科研产出
基于线粒体Cyt b基因和D-loop区序列的雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡遗传多样性分析
《生物资源 》 2024
摘要：对西藏雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡（Glyptosternum maculatum）种群遗传多样性的解析可为黑斑原鮡的保护和人工选育提供理论依据，以雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡种群为研究对象，通过对其线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cyt b)和控制区（D-loop区）基因序列进行扩增和测序，分析了黑斑原鮡的线粒体序列特征与其种群遗传多样性的关联。结果显示：黑斑原鮡Cyt b基因序列长度为1 138 bp,(A+T)含量（59.5%）高于（C+G）含量（40.5%）；检测到突变位点32个，其中单突变位点26个，简约信息位点6个；共检测到21个单倍型，其中单倍型Hap 1个体数最多，占总检测个体数的69.44%；种群单倍型多样性（Hd）为（0.509±0.050），核苷酸多样性（Pi）为（0.000 71±0.000 11）,Tajima’s D中性检验值为-2.532 91，中性检验结果显示（P<0.001）极显著负值。结果还显示：D-loop区基因序列长度为893bp,(A+T)含量（64.31%）高于（C+G）含量（35.69%）；共检测到突变位点35个，包括单突变位点21个，简约信息位点14个；检测到23个单倍型，Hd为（0.701±0.028）,Pi为（0.001 67±0.000 28），单倍型Hap 1和Hap 3的个体数较多，分别占45.14%和30.56%;D-loop基因Tajima’s D中性检验值为-2.366 38，中性检验结果显示（P<0.01）极显著负值，表明该群体经历过种群扩张。黑斑原鮡种群的Cyt b和D-loop区基因适合进行黑斑原鮡的种内遗传分析，且D-loop区基因更具有进化优势，其种群的遗传多样性较低，对黑斑原鮡遗传育种与保护具有一定的参考价值。
关键词： 雅鲁藏布江 黑斑原鮡 遗传多样性 细胞色素b基因 D-loop区
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西藏牦牛mtDNA cytb基因的序列多态性及其系统进化分析
《畜牧兽医学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：为从分子水平上探究西藏牦牛类群的亲缘关系、分类地位和遗传多样性,本研究测定了嘉黎牦牛、桑桑牦牛、桑日牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛、康布牦牛、江达牦牛、类乌齐牦牛、丁青牦牛、巴青牦牛等11个西藏牦牛类群共110头牦牛的细胞色素b基因全序列,分析了其多态性,并构建了11个类群的系统进化树。结果表明:11个西藏牦牛类群的细胞色素b基因全序列长均为1 140bp,共有单倍型53种,其中新发现的有49种,序列间共有14个SNPs多态位点,核苷酸变异类型包括转换和颠换,无插入和缺失,以同义突变为主,说明西藏牦牛具有较丰富的遗传多样性。西藏11个牦牛类群可分为:帕里牦牛系、江达牦牛系、巴青牦牛系、桑日牦牛系、类乌齐牦牛系等5大系。
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