文献类型： 中文期刊

作者： 郭梁 ¹ ; 王吉坤 ¹ ; 王会 ¹ ; 柴志欣 ¹ ; 信金伟 ¹ ; 姬秋梅 ¹ ; 钟金城 ¹ ;

作者机构： 1.西南民族大学青藏高原研究院青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室四川省重点实验室;西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

关键词： 牦牛;SMPX基因;克隆;生物信息学;组织表达

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2019 年 05 期

页码： 1273-1282

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究旨在克隆牦牛X染色体相关小肌肉蛋白(small muscle protein X-link,SMPX)基因的CDS区序列,分析该序列所编码蛋白的结构与功能,并检测SMPX基因在牦牛不同组织中的表达情况。运用RT-PCR技术扩增并克隆SMPX基因CDS区序列,分析其氨基酸序列相似性并构建系统进化树;通过在线软件对其理化性质、二级结构和三级结构进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR方法检测SMPX基因在牦牛右心室、臀大肌、肺脏和大脑4个组织中的表达情况。结果表明,牦牛SMPX基因CDS区全长515 bp,开放阅读框(ORF)长261 bp,编码86个氨基酸。牦牛SMPX氨基酸序列与野牦牛、水牛、家犬、人、白尾鹿德克萨斯亚种、绵羊、黑猩猩、藏羚羊、野猪的相似性分别为100%、97.7%、96.5%、96.5%、95.3%、95.3%、96.5%、94.2%和91.9%,说明其在不同物种间具有较高的保守性。生物信息学分析发现,SMPX蛋白是一种不稳定的亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主,为膜内蛋白,无信号肽和跨膜蛋白;SMPX氨基酸序列共有4个磷酸化位点。亚细胞定位结果表明,SMPX蛋白的分布于细胞核(52.2%)、线粒体(43.5%)和细胞质(4.3%)。实时荧光定量PCR检测结果显示,SMPX基因在牦牛右心室中表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05)。本试验结果为深入研究SMPX基因在牦牛中的生理功能和调控机制提供了参考数据。