科研产出
牦牛MPC1和MPC2基因克隆及其组织表达特征分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]明确牦牛线粒体丙酮酸载体编码基因(MPC1和MPC2)的分子生物学特性及其组织表达特征,为揭示MPC基因在牦牛适应高原环境和能量代谢中的作用机制提供理论依据.[方法]选取麦洼牦牛为研究对象,PCR扩增牦牛MPC1和MPC2基因编码区(CDS)序列,利用在线生物信息学分析软件预测其蛋白结构及理化性质,并以实时荧光定量PCR检测MPC1和MPC2基因在不同年龄(0.5、1.5和2.5岁)牦牛各组织中的表达情况.[结果]牦牛MPC1基因CDS序列长330 bp,共编码109个氨基酸残基;MPC2基因CDS序列长384 bp,共编码127个氨基酸残基.基于MPC1和MPC2基因CDS序列相似性构建的系统发育进化树显示,牦牛分别与黄牛和水牛的亲缘关系最近,与绵羊的亲缘关系最远.牦牛MPC1和MPC2蛋白均为稳定的亲水性蛋白,主要由丙氨酸和亮氨酸组成,有跨膜结构但无信号肽,均存在1个MPC结构域;其二级结构以α-螺旋为主(分别占57.80%和55.12%),三级结构模型为5xpd.1.A.MPC1和MPC2基因在2.5、1.5和0.5岁牦牛脾脏中的相对表达量均最低,其次是肾脏和肝脏,而在心脏中的相对表达量最高;MPC1和MPC2基因在不同年龄段牦牛各组织中的表达趋势不一致,可能与基因表达的组织特异性及二者在牦牛不同生长发育阶段发挥的作用不同有关.[结论]MPC1和MPC2基因在反刍动物间具有高度的保守性,其表达存在组织特异性和时序性,尤其在心脏中高表达,且编码蛋白中富含丙氨酸和亮氨酸,说明MPC1和MPC2基因在牦牛改善肉品质及适应高原环境的过程中扮演着重要角色,但二者在牦牛不同生长发育阶段发挥的作用有所差异.
关键词： 牦牛 线粒体丙酮酸载体(MPC) MPC1基因 MPC2基因 组织表达特征 高原环境
全文链接
请求原文
色瓦绵羊RPL8基因的组织表达特征及生物信息学分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究色瓦绵羊核糖体蛋白L8基因（RPL8）在各组织部位的表达特征及其潜在功能作用，揭示RPL8基因调控色瓦绵羊产奶质量的分子作用机制，为推进色瓦绵羊的分子遗传育种提供理论依据。【方法】PCR扩增色瓦绵羊RPL8基因，通过ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0等在线软件分析RPL8基因结构特征及潜在功能，并以实时荧光定量PCR检测其在色瓦绵羊各组织中的表达分布情况。【结果】RPL8基因在色瓦绵羊乳腺、肌肉、心脏、肾脏、脾脏、肝脏、小肠、瘤胃和卵巢等9个组织中均有表达，在小肠、乳腺和卵巢中的相对表达量极显著高于其他组织中的相对表达量（P＜0.01）。色瓦绵羊RPL8基因编码区（CDS）序列长774 bp，共编码257个氨基酸残基；基于RPL8基因核苷酸序列相似性构建的系统发育进化树显示，色瓦绵羊与山羊、牦牛、牛等反刍物种的亲缘关系较近。色瓦绵羊RPL8蛋白相对分子量为28024.66Da，理论等电点（pI）为11.04，是一种稳定的碱性亲水性蛋白，不具有跨膜结构，主要定位于细胞质（占78.3%）；色瓦绵羊RPL8蛋白存在15个磷酸化位点[7个丝氨酸（S）位点，8个苏氨酸（T）位点]，其二、三级结构中均以无规则卷曲为主。色瓦绵羊RPL8蛋白的互作蛋白均为核糖体蛋白，其同源性高达99.90%，其中，RPS5、RPS16、RPL11、RPS3、RPS18和RPS11属于通用核糖体蛋白家族，RPL13属于真核核糖体蛋白家族。【结论】色瓦绵羊RPL8是一种胞内稳定的碱性亲水性蛋白，具有核糖体蛋白的基本结构特征。RPL8基因在色瓦绵羊各组织中的表达具有普遍性，尤其在乳腺和卵巢中呈高表达，说明RPL8基因除了发挥其家族基本功能作用外，在色瓦绵羊乳腺和卵巢组织中可能还影响乳脂含量与卵泡的周期性发育。
关键词： 色瓦绵羊 核糖体蛋白 RPL8基因 乳腺 卵巢 组织表达特征
全文链接
请求原文
首页上一页1下一页尾页
