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西藏青稞根际土壤可培养放线菌的遗传多样性及其促生功能分析

文献类型: 中文期刊

作者: 高雪 1 ; 辜运富 1 ; 尼玛扎西 1 ; 刘国一 1 ; 刘婷 1 ; 刘怡 1 ; 普布贵吉 1 ;

作者机构: 1.省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传国家重点实验室/西藏自治区农牧科学院农业资源与环境研究所;四川农业大学资源学院

关键词: 青稞根际;放线菌;多样性;功能分析

期刊名称: 四川农业大学学报

ISSN: 1000-2650

年卷期: 2019 年 06 期

页码: 777-784

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】认识藏区青稞根际土壤中可培养放线菌的遗传多样性及应用价值。【方法】采集藏区青稞根际土壤,对根际样品中的放线菌进行分离,测定分离菌株的溶磷能力、抗病促生(IAA产量)能力,并运用反转录重复因子扩增(BOXA1RPCR)技术、16S r RNA基因测序和系统发育分析系统分析可培养放线菌的系统发育地位。【结果】通过7种培养基共分离得129株放线菌菌株,其中有51株菌株(占总分离菌株的39.5%)产IAA,8株产量较高(>57 mg/L),77株(占总分离菌株的60.0%)表现出溶磷活性。基于BOXA1R-PCR图谱,采用平均连锁聚类法(UPGMA)进行聚类分析,129株菌被分成19种不同的遗传图谱类型。基于分离菌株的菌落特征和遗传聚类图谱选取32株代表菌株进行16S rRNA基因序列测定。通过Mothur软件对分离菌株进行OTUs(operational taxonomic units)聚类分析,共得到5个OTU分类单元,其中以OTU1为主。系统发育显示代表菌株分属于链霉菌属(Streptomyces),拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis),类诺卡氏菌属(Nocardioides),小单孢菌属(Micromonospora),放线菌属(Actinomyces)等5个属,其中链霉菌属(Streptomyces)为优势种属。【结论】西藏青稞根际土中放线菌多样性明显,这些放线菌中蕴藏着大量的有开发应用前景的菌株。

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