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牦牛miR-378前体克隆及组织表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 纪会 1 ; 王会 1 ; 柴志欣 1 ; 王吉坤 1 ; 罗晓林 1 ; 姬秋梅 1 ; 信金伟 1 ; 钟金城 1 ;

作者机构: 1.西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室;四川省草原科学研究院;西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

关键词: 牦牛;miR-378;克隆;组织表达;生物信息分析

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2019 年 01 期

页码: 58-66

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 旨在克隆牦牛miR-378的前体序列,阐明其组织表达规律,结合bta-miR-378靶基因的生物信息学预测和分析,探讨miR-378在牦牛生长发育过程中的调控功能。采用PCR方法成功克隆类乌齐牦牛miR-378前体序列,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测miR-378-3p在各组织中的表达模式,结合生物信息学软件TargetScan、DAVID以及数据库NCBI、miRbase等对miR-378进行保守性分析、靶基因预测及其生物学功能分析。结果表明,miR-378在各物种间高度保守,且miR-378-3p在各组织中广泛表达,其中在臀大肌中表达水平最高,显著高于其他组织(P<0.01),在臀脂中的表达高于卵巢、大脑、乳腺和肝脏。获得的272个靶基因主要参与细胞分化、细胞发育、大分子代谢等多个生物学过程,涉及孕酮介导的卵母细胞成熟、促性腺激素释放激素(GnRH)信号通路等,由此推测,miR-378可能在卵泡发育、卵母细胞成熟过程中起关键作用,进而影响母牦牛的繁殖性能。

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