类乌齐牦牛SIRT3基因克隆与生物信息学及差异表达分析

杨玉梅; 柴志欣; 王会; 王吉坤; 信金伟; 姬秋梅; 钟金城; 《中国畜牧杂志 》 2019 北大核心

摘要：本实验旨在丰富牦牛SIRT3基因的基础研究,通过对西藏类乌齐牦牛SIRT3基因克隆、生物信息学分析及差异表达分析,进一步探讨SIRT3基因的生理功能及分子机制。结果表明:类乌齐牦牛SIRT3基因CDS区长1002bp,编码333个氨基酸,与普通牛SIRT3基因CDS区比对存在碱基突变,编码氨基酸发生错义和同义突变,同义突变发生在碱基第49、279、342、384位,错义突变发生在碱基第149和620位,其编码蛋白属亲水性蛋白,有多个跨膜区域和磷酸化位点,无信号肽片段,主要位于线粒体,二级结构以无规卷曲和α-螺旋为主;SIRT3基因编码蛋白在催化活性、核苷酸结合及辅因子结合等过程发挥主要功能,主要参与生物体代谢过程;类乌齐牦牛SIRT3基因序列与普通牛一致性较高,亲缘关系最近;QPCR分析显示,SIRT3基因在牦牛肝脏中的表达水平极显著高于其他组织(P<0.01)。

关键词： 类乌齐牦牛 SIRT3基因 克隆 生物信息学分析 组织表达