文献类型： 中文期刊
作者： 曾兴权 1 ; 原红军 1 ; 杨春葆 1 ; 于明寨 1 ; 徐齐君 1 ; 王玉林 1 ; 扎桑 1 ; 尼玛扎西 1 ;
作者机构： 1.省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室;西藏自治区农牧科学院农业研究所;西藏自治区农牧科学院
关键词： 青稞;干旱胁迫;全基因组;可变剪切分析
期刊名称： 西藏农业科技
ISSN： 1005-2925
年卷期： 2019 年 01 期
页码： 1-5
摘要： 为阐明青稞在旱胁迫下基因发生可变剪切的规律,本研究以抗旱的"喜拉16号"和旱敏感的"迪庆黑元桂"为试验材料,分别对对照和21%PEG浓度下处理的样本进行多时间点的全转录组测序。结果表明,利用Leaf Cutter软件在所有的样品中共检测到了22 181个可变剪切事件;通过PCA分析发现,可变剪切具有明显的品种间特异性;另外,通过与抗旱基因数据库比对分析发现,在干旱胁迫处理下2个类型品种间有多个抗旱相关的基因发生了显著的差异可变剪切,分别是HVUL1H16429 (AtrbohF)、HVUL1H12808 (HAB1)、HVUL4H58649 (ABF4)、HVUL4H35985 (AtrbohD)、HVUL7H07799 (LOS5)、HVUL3H43774 (CLCc)、HVUL3H23631(ABCG40)、HVUL1H16840(MYB60)和HVUL6H08236(AREB1);对2个品种各自在对照与旱胁迫条件下的差异可变剪切基因进行pathway分析,发现了抗旱品种的差异可变剪切基因参与了更多的pathway,并且鉴别出Fatty acid degradation、Inositol phosphate metabolism、alpha-Linolenic acid metabolism和Fatty acid metabolism这4条通路显著富集。为解析青稞抗旱分子机理与培育青稞抗旱新品种奠定了理论基础。
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