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西藏青稞品系藏青148响应低温的蛋白组学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 原红军 1 ; 曾兴权 1 ; 王玉林 1 ; 徐其君 1 ; 扎桑 1 ; 于明寨 1 ; 顿珠加布 1 ; 尼玛扎西 1 ;

作者机构： 1.省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室;西藏自治区农牧科学院农业研究所;西藏自治区农牧科学院

关键词： 青稞;蛋白组;低温胁迫;差异表达蛋白

期刊名称： 西藏农业科技

ISSN： 1005-2925

年卷期： 2018 年 40 卷 S1 期

页码： 30-36

摘要： 为进一步了解冷驯化后的青稞苗对低温胁迫的响应机制,本研究采用藏青148作为材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)标记联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术并结合生物信息学和分子生物学技术对青稞低温诱导的蛋白组差异蛋白谱进行分析。结果表明,在iTRAQ测序分析的常温及冷驯化后低温处理的样品肽段图谱中,共鉴定出5111个蛋白质,肽链长度主要分布在6-24个氨基酸之间。通路分析显示,鉴定到的蛋白质被富集到126个通路。COG分析显示,R类蛋白数量最多,同时鉴定的蛋白涉及能量代谢、信号转导、防御机制等多个方面。对照常温和低温处理18h筛选到的差异蛋白有886个,存在499个上调,387个下调,且在代谢通路、乙醛酸代谢、三羧酸循环、糖酵解四条通路显著富集。

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