牦牛ALDH9A1基因及启动子克隆、生物学特征及表达分析

杨勤; 柴志欣; 王会; 王吉坤; 信金伟; 张成福; 钟金城; 《基因组学与应用生物学 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：本研究旨在扩增牦牛醛脱氢酶9A1基因的启动子区及编码区全长,检测醛脱氢酶9A1基因在类乌齐牦牛、麦洼牦牛不同组织中mRNA水平的表达规律。本研究采用PCR方法扩增并克隆牦牛ALDH9A1基因CDS区及启动子区通过生物信息学分析软件分析其理化性质、二、三级结构;分析核苷酸序列及氨基酸序列一致性并构建氨基酸序列系统发生树;应用qRT-PCR技术检测ALDH9A1基因在牦牛不同组织中的表达模式。结果显示,牦牛ALDH9A1基因编码区全长1 485 bp,共编码494个氨基酸启动子区全长1 034 bp。生物信息学分析发现,牦牛ALDH9A1基因编码的蛋白质是一种结构较稳定、带负电弱亲水性蛋白;同源性分析表明,牦牛与黄牛ALDH9A1基因的核苷酸及氨基酸同源性均较高;系统进化树分析显示,牦牛与黄牛亲缘关系最近绵羊次之;实时荧光定量PCR结果显示ALDH9A1基因在牦牛多个组织均有表达,其中肝脏表达量最高且显著高于其他组织（p<0.05）,肾脏和臀大肌次之。本研究为进一步研究和分析ALDH9A1基因在调控牦牛肌内脂肪沉积及机制等方面提供基础数据。

关键词： 牦牛 ALDH9A1基因 生物学特征