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基于Cytb基因多态性研究西藏地区8个藏山羊群体遗传结构及母系起源

文献类型： 中文期刊

作者： 邓娟 1 ; 张红平 2 ; 巴贵 2 ; 次仁德吉 2 ; 宋天增 2 ; 李利 3 ;

作者机构： 1.四川农业大学动物遗传育种研究所;西藏农牧科学院畜牧兽医研究所

2.;四川农业大学动物遗传育种研究所;西藏农牧科学院畜牧兽医研究所

3.;四川农业大学动物遗传育种研究所;西藏农牧科学院畜牧兽医研究所;

关键词： 藏山羊;Cytb;线粒体DNA;系统发育

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 65-74

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在基于Cytb基因多态性探讨藏山羊群体间遗传结构及其母系起源。对西藏8个地区157只藏山羊的细胞色素b基因(Cytb)全序列进行扩增和测序,分析群体遗传多样性,计算群体间遗传分化指数,构建系统发育邻接树等。结果显示,藏山羊Cytb全序列为1 140bp,在8个群体中共检测到33个变异位点,定义了30种单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.736和0.001 8,表明西藏地区藏山羊群体具有较丰富的遗传多样性。78.6%的群体间发生了显著的遗传分化(P<0.05),组内群体间的变异极显著(F_(SC)=0.321,P<0.001);系统发育邻接树分为了4个单倍型组(Haplogroup A-D),提示藏山羊有4个母系起源;单倍型网络图显示,不同地理来源的藏山羊没有完全聚类在同一群簇。在历史驯养过程中,藏山羊发生过群体扩增事件。本研究表明,西藏地区藏山羊有4个母系起源,并呈现出较丰富的遗传多样性,虽然群体间有一定程度的遗传分化,但没有形成明显的地理分隔格局,遗传结构差异在缩小。本研究结果为藏山羊遗传资源的保护和利用提供了科学依据。

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[1]基于线粒体ATP6及Cytb基因多态性研究藏山羊高原适应性. 邓娟,张红平,余佳林,宋天增,李利. 2020

[2]藏山羊产绒量与影响因子的相关和通径分析及最优回归模型的建立. 许期树,王杰,张亚美,华太才让,益西多杰,姬秋梅. 2006

[3]西藏日土藏山羊ISSR标记遗传多态性研究. 王永,王杰,许期树,字向东,欧阳熙,刘鲁蜀,小益西. 2010

[4]西藏部分山羊群体线粒体DNA D-loop区遗传多样性及系统进化分析. 黄兴,柴志欣,信金伟,王会,王吉坤,姬秋梅,钟金城. 2019

[5]N-乙酰半胱氨酸对藏山羊母羊被公羊诱导发情效果与妊娠前期外周血液雌二醇和孕酮浓度的影响. 宋天增,巴贵,次仁德吉,德吉,索朗达,吴玉江. 2020

[6]比较基因组学分析鉴定影响藏山羊耳朵大小的遗传位点. 钟杰,李利,宋天增,张红平,郭家中. 2019

[7]西藏牦牛mtDNA-Cytb及ZFY基因遗传多样性与系统进化分析. 季文博,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟,钟金城. 2019

[8]西藏牛亚科部分群体线粒体DNA遗传多样性研究. 黄兴,柴志欣,信金伟,王会,王吉坤,姬秋梅,钟金城. 2019

[9]西藏牦牛mtDNA ATP8全序列测定及遗传多样性分析. 杨琴,柴志欣,姬秋梅,张成福,信金伟. 2015

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