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DNA条形码在西藏水系裂腹鱼亚科鱼类鉴定中的研究

文献类型： 中文期刊

作者： 张驰 1 ; 刘海平 1 ; 马波 2 ; 王万良 1 ; 曾本和 1 ; 牟振波 1 ;

作者机构： 1.西藏自治区农牧科学院水产科学研究所

2.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词： 西藏;裂腹鱼;DNA条形码;COI;物种鉴定

期刊名称： 淡水渔业

ISSN： 1000-6907

年卷期： 2019 年 49 卷 001 期

页码： 33-41

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为确定DNA条形码技术在西藏水系裂腹鱼亚科(Schizothoracinae)物种鉴定中的可行性,利用西藏水系所采集260尾裂腹鱼亚科样本,测定其线粒体细胞色素C氧化酶亚基1(COI)基因片段序列,计算遗传距离,构建系统发育树,并与GenBank中相关序列进行比对.260个样本经检测均获得有效COI基因扩增片段,COI基因碱基组成偏倚明显,A+T含量为54.74%,显著高于G+C含量(45.26%).基于Kimura双参数模型计算遗传距离,遗传距离阈值设置为0.02时,260个样本可被鉴定到种的为249尾样本,11尾由于样本量少,数据库中存在多个命名,只鉴定到属,其中与形态学鉴定一致的179尾样本,一致率为68.8%,裂腹鱼亚科裸鲤属(Gymno-cypris)不能通过COI基因鉴定到种,拉萨裂腹鱼(Schizothoracinae)、 异齿裂腹鱼(S.schizothorax o'connori)、 巨须裂腹鱼(S.macropogon)3个种之间的遗传距离阈值以0.02不能有效鉴别,而遗传距离阈值以0.01作为这3个种的鉴定标准,可达到有效鉴别的目的.基于邻接法构建系统发育树,裂腹鱼亚科鱼类形成一个支持率较高的单系群,Bootstrap检验支持率为99%,系统进化树聚类方式与以遗传距离值为标准的鉴定结果一致,很好地反映了水系物种间的地理和历史联系.

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