科研产出
黑斑原鮡（Glyptosternum maculatum）皮肤RNA-Seq数据中补体样组分分析
《高原科学研究 》 2022 CSCD
摘要：黑斑原鮡为我国雅鲁藏布江特有鱼类，其皮肤补体系统在适应低温、急流水域特性中发挥着重要的作用。文章基于前期RNA-Seq数据检索黑斑原鮡（Glyptosternum maculatum）皮肤补体样组分，并对其结构域及高温应激后的基因表达水平进行了分析。结果表明：共获得79条补体样成分unigene，分别编码1个C1q结构域蛋白、1个含C1r结构域蛋白、3个纤维蛋白原相关蛋白、10个丝氨酸蛋白酶、11个含硫酯键蛋白、7个补体受体、14个补体调节因子及4个纤胶凝蛋白。结构域分析表明：黑斑原鮡补体样组分均含有相应的保守结构域，与其他鱼类补体组分的研究结果基本一致。经15℃养殖水温刺激后，79条补体样组分unigene中共有47条unigene表达上调，其中8条为模式识别受体unigene，结合其他鱼类补体组分的研究结果，推测黑斑原鮡已形成了一个含有多种补体组分的补体系统，且具有凝集素途径或替代途径行使补体的生物学功能。
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黑斑原鮡肝脏与副肝代谢差异比较
《中国水产科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：黑斑原鮡（Glyptosternum maculatum）是我国雅鲁藏布江中上游江段特有鱼类,为适应雅鲁藏布江急流、低温的水域环境条件,进化出独特的组织器官——副肝。本研究采用组织学、生物化学以及转录组学的方法开展了黑斑原鮡主肝与副肝代谢差异调控机制的研究。结果表明,黑斑原鮡主、副肝脏在结构组成、肝细胞线粒体数量及线粒体蛋白质组成上无显著差异。转录组学结果表明,主、副肝脏共有差异表达基因77个。经GO功能注释,筛选出羟甲基戊二酸单酰CoA合成酶（Hmgcl）、血栓素合成酶（Tbxas）、钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶（Cask）、甲酰甘氨酸生成酶（Sumf1）、蛋白质酪氨酸激酶（Jak1）以及甘油酸激酶（Glxk）等差异表达基因,这些基因富集到氨基酸代谢、脂肪代谢等过程。KEGG通路富集结果显示,差异表达基因富集到丁酸盐代谢通路（butanoate metabolism）、过氧化物酶体（peroxisome）、缬氨酸,亮氨酸和异亮氨酸降解（valine, leucine and isoleucine degradation）、赖氨酸降解（lysine degradation）、色氨酸代谢（tryptophan metabolism）以及代谢途径（metabolic pathways）等信号通路。选出4个差异表达基因进行实时荧光定量PCR（qRT-PCR）检测,结果显示qRT-PCR与转录组测序结果基本一致。综上所述,黑斑原鮡主、副肝脏存在氨基酸、脂肪酸及能量代谢差异,其代谢差异可能与Hmgcl、Ptk2b、Gba和Dnm1l等基因在主、副肝脏中的差异性表达有关（P<0.05）。本研究筛选出调节黑斑原鮡代谢差异的关键基因和信号通路,为揭示黑斑原鮡主、副肝脏代谢差异机制奠定了理论基础。
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西藏黑斑原鮡消化道寄生蠕虫的分布类型及种间关系
《中国水产科学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：黑斑原鮡（Glyptosternum maculatum）是中国唯一的原鮡属鱼类,在中国仅分布于西藏的雅鲁藏布江。在2019年5—8月对383尾黑斑原鮡消化道寄生蠕虫种类调查鉴定的基础上,对其感染数量的频率分布进行了统计,并分别用方差均值比和x2检验、共感染频率统计等方法对各寄生蠕虫种群的空间分布类型及消化道寄生蠕虫群落的种间关系进行了分析和判定。结果显示,深槽绦虫未定种（Bathybothrium sp.）、原头绦虫未定种（Proteocephalus sp.）和杆咽线虫未定种（Rhabdochonasp.）的分布模式为均匀分布;异肉吸虫未定种（Allocreadiumsp.）、新棘吻虫未定种（Neoechinorhynchus sp.）、裸鲤棘头虫（Echinorhynchus gymnocyprii）和Contracaecum eudyptulae呈聚集分布。异肉吸虫未定种与裸鲤棘头虫、新棘吻虫未定种与深槽绦虫未定种、新棘吻虫未定种与原头绦虫未定种、新棘吻虫未定种与异肉吸虫未定种,以及新棘吻虫未定种与杆咽线虫未定种间均为正关联;裸鲤棘头虫与异肉吸虫未定种间为负关联;其他寄生蠕虫物种两两之间不存在相互关联。共感染频率分布显示被感染的宿主多数只感染1种寄生虫,同时感染2种以上寄生虫的宿主约占被感染宿主群体的1/3,其中,共感染的最大物种数为4种,但频率只为1,以2种物种共同感染的情况居多。
关键词： 黑斑原鮡 消化道寄生蠕虫 频率分布 分布类型 种间关系 西藏
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黑斑原鮡皮肤组织结构及其COL1A1基因的克隆与分析
《高原科学研究 》 2021 CSCD
摘要：采用组织学与分子生物学方法开展了黑斑原鮡皮肤组织结构和Ⅰ型胶原蛋白基因的表达特征研究。结果表明:(1)黑斑原鮡的皮肤裸露无鳞,均由表皮和真皮组成。黑斑原鮡表皮层由复层上皮细胞和黏液细胞以及基底细胞组成。其表皮层的厚度显著大于真皮层厚度,且不同部位表皮层的厚度各不同,但各部位真皮层的厚度接近。其中,腹部表皮层的厚度最厚,为(102.36±3.43)μm;头部最薄,为(66.91±9.73)μm。(2)黑斑原鮡头部、背部色素细胞含量丰富,腹部色素细胞含量较少。(3)黑斑原鮡Ⅰ型胶原蛋白的α1基因(COL1A1)的c DNA全长序列为6 683 bp,其开放阅读框为4 350 bp,编码1 449个氨基酸。(4)BLAST同源性分析结果显示,黑斑原鮡COL1A1基因的氨基酸序列与巨魾的同源性最高,为92.06%,呈现出较高的保守性。(5)系统进化树分析表明,该基因与巨魾处于同一支,亲缘性最近。(6)生物信息学分析显示,黑斑原鮡COL1A1蛋白质的相对分子质量为137.14 KDa,理论等电点是5.42,为α螺旋β折叠三重螺旋结构蛋白,含有1个COLFI结构域、1个VWC结构域、1个RPT1结构域、2个RPT3结构域和8个Pfam Collagen结构域。
关键词： 黑斑原鮡 皮肤 组织结构 COL1A1基因 生物信息学
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西藏黑斑原鮡胚胎发育观察
《中国水产科学 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：黑斑原鮡(Glyptosternum maculatum)是中国唯一的原鮡属鱼类,仅分布在中国境内的西藏雅鲁藏布江水系。由于过度捕捞、水利工程影响、外来鱼类入侵等原因,其野生种群数量持续下降,分布范围逐年缩小,目前处于极危状态。本研究中黑斑原鮡亲鱼捕自西藏日喀则市谢通门县、拉孜县、昂仁县、萨嘎县4个地区的雅鲁藏布江江段,采样地海拔分布范围介于3900～4500 m。2015年5月中旬至6月中旬,人工催产雌鱼79尾,自然排卵7尾,解剖雄鱼15尾进行授精,得到了黑斑原鮡受精卵约42208粒。受精卵为圆形的沉性卵,略显淡黄色,黏性较强。将受精卵平铺放在特制筛网上,置于微流水的平列槽内进行孵化。观察从受精卵至仔鱼孵化出膜的胚胎发育过程,统计有效积温。结果显示:黑斑原鮡胚胎发育时序符合硬骨鱼类胚胎发育的一般规律,分为8个阶段,即受精卵、胚盘形成、卵裂、囊胚、原肠、神经胚、早期器官形成及孵出阶段。胚孔封闭前就形成了肌节和眼囊,进入早期器官形成阶段后依次出现了耳囊、心脏原基、消化道、耳石、眼睛体、胸鳍原基等,心脏搏动后红细胞也有出现。整个胚胎发育期间的平均温度约为13.8℃,有效积温为2963.2～3132.4 h.℃,孵化率约为70%。本研究还发现黑斑原鮡胚胎具有双层卵膜的特殊结构,该结构在成熟卵吸水膨胀后形成,进入神经胚期完全消失,分析推测这种结构可能与对环境的适应有关,外层卵膜在卵的传播和孵化过程中可以起到黏附固定和缓冲保护的作用。本研究旨在深入了解黑斑原鮡胚胎发育的特点及规律,为黑斑原鮡资源恢复及科学保护提供理论参考。
关键词： 黑斑原鮡 胚胎发育 形态特征 时序性 双层卵膜 雅鲁藏布江 西藏
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西藏黑斑原鮡胚胎发育观察
《中国水产科学 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：黑斑原鮡(Glyptosternum maculatum)是中国唯一的原鮡属鱼类,仅分布在中国境内的西藏雅鲁藏布江水系.由于过度捕捞、水利工程影响、外来鱼类入侵等原因,其野生种群数量持续下降,分布范围逐年缩小,目前处于极危状态.本研究中黑斑原鮡亲鱼捕自西藏日喀则市谢通门县、拉孜县、昂仁县、萨嘎县4个地区的雅鲁藏布江江段,采样地海拔分布范围介于3900~4500 m.2015年5月中旬至6月中旬,人工催产雌鱼79尾,自然排卵7尾,解剖雄鱼15尾进行授精,得到了黑斑原鮡受精卵约42208粒.受精卵为圆形的沉性卵,略显淡黄色,黏性较强.将受精卵平铺放在特制筛网上,置于微流水的平列槽内进行孵化.观察从受精卵至仔鱼孵化出膜的胚胎发育过程,统计有效积温.结果显示:黑斑原鮡胚胎发育时序符合硬骨鱼类胚胎发育的一般规律,分为8个阶段,即受精卵、胚盘形成、卵裂、囊胚、原肠、神经胚、早期器官形成及孵出阶段.胚孔封闭前就形成了肌节和眼囊,进入早期器官形成阶段后依次出现了耳囊、心脏原基、消化道、耳石、眼睛体、胸鳍原基等,心脏搏动后红细胞也有出现.整个胚胎发育期间的平均温度约为13.8℃,有效积温为2963.2~3132.4 h.℃,孵化率约为70%.本研究还发现黑斑原鮡胚胎具有双层卵膜的特殊结构,该结构在成熟卵吸水膨胀后形成,进入神经胚期完全消失,分析推测这种结构可能与对环境的适应有关,外层卵膜在卵的传播和孵化过程中可以起到黏附固定和缓冲保护的作用.本研究旨在深入了解黑斑原鮡胚胎发育的特点及规律,为黑斑原鮡资源恢复及科学保护提供理论参考.
关键词： 黑斑原鮡 胚胎发育 形态特征 时序性 双层卵膜 雅鲁藏布江 西藏
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病死黑斑原鮡表皮和肠道微生物群落研究
《安徽农业科学 》 2018
摘要：[目的]了解病死黑斑原鮡表皮和肠道微生物群落的变化及其与黑斑原鮡死亡的关系。[方法]利用新一代高通量测序技术,研究病死黑斑原鮡表皮皮肤黏液和肠道内容物微生物群落的变化及其对黑斑原鮡死亡的影响。[结果]黑斑原鮡病变死亡后,肠道中Acinetobacter sp.、Flavobacterium sp.、Vagococcus sp.、Carnobacterium sp.、Bacillus sp.和Malassezia sp.6种优势微生物菌群减少,而Pseudomonas sp.、Tremellales和Agaricomycetes 3种优势微生物菌群增加;黑斑原鮡病变死亡后其表皮皮肤黏液中Pseudomonas sp.、Vagococcus sp.、Providencia sp.、Morganella sp.、Pleosporales、Mucorales、Tremellales和Agaricomycetes 8种优势微生物菌群减少,而Acinetobacter sp.、Proteus sp.、Carnobacterium sp.和Malassezia sp.4种优势微生物菌群增加。[结论]细菌和真菌在黑斑原鮡表皮和肠道中菌群的变化,可能是导致黑斑原鮡病变死亡的主要原因之一。
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黑斑原鮡的生物学研究进展
《安徽农业科学 》 2016
摘要：黑斑原鮡是我国西藏雅鲁藏布江特有物种,主要分布于日喀则、拉萨、林芝等地区。从黑斑原鮡的形态与组织特征、消化系统与食性、年龄与生长、生理生化特性、性腺发育、繁殖生物学研究和遗传学研究等方面进行了综述,并指出黑斑原鮡资源合理开发与利用中亟待解决的关键问题。
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西藏黑斑原鮡的人工繁殖初报（英文）
《Agricultural Science & Technology 》 2016
摘要：为了解决黑斑原鮡的人工繁殖技术,该文以雅鲁藏布江特有的黑斑原鮡为研究对象,选取86尾体重在0.065~0.25 kg的雌鱼,15尾平均体重在0.30 kg的雄鱼,雌鱼采用胸鳍注射的方式注射催产药物。结果显示,雌鱼人工授精尾数为59尾,受精卵总重量为897.5 g,总卵量为57 440粒,平均怀卵量为1 194粒,怀卵量与体重呈显著相关。平均催产率为69%,平均受精率为73.5%,黑斑原鮡受精卵孵化水温为13~14℃,溶氧量6.0~7.2 mg/L,胚胎发育所需积温范围为2 592~2 916℃·h。这一套全人工繁殖技术的成功,对黑斑原鮡的人工养殖具有重要的意义。
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