您好,欢迎访问西藏自治区农牧科学院 机构知识库!

西藏牦牛mtDNA ATP8全序列测定及遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨琴 1 ; 柴志欣 2 ; 姬秋梅 3 ; 张成福 3 ; 信金伟 3 ;

作者机构: 1.青海高原牦牛研究中心

2.西南民族大学动物遗传育种学国家民委教育部重点实验室

3.西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所

关键词: 西藏牦牛;线粒体DNA;58基因;遗传多样性

期刊名称: 河南农业大学学报

ISSN: 1000-2340

年卷期: 2015 年 49 卷 03 期

页码: 368-373+395

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对西藏16个牦牛类群共367头个体的mt DNA ATP8(Adenosine Triphosphate 8)基因进行克隆及序列分析。结果表明,西藏牦牛mt DNA ATP8基因全长201~203 bp,T、C、A和G 4种核苷酸的平均比例分别为29.3%、23.0%、41.8%和6.0%,A+T含量明显高于G+C,表现出一定的碱基偏倚性;在367头牦牛中,共检测到19个变异位点,其中单一信息位点15个,简约信息位点4个,存在转换和插入2种变异类型,碱基替换中存在转换73次,以A/G、T/C为主,占98.63%;在插入变异类型中以A碱基插入为主;367头牦牛共捡出20种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性指数分别为0.332和0.001 89,说明西藏牦牛具有较贫乏的遗传多样性;聚类分析显示,西藏牦牛可分为2类,其中桑日牦牛、类乌齐牦牛和桑日牦牛为1类,其余牦牛类群为另1类。20种单倍型可以分为2个聚类簇(I和Ⅱ),其中聚类簇I包含17种单倍型,占全部单倍型数的77.27%,包含了本次研究中的所有西藏牦牛类群;聚类簇Ⅱ中有3种单倍型,囊括了除错那、嘉黎、康布和帕里类群外的12个类群,显示西藏牦牛存在2个母系起源。

  • 相关文献

[1]西藏牦牛mtDNAcytb基因的序列多态性及其系统进化分析. 姬秋梅. 2013

[2]西藏牦牛mtDNA cytb基因的序列多态性及其系统进化分析. 姬秋梅,唐懿挺,张成福,柴志欣,赵上娟,信金伟,钟金城. 2012

[3]西藏牦牛遗传多样性的ISSR分析. 姚慧,钟金城,姬秋梅,张成福,信金伟,陈智华,柴志欣. 2015

[4]西藏牦牛mtDNA COⅢ序列测定及系统进化关系. 赵上娟,陈智华,姬秋梅,柴志欣,张成福,信金伟,钟金城. 2011

[5]西藏牦牛mtDNA D-loop区的遗传多样性及其遗传分化. 张成福,徐利娟,姬秋梅,信金伟,钟金城. 2012

[6]西藏牦牛mtDNA 16S rRNA基因的克隆及其遗传多样性分析. 武志娟,姬秋梅,张成福,信金伟,张强,钟金城. 2014

[7]西藏牦牛mtDNA-Cytb及ZFY基因遗传多样性与系统进化分析. 季文博,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟,钟金城. 2019

[8]基于mtDNA COⅠ基因的西藏牦牛遗传多样性及系统进化研究. 郭娇,信金伟,姬秋梅,张成福,柴志欣. 2014

[9]西藏牦牛微卫星DNA的遗传多样性. 李铎,柴志欣,姬秋梅,张成福,信金伟,钟金城. 2013

[10]西藏牦牛SRAP遗传多样性及分类进化研究. 赵上娟,钟金城,柴志欣,张成福,信金伟,陈智华. 2012

[11]西藏牦牛mtDNA ND5遗传多样性及系统进化分析. 海汀,张成福,信金伟,姬秋梅,柴志欣,曾贤彬,钟金城. 2014

[12]西藏牦牛mtDNA COⅢ全序列测定及系统进化关系. 赵上娟,陈智华,姬秋梅,柴志欣,张成福,信金伟,钟金城. 2011

[13]西藏牦牛mtDNA COⅡ基因序列特征及系统进化分析. 郭娇,钟金城,姬秋梅,信金伟,张成福,柴志欣. 2014

[14]西藏牦牛线粒体DNA的遗传多样性及系统进化分析. 宋乔乔,钟金城,张成福,信金伟,姬秋梅,柴志欣. 2014

[15]西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性及系统进化分析. 海汀,柴志欣,张成福,信金伟,姬秋梅,曾贤彬,钟金城. 2014

[16]基于mtDNA COX3基因对西藏特色牦牛群体遗传结构的分析. 者玉琦,武志娟,王吉坤,钟金城,柴志欣,信金伟. 2023

[17]西藏特色牦牛mtDNA ND1遗传多样性及系统进化分析. . 2023

[18]西藏牦牛群体遗传多样性及遗传结构分析. . 2024

[19]西藏牦牛SRAP遗传多样性及分类进化研究. 赵上娟,钟金城. 2011

[20]西藏牦牛mtDNA 12SrRNA基因全序列测定及系统进化分析. 姜雪鸥,姬秋梅,张成福,信金伟,张强,钟金城. 2012

作者其他论文 更多>>