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大花黄牡丹遗传多样性的SRAP分析

文献类型: 中文期刊

作者: 唐琴 1 ; 曾秀丽 2 ; 廖明安 1 ; 潘光堂 3 ; 扎西 2 ; 龚君华 2 ; 次仁卓嘎 2 ;

作者机构: 1.四川农业大学园艺学院

2.西藏自治区农牧科学院蔬菜研究所

3.四川农业大学玉米研究所

关键词: 大花黄牡丹;SRAP;居群;遗传多样性;遗传分化

期刊名称: 林业科学

ISSN: 1001-7488

年卷期: 2012 年 48 卷 01 期

页码: 73-79

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 应用SRAP标记对西藏特有植物大花黄牡丹的遗传多样性进行研究。用16对引物从5个自然居群79个单株中共检测到396个有效位点,其中多态性位点357个。在物种水平上,多态位点百分率(Ppl)为90.15%,Shannon表型多样性指数(Ηsp)平均为0.2521;居群水平上的Ppl为31.82%,Shannon表型多样性指数(Ho)为0.0694~0.3428,平均值(Ηpop)为0.1307。上述遗传参数表明,大花黄牡丹具有丰富的物种遗传多样性,5个居群中自然居群C的遗传多样性最高(Ppl=82.32%,Ho=0.3428)。据AMOVA分析结果,总的变异中有41.58%的变异存在于居群间,58.42%的变异存在于居群内,居群分化较显著(ΦST=0.4158,P<0.001),由POPGENE1.32得到的居群间遗传分化系数GST(0.4309)和Shannon表型多样性指数计算的居群间遗传多样性所占比例(0.4816)也表明了类似的遗传结构。Mantel检测表明地理距离和Nei's遗传距离间相关不显著(P>0.05)。利用NTSYSPC(2.1)软件构建大花黄牡丹5个居群79个个体的UPGMA聚类图,遗传相似系数变幅在0.47~0.99,大多数居群内的个体表现出较为密切的亲缘关系(如居群B,D,E),但也有一些居群的个体未聚在一起(如居群C)。依据大花黄牡丹居群遗传变异特点,初步探讨其保护和利用策略。

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