牦牛FABP4和FABP5基因克隆及生物信息和组织表达分析

张梦帆; 洛桑顿珠; 喇永福; 任稳稳; 马晓明; 张强; 卓玛次仁; 尼玛加措; 平措占堆; 梁春年; 《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2025 北大核心 CSCD

摘要：[目的]探究FABP4和FABP5基因对牦牛脂肪酸的调控机制,提升牦牛肉品质.[方法]采用RT-PCR扩增牦牛FABP4和FABP5基因CDS序列,利用在线软件进行生物信息学分析,使用MEGA7.0构建系统发育进化树分析其同源性.采用实时荧光定量PCR检测FABP4和FABP5基因在心脏、肝脏、肺脏、肾脏、脂肪、肌肉和十二指肠中的表达水平,探究其在不同组织中的表达差异.[结果]牦牛FABP4、FABP5基因CDS序列全长分别为393和408 bp,分别编码130和135个氨基酸,基于FABP4和FABP5氨基酸序列相似性构建的系统进化树均显示,牦牛与美洲野牛的亲缘关系最近,其次是牛,与鸡的亲缘关系较远.FABP4和FABP5蛋白二级结构、三级结构以无规则卷曲和延伸链为主,无跨膜结构域和信号肽,推测其不是分泌蛋白,为稳定的亲水性蛋白.牦牛FABP4、FABP5氨基酸序列分别存在16和17个磷酸化位点,均以苏氨酸磷酸化位点为主;牦牛FABP4和FABP5蛋白均与PPARG、GOT2间存在互作关系,且其相互间存在互作关系.KEGG富集结果发现,FABP4和FABP5共同富集在PPAR信号通路上.FABP4和FABP5基因在牦牛各组织中均有不同程度的表达,其中在脂肪中的相对表达量最高.[结论]克隆了牦牛FABP4和FABP5基因,明确了其分子特征.牦牛FABP4和FABP5基因在脂肪组织中高表达,与脂肪的沉积和代谢密切相关.

关键词： 牦牛 FABP4基因 FABP5基因 肉品质 脂肪沉积