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西藏青稞品系藏青148响应低温的蛋白组学分析
《西藏农业科技 》 2018
摘要：为进一步了解冷驯化后的青稞苗对低温胁迫的响应机制,本研究采用藏青148作为材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)标记联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术并结合生物信息学和分子生物学技术对青稞低温诱导的蛋白组差异蛋白谱进行分析。结果表明,在iTRAQ测序分析的常温及冷驯化后低温处理的样品肽段图谱中,共鉴定出5111个蛋白质,肽链长度主要分布在6-24个氨基酸之间。通路分析显示,鉴定到的蛋白质被富集到126个通路。COG分析显示,R类蛋白数量最多,同时鉴定的蛋白涉及能量代谢、信号转导、防御机制等多个方面。对照常温和低温处理18h筛选到的差异蛋白有886个,存在499个上调,387个下调,且在代谢通路、乙醛酸代谢、三羧酸循环、糖酵解四条通路显著富集。
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青稞品种籽粒品质性状研究
《西藏农业科技 》 2018
摘要：为了探究不同品种青稞的籽粒品质的差异,本文对200份不同来源的青稞品种进行了研究。结果显示,营养品质研究中,200份青稞品种的总淀粉含量差异较小,在对直链淀粉和支链淀粉的比例研究时,发现了特异性C2品种,其支链淀粉含量达到100%。在对淀粉的糊化特性进行研究,发现各个品种间的衰减值差异最大,变异系数高达22.33%,这也是所有研究的性状中变异系数最大的一组。在对蛋白质含量研究时发现,不同品种间的蛋白质含量差异较大,变化范围在6. 65%-19.65%,差异系数达到17. 16%。对于β-葡聚糖的研究,发现其含量在3.04%～11.23%,平均数为5.91%,与以往研究一致。本次实验为青稞籽粒的加工应用、品质的改良、培育新品种、以及对青稞的籽粒品质形成的分子机理研究提供了良好的理论依据和数据支持,对青稞的探究和应用具有十分重要的意义。
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西藏青稞品系藏青13氮胁迫的蛋白组学分析
《西藏农业科技 》 2018
摘要：氮元素过多过少都可能导致植株表型发生明显变化,甚至影响植株的正常生长发育。为了探究西藏青稞对不同氮浓度的响应,本研究采用藏青13作为材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation, Itraq)标记联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术并结合生物信息学和分子生物学技术对适氮、缺氮、低氮和高氮处理样品的蛋白谱进行分析。iTRAQ测序结果表明,在根组织共鉴定得到8589个蛋白质,肽链长度主要分布在6～18个氨基酸之间;在叶组织中鉴定得到4608个蛋白质,肽链长度主要分布在6～16个氨基酸之间。COG分析显示,R类蛋白数量最多,同时鉴定的蛋白涉及次生代谢生物合成、信号转导、防御机制等多个方面。在不同氮素浓度处理下,其中缺氮处理与对照(适氮处理)相比,所筛选到的差异蛋白最多,有1518个蛋白,其中810个上调,708个下调。四个处理共同筛选到的差异蛋白共富集到47个功能项中,包含20个生物过程GO功能项,15个细胞组分GO功能项,12个分子功能GO功能项。
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