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牡丹5个管家基因的克隆及其在系统进化分析中的应用

文献类型: 中文期刊

作者: 王顺利 1 ; 薛璟祺 1 ; 任秀霞 1 ; 李丹丹 1 ; 杨若雯 1 ; 曾秀丽 2 ; 张秀新 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院蔬菜花卉研究所

2.西藏自治区农牧科学院蔬菜研究所

关键词: 牡丹;管家基因;系统发生;进化

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2016 年 43 卷 02 期

页码: 307-319

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用RT-PCR技术从牡丹组7个野生种和1个栽培种中分别克隆得到泛素延伸蛋白基因(ubiquitin,UBI)、素环蛋白基因(cyclophilin,CYP)、肌动蛋白基因(Actin)、葡萄糖六磷酸脱氢酶基因(glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase,G6PD)和β–微管蛋白基因(beta-tubulin,TUB)等5个管家基因的编码序列(coding sequence,CDS)。序列比对分析发现,5个管家基因序列均相对保守,其在牡丹7个野生种和1个栽培种中的保守性在99.04%~99.69%。利用5个管家基因分别构建了其在牡丹组8份材料中的系统进化树。5个系统进化树均将8份材料分成两组,即革质花盘亚组和肉质花盘亚组;由于5个管家基因核苷酸序列各自的保守性不同,在区分亚组成员间略有差异。综合分析5个管家基因构建的系统进化树可知,杨山牡丹(Paeonia ostii)和栽培牡丹(P.suffruticosa‘Luoyanghong’)常聚为一支,二者亲缘关系较近,因而推测杨山牡丹可能参与了栽培牡丹的形成;紫斑牡丹(P.rockii)和四川牡丹(P.decomposita)一直聚为一支,推测二者亲缘关系较近;黄牡丹(P.lutea)和紫牡丹(P.delavayi)一直聚为一支,推测这二者亲缘关系较近。狭叶牡丹(P.potaninii)与黄牡丹和紫牡丹分化较早,结合前人研究结果建议将狭叶牡丹作为一个独立的种。

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