西藏冬青稞种质资源SNP标记的遗传多样性分析

孟霞; 曾兴权; 其美旺姆; 尼玛扎西; 《现代农业科技 》 2018

摘要：单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是等位基因间序列差异最为普遍的类型,可作为一种高通量的遗传标记。利用Illuminai Select 9k SNP芯片对96个西藏冬青稞种质资源进行了SNP检测。结果表明,在分布于7条染色体上的7 000个SNP位点中,5 026个检测到了多态性,多态性比率为71.8%;SNP聚类分析将96份西藏冬青稞种质资源聚成七大类群,种质资源间的遗传相似系数(GS),其变异范围为0.288~0.999,平均值为0.771。96份西藏冬青稞种质资源间亲缘关系较近,遗传基础比较单一。

关键词： 西藏冬青稞 种质资源 单核苷酸多态性(SNP) 遗传多样性