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基于线粒体cox2基因的细粒棘球绦虫RPA-CRISPR/Cas12a检测方法的建立

文献类型: 中文期刊

作者: 周愉乐 1 ; 唐文强 2 ; 李鑫 3 ; 石斌 2 ; 赵霞玲 2 ; 马艳 4 ; 炊文婷 5 ; 黄福强 1 ;

作者机构: 1.佛山大学动物科技学院

2.西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所

3.南京农业大学动物医学院

4.果洛动物疫病预防控制中心

5.青海省动物疫病预防控制中心

关键词: 细粒棘球绦虫;核酸扩增检测;重组酶聚合酶扩增技术;CRISPR/Cas12a;crRNA;cox2基因

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2025 年 47 卷 006 期

页码: 606-613

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为建立灵敏、特异的细粒棘球绦虫即时核酸检测方法,本研究结合重组酶聚合酶扩增技术(RPA)和CRISPR/Cas12a系统,以细粒棘球绦虫线粒体细胞色素c氧化酶亚基2(cox2)基因为靶标,设计5条RPA正向引物和5条反向引物,并根据确定的原间隔相邻基序(PAM)设计合成7条CRISPR RNA(crRNA:cox2-1/2/3/4/5/6/7),初步建立了细粒棘球绦虫RPA-CRISPR/Cas12a单管检测方法,并通过荧光结果筛选出最佳RPA扩增引物及最佳crRNA。利用建立的方法分别检测细粒棘球绦虫、多房棘球绦虫、带状泡尾绦虫、贝氏莫尼茨绦虫、犬复孔绦虫、犬弓首蛔虫和肝片吸虫共7种寄生虫DNA,评估该方法的特异性,结果显示,该方法仅可特异性检测细粒棘球绦虫DNA,其他寄生虫DNA检测结果均为阴性,且可在20 min内得到检测结果;将重组质粒标准品稀释至1 000拷贝/μL、500拷贝/μL、100拷贝/μL、50拷贝/μL、10拷贝/μL、1拷贝/μL,分别作为模板经建立的方法检测,结果显示,该方法对重组质粒标准品的检测限可达50拷贝/μL;以检测限浓度的质粒标准品为模板,采用所建立的方法于不同时间检测,每次做两组平行对照,共做3次,评估该方法的重复性,结果显示,6组试验的荧光值差异较小。表明本研究建立的方法特异性强、敏感性高、重复性好。利用该方法对62份临床犬粪便样品检测,结果显示细粒棘球绦虫的阳性率约为0.16%(1/62),与qPCR的检测结果相符。本研究建立了RPA-CRISPR/Cas12a单管检测方法,并对次优PAM和次优结构的crRNA进行了优化,该方法可在短时间内完成特异、灵敏地检测,有望成为细粒棘球绦虫终末宿主现场筛查的新型替代检测工具。

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