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西藏青稞品种喜马拉雅8号低温处理的SSH-cDNA文库构建及分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王玉林 1 ; 徐齐君 2 ; 原红军 2 ; 曾兴权 2 ; 尼玛扎西 3 ;

作者机构: 1.西藏自治区农牧科学院农业研究所/省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

2.;西藏自治区农牧科学院农业研究所/省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

3.;西藏自治区农牧科学院农业研究所/省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室;

关键词: 青稞;抑制差减杂交(SSH);低温处理;EST

期刊名称: 麦类作物学报

ISSN: 1009-1041

年卷期: 2017 年 08 期

页码: 1025-1030

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为进一步研究青稞低温抗性相关基因,以喜马拉雅8号为材料,通过抑制差减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)的方法,构建青稞低温环境下的cDNA文库,并通过nr及KEGG数据库对筛选得到的高质量EST序列进行功能注释。结果发现,对随机挑选的281个阳性克隆进行测序,获得209条高质量ESTs序列,其中有117条序列能够在GenBank库中比对到同源性较高的基因或蛋白。对上述117条序列进行GO功能注释及KEGG代谢路径分析,发现其涉及到植物的基础物质、能量代谢、光合作用、信号转导等方面,说明这些基因可能参与了青稞对低温的抗性反应。

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