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鸡胚心脏组织转录组数据鉴定雪域白鸡高原低氧适应性关键基因

文献类型： 中文期刊

作者： 陈雪娇 1 ; 刘会杰 2 ; 臧蕾 2 ; 冯静 2 ; 鹏达 2 ; 张浩 1 ;

作者机构： 1.中国农业大学动物科学技术学院高原畜禽遗传资源研究中心

2.西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所

关键词： 雪域白鸡;白来航鸡;低氧适应;心脏;转录组

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2023 年 010 期

页码： 4154-4163

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在通过分析白来航（White Leghorn, WL）和雪域白鸡（Xueyu White chicken, XYW）在低氧条件下孵化时胚胎心脏组织的基因表达差异，挖掘鸡胚低氧适应候选基因。本研究在高海拔环境孵化雪域白鸡和白来航鸡种蛋，采集孵化第16天胚胎心脏组织，提取RNA,进行转录组测序（RNA-seq）,筛选差异表达基因（DEGs）,并对其进行荧光定量PCR（qRT-PCR）验证、功能富集分析和构建转录因子-靶基因调控网络，鉴定与雪域白鸡低氧适应相关的候选基因。在雪域白鸡和白来航鸡的心脏组织之间筛选到253个DEGs,随机选择5个DEGs进行qRT-PCR验证，表达趋势与测序结果一致。功能富集分析表明，DEGs主要涉及心血管发育和心脏功能相关的生物学过程和信号通路。将DEGs和已知的鸡转录因子对比，筛选到FOXP2和HOXA2,参与调控血管生成、心肌收缩等，对雪域白鸡胚胎低氧适应起关键作用。本研究通过鸡胚心脏组织转录组数据分析，鉴定到TENM2、NOG、SMOC1、CCBE1等鸡胚高原低氧适应候选基因，为解析雪域白鸡高原低氧适应分子机制提供理论依据。

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