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西藏光核桃SRAP-PCR反应体系的优化和引物筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 谭江平 1 ; 曾秀丽 2 ; 廖明安 1 ; 邱利娜 1 ; 王玉霞 2 ; 次仁卓嘎 2 ;

作者机构: 1.四川农业大学园艺学院

2.西藏自治区农牧科学院

关键词: 光核桃;SRAP;正交设计;体系优化;引物筛选

期刊名称: 北方园艺

ISSN: 1001-0009

年卷期: 2011 年 02 期

页码: 139-143

收录情况: 北大核心

摘要: 以西藏12份光核桃种质为试材,采用正交设计,从dNTPs、Mg~(2+)、引物、模板DNA和Taq DNA聚合酶5种因素5个水平来优化SRAP-PCR反应体系,并对引物进行了筛选。结果表明:光核桃25μL的SRAP反应体系的最佳组分包括2.5μL 10×buffer,0.35 mmol/L dNTPs,1.5 mmol/L Mg~(2+),0.4μmol/L引物,20 ng模板DNA和2.5 U Taq DNA聚合酶。各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以dNTPs浓度影响最大,模板DNA的影响最小。应用该体系从40个引物组合中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物组合23个。这一体系的建立及多态性引物组合的筛选为利用SRAP标记技术进行光核桃遗传多样性研究提供了依据。

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