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西藏青稞品系藏青13氮胁迫的蛋白组学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王玉林 1 ; 曾兴权 1 ; 徐其君 1 ; 原红军 1 ; 扎桑 1 ; 于明寨 1 ; 顿珠加布 1 ; 尼玛扎西 1 ;

作者机构： 1.省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室;西藏自治区农牧科学院农业研究所;西藏自治区农牧科学院

关键词： 西藏青稞;蛋白组;氮胁迫;差异表达

期刊名称： 西藏农业科技

ISSN： 1005-2925

年卷期： 2018 年 40 卷 S1 期

页码： 37-44

摘要： 氮元素过多过少都可能导致植株表型发生明显变化,甚至影响植株的正常生长发育。为了探究西藏青稞对不同氮浓度的响应,本研究采用藏青13作为材料,利用同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation, Itraq)标记联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术并结合生物信息学和分子生物学技术对适氮、缺氮、低氮和高氮处理样品的蛋白谱进行分析。iTRAQ测序结果表明,在根组织共鉴定得到8589个蛋白质,肽链长度主要分布在6～18个氨基酸之间;在叶组织中鉴定得到4608个蛋白质,肽链长度主要分布在6～16个氨基酸之间。COG分析显示,R类蛋白数量最多,同时鉴定的蛋白涉及次生代谢生物合成、信号转导、防御机制等多个方面。在不同氮素浓度处理下,其中缺氮处理与对照(适氮处理)相比,所筛选到的差异蛋白最多,有1518个蛋白,其中810个上调,708个下调。四个处理共同筛选到的差异蛋白共富集到47个功能项中,包含20个生物过程GO功能项,15个细胞组分GO功能项,12个分子功能GO功能项。

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[6]西藏青稞品系藏青148响应低温的蛋白组学分析. 原红军,曾兴权,王玉林,徐其君,扎桑,于明寨,顿珠加布,尼玛扎西. 2018

[7]青稞β-葡聚糖生理功效、提取技术及其新产品研发. 强小林,申瑞玲,顿珠次仁,张文会,谭海运,张玉红,魏新虹,朱睦元. 2009

[8]缺氮处理对青稞幼苗生长和生理特性的影响. 韦泽秀,徐齐君,扎桑,王玉林,原红军,曾兴权,尼玛扎西. 2017

[9]基于转录组测序对犏牛和牦牛睾丸组织的分析研究. 钟金城,姬秋梅,柴志欣,刘仲娜,曾贤彬,宋乔乔,杨琴. 2013

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