科研产出
麦洼牦牛CYP4A 11基因多态性与体尺性状的关联分析
《基因组学与应用生物学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了探讨细胞色素P450 4A 11基因外显子多态性与麦洼牦牛体尺性状的相关性,挖掘与体尺性状显著关联的SNP位点,本研究选取麦洼牦牛为研究对象,通过PCR扩增和DNA测序技术,共发现G4806A、G10008A、G10185A、T13164C、A13199G和C13207T 6个SNPs,优势基因型分别为GG、GA、GA、TT、AA和TC型;位点G4806A和A13199G处于Hardy-Weinberg平衡状态,其余4个多态位点均未能达到哈代温伯格平衡.关联分析发现,G4806A位点与麦洼牦牛胸围和体重极显著相关(p<0.01),与管围显著相关(p<0.05),其中GA型个体均值显著高于GG型个体(p<0.05),表现为优势基因型;其他位点与麦洼牦牛体尺性状均不相关.CYP4A 11基因G4806A位点与牦牛胸围、体重及管围等体尺性状显著相关,可作为分子辅助标记用于牦牛优良性状的选育.
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西藏牦牛MyoD1基因多态性及与生长性状的关联性分析
《西南农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】本研究旨在对西藏牦牛MyoD1基因多态性与体高、体重、体斜长、胸围和管围等生长性状进行关联性分析,以期获得对牦牛重要经济性状具有显著效应的遗传标记。【方法】本研究利用DNA池直接测序、PCR-RFLP与生物信息学技术,对西藏帕里(PL)、斯布(SB)、申扎(SZ)和类乌齐(LWQ)4个牦牛类群(品种)共148头个体的MyoD1基因内含子2及外显子3部分序列进行遗传多态性分析,统计基因和基因型频率,进行Hardy-Weinberg平衡性检测,计算纯合度、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数等遗传多态指标,分析不同基因型与体高、体重、体斜长、胸围和管围等生长性状的关联性。【结果】①西藏牦牛MyoD1基因外显子3上存在(C1710T)XmaI酶切位点,多态性检测均存在CC、CT和TT 3种基因型,T/C频率分别为:0.308/0.692、0.400/0.600、0.605/0.395和0.527/0.473,处于中度多态。②适合性检验表明,西藏4个牦牛类群MyoD1基因多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。③利用最小二乘拟合线性模型,对各标记基因型生长发育指标(体高、体斜长、胸围、管围和体重)进行差异显著性检验,申扎牦牛该位点TT和CT基因型在生长性状上差异显著(P<0.05),CT基因型胸围均高于CC和TT基因型。【结论】可以将MyoD1上的C1710T基因座作为牦牛经济性状选育的一个重要遗传标记,用于育种改良。
关键词： 西藏牦牛 MyoD1基因 PCR-RFLP 生长性状 关联分析
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牦牛GPR41基因遗传多态性与生长性状关联性研究
《中国畜牧杂志 》 2019 北大核心
摘要：本研究旨在探讨G蛋白偶联受体41(GPR41)基因在牦牛中的遗传多态性,对麦洼牦牛(50头)、申扎牦牛(47头)和类乌齐牦牛(28头)GPR41基因外显子区域片段进行扩增,筛查SNPs位点,利用RFLP分子标记技术鉴定其基因型,开展其与生长性状间的关联分析,为牦牛品种改良和选育提供遗传学依据。结果表明:在麦洼牦牛中未发现突变位点,申扎和类乌齐牦牛在外显子2区域发现1个突变位点,第4570位碱基发生G→A突变,属同义突变;经RFLP鉴定出3种基因型,命名为AA、AG和GG;χ~2适应性检验显示,申扎牦牛基因型分布不符合Hardy-Weinberg平衡(P<0.01),类乌齐牦牛处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);申扎牦牛和类乌齐牦牛均表现为中度多态;GPR41基因不同基因型与申扎牦牛体重和体高显著相关,且GG型显著高于AA型(P<0.05),而GPR41基因不同基因型对类乌齐牦牛各体尺性状无显著性影响(P>0.05)。综上,申扎牦牛GPR41基因G4570A基因座可为牦牛选育过程中分子标记选择提供参考。
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南江黄羊ARHGAP11A基因SNPs筛选及其与生长性状的关联分析
《四川农业大学学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探讨ARHGAP11A基因与南江黄羊生长性状的关联。【方法】以南江黄羊(母羊,n=243)为试验材料,采用PCR产物直接测序筛选ARHGAP11A基因的SNP位点并分析其与性状之间的关联。【结果】在南江黄羊群体中共发现ARHGAP11A基因16个SNPs位点。g.3483A>G和g.3621G>A的纯合突变具有增加南江黄羊体重(2月龄、6月龄和12月龄)以及胸围(6月龄)指标的趋势(P>0.05),而在g.3525A>G位点AG型羊初生重、12月龄体重和12月龄胸围显著高于GG型个体(P<0.05)。AAGT单倍型山羊体重体尺均高于AGGT和GGAT个体(P>0.05)。【结论】南江黄羊母羊群体中ARHGAP11A基因突变与生长发育密切相关,进一步验证其功能后在选育中可考虑其作为辅助选择标记。
关键词： 南江黄羊 ARHGAP11A基因 单核苷酸多态性位点(SNP) 生长性能 关联分析
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