科研产出
西藏4个绵羊品种SNP基因分型及群体结构分析
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：藏系绵羊分布范围广泛，品种资源丰富，目前主要分为三大类群，但藏系绵羊群体结构不清。为分析藏系绵羊SNP位点及群体结构，实验利用Illumina Ovine SNP 600K商业化芯片对西藏阿旺绵羊、岗巴绵羊、多玛绵羊和霍尔巴绵羊等150只藏系绵羊进行了SNP基因分型，并通过PCA和NJ-tree等方法分析了藏系绵羊群体结构。SNP质控结果表明，共有147个个体符合质控条件，共获得456 418个SNP位点。群体结构分析表明，西藏地区的岗巴绵羊、多玛绵羊和霍尔巴绵羊分别聚为一类，而其他地区的藏系绵羊混乱聚集在一起。本实验研究结果为今后西藏当地绵羊遗传资源的鉴定和保护开发利用提供了理论基础和参考依据。
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西藏牦牛群体遗传多样性及遗传结构分析
《中国草食动物科学 》 2024
摘要：采集西藏地区5个牦牛类群（西藏高山牦牛，类乌齐牦牛，帕里牦牛，斯布牦牛，娘亚牦牛）共49头牦牛的血样，利用全基因组重测序技术对其遗传多样性及遗传结构进行了分析，以期为西藏牦牛遗传资源的保护、开发和利用提供参考。SNP变异检测结果表明，经过滤后得到7 655 923个SNP位点；群体遗传多样性分析发现，西藏地区不同牦牛群体之间的基因杂合度差异并不显著，且均存在不同程度的杂合度下降现象，类乌齐牦牛的观测杂合度最高，为0.336 4；群体结构分析发现，5个牦牛类群之间存在基因交流现象。说明目前西藏牦牛各群体整体存在遗传多样性下降的潜在风险，需要进一步加强群体保种工作，以确保不同品种资源的多样性得到有效保护。
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青稞种质资源遗传多样性分析与核心种质群体的构建
《麦类作物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为有针对性地利用青稞种质资源,收集世界各地青稞种质资源共1 220份,利用95对SSR引物评估其遗传多样性与亲缘关系。结果表明,利用95对SSR引物总共检测到451个等位变异,平均每对引物4.74个,变化范围为1~19。1 220份青稞种质可被划分为A1和A2两个亚群,A1亚群有192份材料,主要为国外青稞种质;A2亚群有1 028份材料,主要为青藏高原地区种质;与A2亚群相比,A1亚群具有较高的遗传多样性和等位变异丰度。分子方差分析和遗传分化分析显示,A1和A2亚群间具有显著的群体分化,群体间遗传差异能解释17.29%群体方差。构建的青稞核心种质群体包括300个材料,代表了原始群体约98.4%的遗传变异和94.7%以上的表型变异。
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青藏高原青稞耐寒种质资源基于SSR标记的遗传多样性及群体结构分析
《麦类作物学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：为了解青藏高原青稞耐寒种质资源的遗传基础,利用SSR标记分析了来自青藏高原地区的71份青稞耐寒育种资源的遗传多样性和群体遗传结构。结果表明,利用从分布于大麦7个连锁群上的200对SSR引物中筛选的48对多态性引物,共检测到230个等位条带,变化范围为1~10个,平均每对SSR引物可检测到4.79个条带。多态性信息含量(PIC)变化范围为0.054 7~0.856 9,平均值为0.489 8。遗传相似系数(GS)的变化范围为0.469~0.924,平均值为0.745。经聚类分析,在GS约0.740处可将71份材料分为五大类,第51、43和14号品种分别聚为A、B和C类,第22、27、39和50号品种聚为D类,其余64个品种聚为E类,其中,第51号品种的穗长(3.8cm)、穗粒数(44.2粒)最低,第43号的单穗小穗数(90个)最高,但千粒重(35.6g)最低,第14号品种的生育期(86d)最短,但穗粒数(69.6粒)最多。此外,群体遗传结构分析表明,71份青稞资源材料可划分为2个亚群。
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