基于分子动力学模拟的青稞直链淀粉-肉桂醛复合物形成机制研究

张一帆; 张天宇; 吴雪莲; 刘振东; 李梁; 《粮食与油脂 》 2023 北大核心

摘要：采用分子动力学模拟技术对青稞直链淀粉-肉桂醛复合物复合前后的构象进行模拟，并对青稞直链淀粉及其复合物的均方根偏差、旋转半径、氢键数、相互作用势能、溶剂可及表面积变化差异进行比较分析；采用主成分分析法（PCA）绘制青稞直链淀粉-肉桂醛体系不同构象的自由能曲面图，并得出该复合物的结构。结果表明：在复合物形成过程中，青稞直链淀粉与肉桂醛间氢键个数在60 ns时最多，复合物旋转半径在30 ns时达到最大；与青稞直链淀粉相比，青稞直链淀粉-肉桂醛复合物中的范德华势能明显高于自身的氢键势能，均方根偏差更大，且溶剂可及表面积下降幅度大；青稞直链淀粉-肉桂醛复合物的自由能最低区域显示青稞直链淀粉分子和肉桂醛分子分别由各自独立状态复合为整体球状包合物；青稞直链淀粉与肉桂醛复合物结构是由2条淀粉链将肉桂醛分子紧密包裹形成的1个稳定球状结构。

关键词： 分子动力学 青稞直链淀粉 肉桂醛 复合物