文献类型: 中文期刊
作者: 李施蒙 1 ;
作者机构: 1.西藏自治区农牧科学院农业研究所
关键词: 甘蓝型油菜;MTP1基因;重金属耐受蛋白;锌;CDF家族;生物信息学
期刊名称: 广东农业科学
ISSN: 1004-874X
年卷期: 2018 年 09 期
页码: 21-27
摘要: 以拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMTP1基因序列为参考,利用白菜(Brassica rapa)、甘蓝(Brassica oleracea)、甘蓝型油菜(Brassica napus)全基因组数据对MTP1基因进行全基因组水平鉴定,通过Blastn比对和保守结构域分析,在芸薹属AC基因组中共鉴定到8个MTP1基因,其中白菜1个、甘蓝3个、甘蓝型油菜4个(A亚基因组3个、C亚基因组1个)。生物信息学分析结果表明,在蛋白质理化性质、二级结构、跨膜结构域、磷酸化位点等方面,3个物种中的MTP1基因间各有差异,并使用甘蓝型油菜转录组数据比较分析4个BnMTP1基因在不同组织部位的表达模式。
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