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牦牛RETN基因遗传多态性与生长性状相关性分析
《基因组学与应用生物学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在研究牦牛RETN基因的遗传多样性,选取麦洼粉嘴牦牛（30头）、麦洼黑嘴牦牛（48头）、斯布牦牛（36头）、类乌齐牦牛（47头）4个牦牛群体共161个个体。对RETN基因3个外显子区域及相邻区域进行扩增;利用DNA池测序与直接测序相结合的方法检测牦牛RETN基因的SNP位点;对SNP位点进行分析,并进一步分析其与生长性状的相关性。结果表明,在RETN基因第1外显子区域发现5个突变位点,即A1966G、G1967A、G1976T、G2021T、G2079C,5个位点间具有强连锁不平衡性;5个突变位点在麦洼牦牛、斯布牦牛中处于Hardy-Weinberg平衡状态（p>0.05）,在类乌齐牦牛群体中不符合平衡状态;5个多态位点均为低度多态性（PIC<0.25）。5个位点与生长性状相关性分析发现,AA型个体各生长性状数值均高于AG型个体其中5个突变位点与麦洼牦牛体斜长存在显著相关性（p<0.05）。说明RETN基因有丰富的遗传多态性,初步认定A1966G、G1967A、G1976T、G2021T、G2079C位点可以作为一种遗传标记,为选育优良牦牛品种提供依据。
关键词： 牦牛（Bos grunniens） RETN基因 生长性状 相关性分析
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牦牛RETN基因克隆及组织表达分析
《黑龙江畜牧兽医 》 2019 北大核心
摘要：为了克隆RETN基因,并对RETN基因在4.5岁牦牛不同组织器官中的相对表达差异进行分析,提取类乌齐牦牛心脏、肝脏、肺脏、脾脏、臀肌、臀脂、乳腺、大脑组织总RNA,克隆得到RETN基因cDNA片段428 bp,利用RT-qPCR技术检测RETN基因在不同组织器官中的相对表达情况。结果表明:RETN基因开放阅读框长度为330 bp,编码109个氨基酸,与黄牛亲缘关系最近(相似性为99.7%),与小鼠亲缘关系最远(相似性为66.1%);RETN蛋白的理化性质稳定,整条肽链呈亲水性,无信号肽,无跨膜区,主要在线粒体中发挥作用;该蛋白质主要由α-螺旋和无规则卷曲组成;RETN基因在牦牛心脏、肝脏、肺脏、脾脏、臀肌、臀脂、乳腺、大脑组织器官中均有不同程度的表达,在肺脏、脾脏、乳腺组织器官中的相对表达量极显著高于其他组织器官(P<0.01),在臀肌和大脑中的相对表达量较低。说明RETN基因可能在脾脏、肺脏和乳腺中具有调控作用。
关键词： 牦牛 RETN基因 基因克隆 生物信息学分析 组织表达
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