科研产出
牦牛MDHII基因多态性与其生长性状关联性
《基因组学与应用生物学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在探究牦牛（Bos grunniens） MDHII基因遗传多态性,寻找其SNPs位点,为选育优良牦牛品种提供参考依据。首先就5个牦牛类群（类乌齐牦牛,麦洼牦牛,斯布牦牛,帕里牦牛和申扎牦牛）随机选取共178头耳样,然后提取DNA并构建DNA池,Mega5.2筛查SNPs位点,直接测序法鉴定其基因型,最后用SPSS24.0结合体尺性状分析其关联性。结果表明,牦牛MDHII基因第5外显子发生突变（G7454A）,基因型为GA、GG和AA基因型,其中GG为优势基因型;麦洼牦牛、帕里牦牛和类乌齐牦牛属于中度多态（0.25
关键词： 牦牛（Bos grunniens） MDHII基因 多态性 生长性状 关联性分析
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西藏绒山羊KAP7.1和KAP8.2基因多态性及其对部分生产性状的影响
《畜牧与兽医 》 2020 北大核心
摘要：为分析西藏绒山羊角蛋白关联蛋白(KAP)7.1基因和8.2基因与生产性状的关系,采用PCR-SSCP和DNA测序技术对340只西藏绒山羊KAP7.1基因和KAP8.2基因编码区序列进行多态性分析,并与体长、体高、胸围、产绒量、羊绒长度、羊毛长度等生产性状进行关联分析。结果显示:PCR-SSCP检测发现KAP7.1基因只有1种带型,KAP8.2基因有6种带型;KAP7.1基因扩增产物序列中未发现碱基变化;KAP8.2基因扩增产物序列中存在5个SNPs位点,分别为C115T、A207G、A214G、G216A和A278T,除了A278T外都位于编码区;对KAP8.2基因的基因型1、基因型2和基因型3与生产性能进行关联分析发现,基因型1个体的胸深和产绒量显著高于基因型3个体(P<0.05)。结果表明:KAP8.2基因可作为影响西藏绒山羊胸深和产绒量的分子辅助选择标记。
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黑白花牛INHA基因多态性与超数排卵性状关系
《基因组学与应用生物学 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：为了研究黑白花牛抑制素α基因(INHA)的遗传多样性和超数排卵效果的关联分析,找到一种能够作为黑白花牛超数排卵预测的候选基因,本试验以50头黑白花牛为实验材料,对其进行了超排处理并且采集了黑白花牛的血液样本提取基因组。采用PCR-SSCP技术,在INHA基因的第一外显子和第二外显子各设计了一对引物进行基因型检测,然后与超排性状进行关联分析。结果表明:黑白花牛INHA基因的177 bp处(+1为转录起始位点)存在一个A>G突变的多态性位点,AA和AG基因型的频率分别为0.62和0.38。与超排性状关联分析,结果显示AG基因型黑白花牛的排卵数和鲜胚数均显著多于AA基因型(p<0.05),这说明黑白花牛个体的超排性状可能与其本身的INHA基因的遗传特性有关。
关键词： 黑白花牛 抑制素α(INHA) 多态性 超数排卵
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西藏绒山羊的微卫星多态性与部分经济性状的关联分析
《西藏农业科技 》 2019
摘要：为了解微卫星位点在西藏绒山羊群体中的多态性与经济性状的关联性,试验采用PCR-SSCP技术对340只西藏绒山羊的10个微卫星位点进行多态性分析,并采用Duncan氏法进行多重比较,与体长、体高、胸围、羊绒长度、羊毛长度的关联性进行分析.结果表明,除位点BM6438无多态性外,其他9个位点都具有多态性,基因型都在5个以上.与经济性状进行关联性分析发现在体长性状中,位点BM3033的基因型6显著高于其他基因型个体(P <0. 05);在体高性状中,位点BMS1248的基因型1和位点BM3033的基因型6显著高于其他基因型;在胸围性状中,位点BMS1248的基因型2和位点BM3033的基因型6显著高于其他基因型个体(P <0. 05);在绒长性状中,位点BMS1788的基因型3显著高于其他基因型个体(P <0. 05);在毛长性状中,位点BM3413的基因型1和基因型2显著高于其他基因型个体(P <0. 05).本研究结果可为西藏绒山羊分子标记辅助选择提供参考依据.
关键词： 微卫星 PCR-SSCP 经济性状 多态性 西藏绒山羊
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西藏绒山羊KAP9.2基因CDS克隆、外显子区多态性及表达分析
《基因组学与应用生物学 》 2019
摘要：KAP9.2基因是角蛋白关联蛋白(keratin associated protein, KAP)中的一员,在毛发的形成过程中有重要的调控作用.本研究对西藏绒山KAP9.2基因CDS进行了克隆;采用直接测序法对绒山羊200个个体KAP9.2基因外显子区的遗传变异情况进行分析;并利用Real-time PCR分析了KAP9.2基因在不同海拔山羊中的表达.结果显示,西藏绒山羊KAP9.2基因CDS序列为576 bp,编码191个氨基酸;KAP9.2基因外显子存在25处SNP位点及一处30 bp的缺失突变,其中12处SNP为错义突变,其他13处为同义突变.遗传多态性分析表明KAP9.2基因多态性丰富,遗传变异大;连锁分析发现12与388位点、54与93位点、153与159位点、273与279位点完全连锁,H1为优势单倍型;Real-time PCR显示西藏绒山羊KAP9.2基因在高海拔地区m RNA表达水平显著高于特高海拔地区,推测该基因可能促进绒毛的生长.本研究结果揭示了西藏绒山羊KAP9.2基因的遗传多态性及其在不同海拔的表达,为进一步研究KAP9.2基因潜在的功能位点提供一定的理论依据.
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牦牛GPR41基因遗传多态性与生长性状关联性研究
《中国畜牧杂志 》 2019 北大核心
摘要：本研究旨在探讨G蛋白偶联受体41(GPR41)基因在牦牛中的遗传多态性,对麦洼牦牛(50头)、申扎牦牛(47头)和类乌齐牦牛(28头)GPR41基因外显子区域片段进行扩增,筛查SNPs位点,利用RFLP分子标记技术鉴定其基因型,开展其与生长性状间的关联分析,为牦牛品种改良和选育提供遗传学依据。结果表明:在麦洼牦牛中未发现突变位点,申扎和类乌齐牦牛在外显子2区域发现1个突变位点,第4570位碱基发生G→A突变,属同义突变;经RFLP鉴定出3种基因型,命名为AA、AG和GG;χ~2适应性检验显示,申扎牦牛基因型分布不符合Hardy-Weinberg平衡(P<0.01),类乌齐牦牛处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);申扎牦牛和类乌齐牦牛均表现为中度多态;GPR41基因不同基因型与申扎牦牛体重和体高显著相关,且GG型显著高于AA型(P<0.05),而GPR41基因不同基因型对类乌齐牦牛各体尺性状无显著性影响(P>0.05)。综上,申扎牦牛GPR41基因G4570A基因座可为牦牛选育过程中分子标记选择提供参考。
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西藏绒山羊KAP13.1基因的多态性及其与生产性状的关联分析
《黑龙江畜牧兽医 》 2018 北大核心
摘要：为了解角蛋白关联蛋白(KAP)13.1基因在西藏绒山羊群体中的多态性与其生产性状的关联性,试验采用PCR-SSCP和DNA测序技术对343只西藏绒山羊KAP13.1基因编码区序列进行多态性分析,采用邓肯氏法进行多重比较,并与体长、体高、胸围、产绒量、羊绒长度、羊毛长度的关联性进行分析。结果表明:扩增产物序列中存在5个SNPs位点,分别为C73A、T115C、C124T、C213G和G447A,SNP位点都位于编码区。基因型2公羊的胸围、产绒量和毛长显著高于基因型3(P<0.05),而母羊的生产性能在3个基因型中差异不显著(P>0.05))。说明KAP13.1基因可作为影响西藏绒山羊公羊胸围、产绒量和毛长的分子标记。
关键词： 西藏绒山羊 KAP13.1基因 多态性 生产性状 相关性分析
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TCF7基因增强子区域一处SNP在三尾型极端差异的绵羊群体中的多态分析
《新疆农业科学 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：【目的】检测尾型极端差异的阿勒泰羊、湖羊和藏羊三群体中TCF7基因增强子一处SNP是否存在分化现象,从而确定该SNP是否可作为一个有效地筛选脂尾与瘦尾性状的分子标记。【方法】对三品种绵羊286份基因组进行目标SNP片段的扩增,并采用PCR-RFLP方法对以上样本扩增片段进行酶切分型,最后采用卡方检验的方法验证各基因型在各群体中的Hardy-Weinberg平衡性。【结果】高效扩增出所有样本含该SNP DNA扩增,经Mfe I酶切分型后共鉴定出了三种基因型(CC、TT和CT),其中CC基因型在瘦尾藏羊群体中的百分比高达80.3%,是脂尾型阿勒泰羊与湖羊的两倍以上。C/T等位基因的比率显示藏羊群体中这一比值分别为其他两种脂尾型绵羊品种的8倍,提示T等位基因可能与脂尾性状相关。【结论】该SNP可作为脂、瘦尾羊选育的一个分子标记。
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X染色体一处新发现的SNP位点在脂尾(臀)、瘦尾绵羊群体中的多态检测及分析
《西南农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：脂尾(臀)性状是绵羊逆境生存之需的必要性状,其在尾臀部位大量囤积脂肪的分子机理亟待解析。为此,本研究以国外新近报道的X染色体一处可能与尾脂性状相关的SNP为研究对象,检测该位点在我国巨臀脂型阿勒泰羊、短脂尾型湖羊以及瘦尾萨福克羊群体中的多态性,并验证该位点是否可作为一个有效的分子标记应用于高、低脂绵羊新品种培育。本研究成功地扩增出了含绵羊X染色体59257971位点SNP的170 bp片段,并采用PCR-RFLP方法进行SNP分型。研究结果表明我国脂臀型阿勒泰羊、短脂尾型湖羊和瘦尾萨福克羊在X染色体59257971位点均以AA基因型为主要基因型,3个群体中均没有发现GG基因型,说明脂臀(尾)与瘦尾绵羊品种间、臀尾异常丰满的阿勒泰羊与尾脂较为丰满的湖羊群体间等位基因并无明显差异,暗示该位点不能作为选育我国高、低脂绵羊品种的有效分子标记。
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欧拉型藏绵羊血清运铁蛋白多态性的研究
《中国畜牧兽医 》 2010 北大核心
摘要：采用聚丙烯酰胺凝胶电泳方法对欧拉型藏绵羊的74份血样进行了血清运铁蛋白(serumtransferrin,TF)多态性的研究。结果发现,被检欧拉型藏绵羊的血清TF位点上检测出TFA、TFB、TFC、TFD和TFM5个复等位基因,其中TFB、TFC和TFD为优势等位基因,其基因频率分别为0.4122、0.2973和0.2162;发现TFAB、TFAC、TFAD、TFBB、TFBC、TFBD、TFBM、TFCC和TFDD等9种基因型,其中TFBC、TFBB、TFBD、TFCC和TFDD为优势基因型,其基因型频率分别为0.2703、0.1622、0.1622、0.1351和0.1216;TF位点的基因杂合度为0.6921。
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