牦牛PID1基因克隆、生物信息学及组织表达分析

余道宁; 王佟; 洛桑顿珠; 平措占堆; 张强; 卓玛次仁; 尼玛加措; 张德荣; 梁春年; 《华北农学报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要：为研究牦牛磷酸酪氨酸互作结构域1基因(PID1)的结构及功能，并探究其在各组织中的表达情况，以桑桑牦牛脂肪组织cDNA为模板克隆桑桑牦牛PID1基因CDS区序列，并对其进行生物信息学分析。同时，采用实时荧光定量PCR方法(RT-qPCR),对牦牛的7个不同组织包括心、肝、脾、肺、肾、背部肌肉及脂肪进行PID1基因表达水平的定量。结果表明，牦牛PID1基因的编码区长度是654 bp,编码217个氨基酸；通过同源性比对，结果发现，牦牛与野牦牛之间的亲缘关系最为接近，相似度达到100%;经过蛋白质分析发现，牦牛PID1蛋白的分子质量约为24.84 ku,理论等电点为6.30。根据不稳定系数计算结果显示，其不稳定性较高(47.96),属于一种不稳定蛋白质。该蛋白内含有1个N-糖基化位点和23个磷酸化位点，无信号肽和跨膜结构。RT-qPCR试验结果表明，在各个组织中都能检测到PID1基因的表达情况，其中在肺部表达量最高。该研究克隆了牦牛PID1基因，并对其蛋白结构进行了分析，同时还研究了该基因在牦牛组织中的表达情况。为进一步探究PID1基因在牦牛脂肪沉积过程中的作用提供了初步数据。

关键词： 牦牛 PID1基因 基因克隆 生物信息学