科研产出
野血牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物多样性的比较分析
《黑龙江畜牧兽医 》 2024 北大核心
摘要：为了比较野血牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物组成的差异,试验选取年龄、体重相近且健康的野血牦牛和家养牦牛各 10 头(公母各半),分别为野血牦牛组和家养牦牛组,两组屠宰后采集瘤胃液,测定瘤胃发酵参数(氨态氮、尿素氮、总氮、微生物蛋白和挥发性脂肪酸),并基于细菌 16S rDNA基因序列比较分析两组瘤胃微生物组成的差异.结果表明:野血牦牛组瘤胃液中总氮含量、微生物蛋白质量浓度极显著高于家养牦牛组(P<0.01),氨态氮质量浓度、尿素氮浓度与家养牦牛组差异不显著(P>0.05);总挥发性脂肪酸浓度和正丁酸摩尔百分比极显著低于家养牦牛组(P<0.01),正戊酸摩尔百分比显著低于家养牦牛组(P<0.05),乙酸摩尔百分比极显著高于家养牦牛组(P<0.01),丙酸摩尔百分比显著高于家养牦牛组(P<0.05);异丁酸、异戊酸摩尔百分比及乙酸/丙酸与家养牦牛组差异不显著(P>0.05).两组瘤胃共有 1 963 个核心操作性分类单元(operational taxonomic units,OTUs),野血牦牛组和家养牦牛组特有的OTUs分别为 18 542 个和 16 514 个.在门水平上,两组的优势菌门均为拟杆菌门(Bacteroidete)和厚壁菌门(Firmicutes),二者占微生物总数的 98%以上.在属水平上,野血牦牛组瘤胃中的优势菌属(相对丰度>2%)包括普氏菌属1(Prevotella_1)、细菌F082(Bacterium F082)、理研菌科RC9 肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)、克里斯滕森菌科R-7 群(Christensenellaceae_R-7_group)、拟杆菌目BS11 肠道群(Bacteroidales_BS11_gut_group)和瘤胃球菌科NK4A214 群(Ruminococcaceae_NK4A214_group),相对丰度分别为 24.50%、14.68%、12.88%、6.50%、2.77%和 2.70%;家养牦牛组瘤胃中的优势菌属分别为理研菌科RC9 肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)、克里斯滕森菌科R-7 群(Christensenellaceae_R-7_group)、瘤胃球菌科 NK4A214(Ruminococcaceae_NK4A214_group)、琥珀酸菌(Succiniclasticum)、细菌 F082(Bacterium F082)和拟杆菌目 RF16 群(Bacteroidales_RF16_group),相对丰度分别为22.69%、13.87%、10.46%、6.93%、4.07%和 3.96%.在门水平上,野血牦牛组瘤胃中拟杆菌门(Bacteroidete)相对丰度显著高于家养牦牛组(P<0.05),厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、髌骨细菌门(Patescibacteria)、互养菌门(Synergistetes)和疣微菌门(Verrucomicrobia)相对丰度显著低于家养牦牛组(P<0.05).在属水平上,野血牦牛组瘤胃中普氏菌属 1(Prevotella_1)相对丰度极显著高于家养牦牛组(P<0.01),细菌F082(Bacterium F082)和拟杆菌目BS11 肠道群(Bacteroidales_BS11_gut_group)相对丰度显著高于家养牦牛组(P<0.05),克里斯滕森菌科 R-7 群(Christensenellaceae_R-7_group)、瘤胃球菌科 NK4A214 群(Ruminococcaceae_NK4A214_group)和琥珀酸菌(Succiniclasticum)相对丰度极显著低于家养牦牛组(P<0.01),理研菌科RC9 肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)相对丰度显著低于家养牦牛组(P<0.05).说明野血牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物多样性存在明显差异;野血牦牛瘤胃中拟杆菌门相对丰度更高,对非纤维植物多糖和蛋白质的消化能力更强;而家养牦牛瘤胃厚壁菌门相对丰度更高,对纤维类物质的消化能力更强.
关键词： 牦牛 野血牦牛 家养牦牛 瘤胃发酵参数 微生物多样性
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基于Illumina Miseq高通量测序技术探究藏茶发酵过程中微生物菌群变化
《茶叶通讯 》 2023
摘要：应用Illumina Miseq高通量测序技术，研究藏茶毛茶（MC）、发酵阶段（S1～S5）及成品茶（S6）中的微生物的多样性与群落结构，并从成品茶（S7）中分离纯化出三株优势曲霉进行鉴定。结果表明，在S1～S5阶段，真菌丰度和多样性先降低后增加，而细菌丰度和多样性先增加后减少；β多样性分析表明，S1～S5阶段藏茶中微生物组成趋于相近，而毛茶与成品茶均与S1～S5阶段有明显区分。优势真菌为子囊菌门曲霉属，经分离纯化鉴定为冠突曲霉、泡盛曲霉和米曲霉；细菌以变形杆菌、厚壁菌、放线菌和拟杆菌为优势菌，发酵全过程无稳定的优势细菌。
关键词： 藏茶 渥堆发酵 Illumina MiSeq技术 微生物多样性 曲霉属
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拉萨传统乳制品酥油的微生物多样性与开发前景研究
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究拉萨地区酥油中的主要微生物类群,为酥油的微生物质量安全提供重要数据基础。【方法】本文采用PCRDGGE分子生物学技术从拉萨市15份酥油样品中鉴别出62种细菌和18种真菌。【结果】酥油样品中的优势细菌种群主要为乳球菌属、假单胞菌属、链球菌属及乳杆菌属;优势真菌种群主要为酵母菌,其中44.4%为假丝酵母属、22.2%为亚罗酵母属、11.1%为毕赤酵母属。【结论】酥油中能够产生风味物质的微生物以乳酸菌和酵母菌为主,同时酥油微生物种群中还含有少量粪肠球菌等病原微生物。这些结果对酥油有益微生物资源的开发利用与质量安全防控提供了科学依据。
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菌肥对青稞根际土壤理化性质以及微生物群落的影响
《土壤学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：应用化学分析、聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术和DNA测序技术,研究了西藏棕色砂壤土中微生物肥料不同施用量和施用期对青稞根际土壤理化性质和细菌群落多样性的影响。结果表明,施用谷特菌肥能显著提高土壤全氮、全磷、全钾、有机质、碱解氮、有效磷和速效钾的水平,如播前施用菌肥浓度750 ml hm-2的处理较不施用菌肥的处理上述指标分别提高13.32%、28.42%、16.20%、9.81%、21.36%、39.35%和30.48%,拔节期施用菌肥浓度2 250 ml hm-2的处理较不施用菌肥的处理分别提高7.25%、29.35%、18.04%、12.86%、15.90%、43.27%和53.99%。DGGE分析表明,相同施用方式中不同施用量土样中微生物的DGGE图谱相似。非加权组平均法(UPGMA)聚类分析将DGGE图谱分为2大类群。Shannon-Wiener指数表明,施用菌肥的土壤细菌多样性先增加后逐渐降低,播前以喷施谷特菌浓度750 ml hm-2时的细菌多样性最高;拔节期则以喷施谷特菌浓度2 250 ml hm-2处理的细菌多样性最高,且两种施用方式土壤养分的释放与Shannon指数的变化规律均为播前﹥拔节期。测序结果表明,不同施肥浓度土样微生物种群分布较为广泛,其中Actinobacteria纲细菌种类略多,少数菌种为未经培养菌种(Uncultured bacterium)。典型对应分析(CCA)表明,DGGE图谱条带分布与土壤理化性质密切相关,碱解氮、全磷和全氮是影响微生物群落的主要环境因子。研究结果表明,施用谷特菌肥可明显改善青稞根际土壤理化性状,提高土壤细菌多样性。
关键词： 菌肥 根际土壤 理化指标 PCR-DGGE 微生物多样性
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