文献类型: 中文期刊
作者: 陈雪娇 1 ; 刘会杰 2 ; 臧蕾 2 ; 冯静 2 ; 鹏达 2 ; 张浩 1 ;
作者机构: 1.中国农业大学动物科学技术学院高原畜禽遗传资源研究中心
2.西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所
关键词: 雪域白鸡;白来航鸡;低氧适应;心脏;转录组
期刊名称: 畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2023 年 010 期
页码: 4154-4163
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 旨在通过分析白来航(White Leghorn, WL)和雪域白鸡(Xueyu White chicken, XYW)在低氧条件下孵化时胚胎心脏组织的基因表达差异,挖掘鸡胚低氧适应候选基因。本研究在高海拔环境孵化雪域白鸡和白来航鸡种蛋,采集孵化第16天胚胎心脏组织,提取RNA,进行转录组测序(RNA-seq),筛选差异表达基因(DEGs),并对其进行荧光定量PCR(qRT-PCR)验证、功能富集分析和构建转录因子-靶基因调控网络,鉴定与雪域白鸡低氧适应相关的候选基因。在雪域白鸡和白来航鸡的心脏组织之间筛选到253个DEGs,随机选择5个DEGs进行qRT-PCR验证,表达趋势与测序结果一致。功能富集分析表明,DEGs主要涉及心血管发育和心脏功能相关的生物学过程和信号通路。将DEGs和已知的鸡转录因子对比,筛选到FOXP2和HOXA2,参与调控血管生成、心肌收缩等,对雪域白鸡胚胎低氧适应起关键作用。本研究通过鸡胚心脏组织转录组数据分析,鉴定到TENM2、NOG、SMOC1、CCBE1等鸡胚高原低氧适应候选基因,为解析雪域白鸡高原低氧适应分子机制提供理论依据。
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