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牦牛PID1基因克隆、生物信息学及组织表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 余道宁 1 ; 王佟 1 ; 洛桑顿珠 2 ; 平措占堆 2 ; 张强 2 ; 卓玛次仁 3 ; 尼玛加措 3 ; 张德荣 1 ; 梁春年 4 ;

作者机构: 1.西北民族大学生命科学与工程学院

2.西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所

3.日喀则市昂仁县农业农村局

4.中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所

关键词: 牦牛;PID1基因;基因克隆;生物信息学

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2024 年 39 卷 006 期

页码: 216-223

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究牦牛磷酸酪氨酸互作结构域1基因(PID1)的结构及功能,并探究其在各组织中的表达情况,以桑桑牦牛脂肪组织cDNA为模板克隆桑桑牦牛PID1基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析。同时,采用实时荧光定量PCR方法(RT-qPCR),对牦牛的7个不同组织包括心、肝、脾、肺、肾、背部肌肉及脂肪进行PID1基因表达水平的定量。结果表明,牦牛PID1基因的编码区长度是654 bp,编码217个氨基酸;通过同源性比对,结果发现,牦牛与野牦牛之间的亲缘关系最为接近,相似度达到100%;经过蛋白质分析发现,牦牛PID1蛋白的分子质量约为24.84 ku,理论等电点为6.30。根据不稳定系数计算结果显示,其不稳定性较高(47.96),属于一种不稳定蛋白质。该蛋白内含有1个N-糖基化位点和23个磷酸化位点,无信号肽和跨膜结构。RT-qPCR试验结果表明,在各个组织中都能检测到PID1基因的表达情况,其中在肺部表达量最高。该研究克隆了牦牛PID1基因,并对其蛋白结构进行了分析,同时还研究了该基因在牦牛组织中的表达情况。为进一步探究PID1基因在牦牛脂肪沉积过程中的作用提供了初步数据。

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