a后，ETV6酶活性显著降低，即chi-miR-105a可与ETV6的3′UTR区结合。综上，通过多组学联合分析筛选出与羊毛细度相关基因CXCL10、SRC、CXCL9、FOS、ETV6、GMPS和PIP5K1B。通过双荧光素酶报告基因进行chi-miR-105a与其预测靶基因ETV6和PIP5K1B的靶标验证，确定chi-miR-105a是ETV6潜在的调控因子，本研究为加快优质绒山羊新品种(系)的培养提供理论依据。
关键词： 西藏绒山羊 多组学联合分析 chi-miR-105a ETV6
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不同绒细度的西藏绒山羊皮肤组织miRNA分析与鉴定
《农业生物技术学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：微小核糖核酸（microRNA, miRNA）作为重要的基因调控元件,在多种哺乳动物皮肤及毛囊中均有表达,并在转录后水平调节皮肤和毛发的生长和发育过程。本研究旨在对西藏绒山羊（Capra hircus）皮肤组织miRNA进行分析与鉴定,探讨miRNA在绒毛纤维直径性状中可能发挥的作用及调控机制。分别选取细绒（平均纤维直径（12.04±0.03）μm）和粗绒（平均纤维直径（14.88±0.05）μm）的西藏绒山羊各4只,对肩胛部皮肤组织提取RNA建立文库进行高通量测序。对原始序列进行过滤,并与参考基因组（ARS1）比对;根据miRBase中已知miRNA和参考基因组中其他非编码RNA （non coding RNA, ncRNA）的位置信息,对miRNA和其他小RNA进行鉴定,筛选出不同绒毛细度的西藏绒山羊皮肤组织差异表达miRNA,并进行靶基因预测及功能分析;进一步利用qPCR验证5个miRNAs与测序结果的一致性。结果表明,每个样本至少获得20.09 M条原始读长,过滤后至少得到19.46 M条有效读长（clean reads）,共鉴定出426个已知miRNAs和119个新miRNAs;筛选获得12个差异表达miRNAs,其中5个miRNAs在细绒型西藏绒山羊皮肤组织中显著上调表达,7个miRNAs显著下调表达;差异表达miRNAs共预测到621个靶基因,KEGG分析显示靶基因富集到B细胞受体信号通路、FcεRI信号通路、T细胞受体信号通路等生物学通路中;同时,选取的5个miRNAs的qPCR验证结果与测序分析的表达趋势一致。本研究结果提示,西藏绒山羊的绒细度可能受不同miRNAs调控,这些miRNAs进一步影响靶基因的表达并参与调控不同的信号通路。本研究为深入揭示调控山羊绒细度的miRNAs和相关信号通路提供参考依据。
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放牧条件下藏西北白绒山羊生殖激素变化规律研究
《家畜生态学报 》 2020 北大核心
摘要：对藏西北白绒山羊的多种生殖激素进行全年的检测,旨在了解藏西北白绒山羊的7种生殖相关激素质量浓度全年的变化规律.每周采集20只藏西北白绒山羊血液样本,提取血清,送至上海酶联测定睾酮(T)、促黄体素(LH)、促乳素(PRL)、雌二醇(E2)、孕酮(PP)、促性腺激素释放激素(GnRH)、促卵泡素(FSH)7种激素的质量浓度,分析藏西北白绒山羊的生殖激素变化规律.试验获得藏西北白绒山羊生殖激素变化曲线,分析得到藏西北白绒山羊全年的繁殖性能变化规律.5月到8月是藏西北白绒山羊的乏情期,9月后进入情期,此时进行配种可以得到较好的效果,研究结果对于指导青藏高原地区山羊生产和提高繁殖力具有指导意义.
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不同饲养方式对西藏绒山羊机体免疫及胃肠道组织发育的影响
《畜牧与兽医 》 2020 北大核心
摘要：为阐明在极端寒冷缺氧的西藏羌塘高原,放牧和舍饲2种不同饲养方式对半同胞西藏绒山羊血清生化及免疫指标和胃肠道组织发育的影响,将同期出生的50只羔羊平均分配到完全放牧和舍饲条件下饲养1年,随机挑选10只绒山羊(n=5),采集血液、瘤胃和小肠样品评估相关指标变化。结果显示:山羊血清中尿素氮、高密度胆固醇、低密度胆固醇、白蛋白、总胆固醇和葡萄糖的含量在舍饲组中显著高于放牧组(P<0.05),高密度胆固醇舍饲组极显著高于放牧组(P=0.006);舍饲组中磷含量和镁含量显著高于放牧组(P<0.05);2种饲养条件免疫指标差异不显著(P>0.05);舍饲组瘤胃背囊乳头高度显著高于放牧组(P=0.018),舍饲组瘤胃背囊乳头宽度极显著低于放牧组(P<0.001);小肠绒毛宽度、隐窝深度和肌层厚度受饲养环境影响较大。提示:冬季牧草干枯时期补饲精饲料可有效提高养殖效率,保证放牧条件下西藏绒山羊的机体健康。
关键词： 西藏绒山羊 饲养 血清生化指标 免疫指标 瘤胃 小肠
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西藏绒山羊KAP7.1和KAP8.2基因多态性及其对部分生产性状的影响
《畜牧与兽医 》 2020 北大核心
摘要：为分析西藏绒山羊角蛋白关联蛋白(KAP)7.1基因和8.2基因与生产性状的关系,采用PCR-SSCP和DNA测序技术对340只西藏绒山羊KAP7.1基因和KAP8.2基因编码区序列进行多态性分析,并与体长、体高、胸围、产绒量、羊绒长度、羊毛长度等生产性状进行关联分析。结果显示:PCR-SSCP检测发现KAP7.1基因只有1种带型,KAP8.2基因有6种带型;KAP7.1基因扩增产物序列中未发现碱基变化;KAP8.2基因扩增产物序列中存在5个SNPs位点,分别为C115T、A207G、A214G、G216A和A278T,除了A278T外都位于编码区;对KAP8.2基因的基因型1、基因型2和基因型3与生产性能进行关联分析发现,基因型1个体的胸深和产绒量显著高于基因型3个体(P<0.05)。结果表明:KAP8.2基因可作为影响西藏绒山羊胸深和产绒量的分子辅助选择标记。
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西藏绒山羊WNT4和HOXC13基因对绒毛纤维直径性状的遗传效应分析
《中国畜牧兽医 》 2020 北大核心
摘要：试验旨在探索WNT4和HOXC13基因多态性及其对西藏绒山羊绒毛纤维直径性状的影响,寻找与西藏绒山羊绒毛纤维直径性状相关的分子标记。以380只1岁西藏绒山羊群体为研究对象,利用混池DNA直接测序法检测WNT4和HOXC13基因的SNP,利用飞行时间质谱技术对SNP分型,利用SAS 9.1软件中最小二乘方差模型对SNP位点与绒毛平均纤维直径、纤维直径标准差、纤维直径变异系数进行关联分析。结果表明,WNT4基因第3外显子区域检测到2个SNPs位点(SNP1和SNP2),HOXC13基因第2外显子区域检测到2个SNPs位点(SNP3和SNP4),均处于中度多态(0.25 关键词：
西藏绒山羊
WNT4基因
HOXC13基因
纤维直径
SNP
遗传效应
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西藏绒山羊的微卫星多态性与部分经济性状的关联分析
《西藏农业科技 》 2019
摘要：为了解微卫星位点在西藏绒山羊群体中的多态性与经济性状的关联性,试验采用PCR-SSCP技术对340只西藏绒山羊的10个微卫星位点进行多态性分析,并采用Duncan氏法进行多重比较,与体长、体高、胸围、羊绒长度、羊毛长度的关联性进行分析.结果表明,除位点BM6438无多态性外,其他9个位点都具有多态性,基因型都在5个以上.与经济性状进行关联性分析发现在体长性状中,位点BM3033的基因型6显著高于其他基因型个体(P <0. 05);在体高性状中,位点BMS1248的基因型1和位点BM3033的基因型6显著高于其他基因型;在胸围性状中,位点BMS1248的基因型2和位点BM3033的基因型6显著高于其他基因型个体(P <0. 05);在绒长性状中,位点BMS1788的基因型3显著高于其他基因型个体(P <0. 05);在毛长性状中,位点BM3413的基因型1和基因型2显著高于其他基因型个体(P <0. 05).本研究结果可为西藏绒山羊分子标记辅助选择提供参考依据.
关键词： 微卫星 PCR-SSCP 经济性状 多态性 西藏绒山羊
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尼玛县放牧绒山羊采食习性、采食量和消化率研究
《家畜生态学报 》 2019 北大核心
摘要：此试验采用饱和链烷烃技术研究了2018年西藏那曲市尼玛县放牧绒山羊四季的采食组成、牧草采食量和牧草消化率.结果表明:尼玛县绒山羊春季采食的主要牧草是西藏嵩草(Kobresia tibetica Maxim)、紫花针茅(Stipa purpurea),夏季是二裂委陵菜(Potentilla bifurca Linn)、弱小火绒草(Leontopodium pusillum),秋季是青藏狗娃花(Heteropappus bowerii(Hemsl.)Griers),冬季则是青藏苔草(Carex moorcroftii Falc.Ex Boott).育成绒山羊春、夏、秋、冬牧草干物质采食量分别为450 g、850 g、950 g、420 g,成年绒山羊分别为685 g、1 280 g、1 350 g、650 g,四季之间差异显著(P<0.05),冬季牧草采食量最低.育成绒山羊春、夏、秋、冬牧草干物质消化率分别为45.85%、56.50%、50.44%、39.05%,成年绒山羊分别为50.50%、60.94%、55.52%、45.76%,四季之间差异显著(P<0.05),冬季牧草消化率最低.
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西藏绒山羊KAP9.2基因CDS克隆、外显子区多态性及表达分析
《基因组学与应用生物学 》 2019
摘要：KAP9.2基因是角蛋白关联蛋白(keratin associated protein, KAP)中的一员,在毛发的形成过程中有重要的调控作用.本研究对西藏绒山KAP9.2基因CDS进行了克隆;采用直接测序法对绒山羊200个个体KAP9.2基因外显子区的遗传变异情况进行分析;并利用Real-time PCR分析了KAP9.2基因在不同海拔山羊中的表达.结果显示,西藏绒山羊KAP9.2基因CDS序列为576 bp,编码191个氨基酸;KAP9.2基因外显子存在25处SNP位点及一处30 bp的缺失突变,其中12处SNP为错义突变,其他13处为同义突变.遗传多态性分析表明KAP9.2基因多态性丰富,遗传变异大;连锁分析发现12与388位点、54与93位点、153与159位点、273与279位点完全连锁,H1为优势单倍型;Real-time PCR显示西藏绒山羊KAP9.2基因在高海拔地区m RNA表达水平显著高于特高海拔地区,推测该基因可能促进绒毛的生长.本研究结果揭示了西藏绒山羊KAP9.2基因的遗传多态性及其在不同海拔的表达,为进一步研究KAP9.2基因潜在的功能位点提供一定的理论依据.
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西藏绒山羊KAP6.2基因SNPs位点的检测及分析
《家畜生态学报 》 2019 北大核心
摘要：旨在研究绒毛品质相关基因KAP6.2在西藏绒山羊群体中的多态性,分析KAP6.2在不同山羊中的差异。采用聚合酶链反应-单链构象多态性和DNA测序等技术对随机选取的127只西藏绒山羊的KAP6.2基因进行突变位点检测及多态性指标分析。结果表明,西藏绒山羊KAP6.2基因存在两种基因型AA和AB,其中等位基因A为优势等位基因,多态信息含量为0.196(属低度多态)。经测序并与GenBank中山羊KAP 6.2(No.AY316158)基因序列比对后共发现4处变异,分别为:178nt处24个碱基的缺失导致Ser48>Gly55氨基酸的丢失;113 nt处GT>CC突变导致氨基酸P.19Ser>Trp;121 nt处A>G突变为同义突变;168nt处C>T突变导致氨基酸P.41Thr>Tyr。这些氨基酸的突变很可能导致结构蛋白功能的改变,进而对西藏绒山羊的绒毛品质产生影响。通过研究影响西藏绒山羊绒毛品质的KAP6.2基因的多态性,深入了解其分子遗传基础,有利于利用分子遗传标记技术进行西藏绒山羊的选育。
关键词： 西藏绒山羊 KAP6.2基因 SNPs位点 聚合酶链反应-单链构象多态性 DNA测序
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